Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G090300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PCD3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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cDNA sequences
Sobic.008G090300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G099500 - -
2 Sobic.003G397100 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
3 Sobic.006G066000 - -
4 Sobic.004G189700 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
5 Sobic.008G084401 - -
6 Sobic.008G090400 - -
7 Sobic.010G237650 - -
8 Sobic.008G169400 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@auxin response factor, putative, expressed -
9 Sobic.007G070300 OsFBL41 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
10 Sobic.008G112100 Phospholipid synthesis protein 1 PLS1 (Zm)(PubMedID : 27208977)@acyltransferase, putative, expressed K13523: lysophosphatidic acid acyltransferase / lysophosphatidylinositol acyltransferase
11 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
12 Sobic.001G242300 expressed protein -
13 Sobic.003G304800 OsRhmbd4 - Putative Rhomboid homologue, expressed -
14 Sobic.003G205100 helicase, putative, expressed K11136: regulator of telomere elongation helicase 1
15 Sobic.002G107532 - -
16 Sobic.004G135500 - -
17 Sobic.002G416150 - -
18 Sobic.002G260700 ARF GTPase-activating domain-containing protein, putative, expressed K12489: Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein
19 Sobic.002G123600 expressed protein -
20 Sobic.005G216800 RNA recognition motif containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G090300 Sobic008G090300 Sobic008G099500 Sobic008G099500 Sobic008G090300--Sobic008G099500 Sobic003G397100 Sobic003G397100 Sobic008G090300--Sobic003G397100 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic008G090300--Sobic006G066000 Sobic004G189700 Sobic004G189700 Sobic008G090300--Sobic004G189700 Sobic008G084401 Sobic008G084401 Sobic008G090300--Sobic008G084401 Sobic008G090400 Sobic008G090400 Sobic008G090300--Sobic008G090400 Sobic010G237650 Sobic010G237650 Sobic008G090300--Sobic010G237650 Sobic008G169400 Sobic008G169400 Sobic008G090300--Sobic008G169400 Sobic007G070300 Sobic007G070300 Sobic008G090300--Sobic007G070300 Sobic008G099500--Sobic008G090300 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic008G099500--Sobic005G099150 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic008G099500--Sobic006G022500 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic008G099500--Sobic005G128000 Sobic004G227500 Sobic004G227500 Sobic008G099500--Sobic004G227500 Sobic004G289500 Sobic004G289500 Sobic008G099500--Sobic004G289500 Sobic002G334600 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Octagon: transcription factors


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