Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G112566.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RI59
Pfam -
Panther DB PTHR33063
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g27610.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G090400 - -
2 Sobic.002G215200 lung seven transmembrane domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G253500 auxin-independent growth promoter protein, putative, expressed -
4 Sobic.008G059900 2-oxo acid dehydrogenases acyltransferase domain containing protein, expressed K00627: DLAT, aceF, pyruvate dehydrogenase E2 component (dihydrolipoamide acetyltransferase)
5 Sobic.004G135500 - -
6 Sobic.002G388600 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G289800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
8 Sobic.003G415600 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
9 Sobic.008G090300 - -
10 Sobic.003G078300 leucine-rich repeat protein-related, putative, expressed -
11 Sobic.004G270800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@WD repeat-containing protein, putative, expressed K03363: cell division cycle 20, cofactor of APC complex
12 Sobic.008G007000 HIT zinc finger domain containing protein, expressed K11663: ZNHIT1, zinc finger HIT domain-containing protein 1
13 Sobic.003G389100 formin-like protein 1 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.009G013000 rp3 protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G390800 lipase, putative, expressed -
16 Sobic.003G006900 microtubule associated protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G257000 two-component response regulator, putative, expressed -
18 Sobic.006G257200 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G242500 - -
20 Sobic.009G188900 acyltransferase, putative, expressed K13513: LCLAT1, lysocardiolipin and lysophospholipid acyltransferase


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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