Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G090400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PCI9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G123600 expressed protein -
2 Sobic.002G095300 deoxynucleoside kinase family, putative, expressed K00893: deoxycitidine kinase
3 Sobic.010G087100 MCM9 - Putative minichromosome maintenance MCM family subunit 9, expressed K10738: DNA helicase MCM9
4 Sobic.008G118100 kelch repeat protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G127200 kelch repeat protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G187600 expressed protein -
7 Sobic.003G331000 exostosin family domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G242500 - -
9 Sobic.004G306100 expressed protein -
10 Sobic.003G102700 exostosin family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G199500 heat shock protein DnaJ, putative, expressed K09531: DnaJ homolog subfamily C member 11
12 Sobic.006G126800 expressed protein K10730: ATP-dependent DNA helicase Q4
13 Sobic.003G028400 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.008G090300 - -
15 Sobic.010G257500 expressed protein -
16 Sobic.005G068800 TOPBP1A - Similar to DNA replication protein TOPBP1 from, expressed K10728: topoisomerase (DNA) II binding protein 1
17 Sobic.002G021200 expressed protein K19001: HELLS, ATP-dependent DNA helicase
18 Sobic.008G059900 2-oxo acid dehydrogenases acyltransferase domain containing protein, expressed K00627: DLAT, aceF, pyruvate dehydrogenase E2 component (dihydrolipoamide acetyltransferase)
19 Sobic.004G129500 expressed protein -
20 Sobic.003G397100 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G090400 Sobic008G090400 Sobic002G123600 Sobic002G123600 Sobic008G090400--Sobic002G123600 Sobic002G095300 Sobic002G095300 Sobic008G090400--Sobic002G095300 Sobic010G087100 Sobic010G087100 Sobic008G090400--Sobic010G087100 Sobic008G118100 Sobic008G118100 Sobic008G090400--Sobic008G118100 Sobic006G127200 Sobic006G127200 Sobic008G090400--Sobic006G127200 Sobic002G187600 Sobic002G187600 Sobic008G090400--Sobic002G187600 Sobic003G331000 Sobic003G331000 Sobic008G090400--Sobic003G331000 Sobic001G242500 Sobic001G242500 Sobic008G090400--Sobic001G242500 Sobic004G306100 Sobic004G306100 Sobic008G090400--Sobic004G306100 Sobic002G123600--Sobic006G127200 Sobic002G123600--Sobic008G090400 Sobic002G123600--Sobic004G306100 Sobic002G123600--Sobic002G095300 Sobic002G271400 Sobic002G271400 Sobic002G123600--Sobic002G271400 Sobic003G397100 Sobic003G397100 Sobic002G123600--Sobic003G397100 Sobic001G242300 Sobic001G242300 Sobic002G123600--Sobic001G242300 Sobic003G411700 Sobic003G411700 Sobic002G123600--Sobic003G411700 Sobic004G129500 Sobic004G129500 Sobic002G123600--Sobic004G129500 Sobic002G095300--Sobic002G187600 Sobic002G095300--Sobic010G087100 Sobic002G021200 Sobic002G021200 Sobic002G095300--Sobic002G021200 Sobic002G095300--Sobic002G123600 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic002G095300--Sobic007G187700 Sobic002G095300--Sobic008G118100 Sobic002G095300--Sobic008G090400 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic002G095300--Sobic002G168000 Sobic006G126800 Sobic006G126800 Sobic002G095300--Sobic006G126800 Sobic010G087100--Sobic002G095300 Sobic003G379900 Sobic003G379900 Sobic010G087100--Sobic003G379900 Sobic001G506300 Sobic001G506300 Sobic010G087100--Sobic001G506300 Sobic002G131100 Sobic002G131100 Sobic010G087100--Sobic002G131100 Sobic010G087100--Sobic008G090400 Sobic010G087100--Sobic008G118100 Sobic002G238800 Sobic002G238800 Sobic010G087100--Sobic002G238800 Sobic008G160600 Sobic008G160600 Sobic010G087100--Sobic008G160600 Sobic009G002200 Sobic009G002200 Sobic010G087100--Sobic009G002200 Sobic007G050800 Sobic007G050800 Sobic008G118100--Sobic007G050800 Sobic008G118100--Sobic002G187600 Sobic004G286200 Sobic004G286200 Sobic008G118100--Sobic004G286200 Sobic006G281900 Sobic006G281900 Sobic008G118100--Sobic006G281900 Sobic009G225500 Sobic009G225500 Sobic008G118100--Sobic009G225500 Sobic008G118100--Sobic002G095300 Sobic008G118100--Sobic009G002200 Sobic008G118100--Sobic008G090400 Sobic005G157300 Sobic005G157300 Sobic008G118100--Sobic005G157300 Sobic006G127200--Sobic004G306100 Sobic006G127200--Sobic002G271400 Sobic010G257500 Sobic010G257500 Sobic006G127200--Sobic010G257500 Sobic006G127200--Sobic002G123600 Sobic003G409600 Sobic003G409600 Sobic006G127200--Sobic003G409600 Sobic003G226700 Sobic003G226700 Sobic006G127200--Sobic003G226700 Sobic009G081800 Sobic009G081800 Sobic006G127200--Sobic009G081800 Sobic010G103500 Sobic010G103500 Sobic006G127200--Sobic010G103500 Sobic001G025900 Sobic001G025900 Sobic006G127200--Sobic001G025900 Sobic002G187600--Sobic002G095300 Sobic002G187600--Sobic008G118100 Sobic002G187600--Sobic007G050800 Sobic003G102700 Sobic003G102700 Sobic002G187600--Sobic003G102700 Sobic002G187600--Sobic004G286200 Sobic002G187600--Sobic008G090400 Sobic002G187600--Sobic007G187700 Sobic001G199500 Sobic001G199500 Sobic002G187600--Sobic001G199500 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic002G187600--Sobic003G290400 Sobic003G259600 Sobic003G259600 Sobic003G331000--Sobic003G259600 Sobic009G122900 Sobic009G122900 Sobic003G331000--Sobic009G122900 Sobic003G028400 Sobic003G028400 Sobic003G331000--Sobic003G028400 Sobic003G331000--Sobic002G123600 Sobic001G123600 Sobic001G123600 Sobic003G331000--Sobic001G123600 Sobic003G331000--Sobic001G242300 Sobic005G160200 Sobic005G160200 Sobic003G331000--Sobic005G160200 Sobic003G298900 Sobic003G298900 Sobic003G331000--Sobic003G298900 Sobic003G360300 Sobic003G360300 Sobic003G331000--Sobic003G360300 Sobic001G242500--Sobic008G118100 Sobic003G188600 Sobic003G188600 Sobic001G242500--Sobic003G188600 Sobic001G242500--Sobic008G090400 Sobic001G242500--Sobic010G087100 Sobic001G242500--Sobic006G281900 Sobic002G317700 Sobic002G317700 Sobic001G242500--Sobic002G317700 Sobic004G190500 Sobic004G190500 Sobic001G242500--Sobic004G190500 Sobic001G242500--Sobic007G187700 Sobic001G377700 Sobic001G377700 Sobic001G242500--Sobic001G377700 Sobic004G306100--Sobic002G271400 Sobic004G306100--Sobic010G103500 Sobic004G306100--Sobic003G411700 Sobic003G315700 Sobic003G315700 Sobic004G306100--Sobic003G315700 Sobic004G306100--Sobic006G127200 Sobic004G306100--Sobic003G409600 Sobic002G260700 Sobic002G260700 Sobic004G306100--Sobic002G260700 Sobic004G306100--Sobic002G123600 Sobic010G052400 Sobic010G052400 Sobic004G306100--Sobic010G052400
Octagon: transcription factors


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