Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G135500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5Y0N8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G227500 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G262100 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20499123)@auxin response factor, putative, expressed -
3 Sobic.008G169400 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@auxin response factor, putative, expressed -
4 Sobic.001G494100 expressed protein K10875: RAD54L, DNA repair and recombination protein RAD54 and RAD54-like protein
5 Sobic.008G099500 - -
6 Sobic.008G048966 - -
7 Sobic.002G162000 - -
8 Sobic.003G347300 TBC domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G218700 mitochondrial carrier protein, putative, expressed K15121: solute carrier family 25, member 44
10 Sobic.008G090300 - -
11 Sobic.001G315400 expressed protein -
12 Sobic.006G081500 receptor-like kinase, putative, expressed -
13 Sobic.003G397100 lysine ketoglutarate reductase trans-splicing related 1, putative, expressed -
14 Sobic.010G046400 glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase, putative, expressed -
15 Sobic.002G002100 expressed protein -
16 Sobic.007G187400 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
17 Sobic.002G380100 PPR repeat containing protein, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
18 Sobic.004G144100 - -
19 Sobic.001G256500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.008G007000 HIT zinc finger domain containing protein, expressed K11663: ZNHIT1, zinc finger HIT domain-containing protein 1


Gene co-expression network
sample Sobic004G135500 Sobic004G135500 Sobic004G227500 Sobic004G227500 Sobic004G135500--Sobic004G227500 Sobic006G262100 Sobic006G262100 Sobic004G135500--Sobic006G262100 Sobic008G169400 Sobic008G169400 Sobic004G135500--Sobic008G169400 Sobic001G494100 Sobic001G494100 Sobic004G135500--Sobic001G494100 Sobic008G099500 Sobic008G099500 Sobic004G135500--Sobic008G099500 Sobic008G048966 Sobic008G048966 Sobic004G135500--Sobic008G048966 Sobic002G162000 Sobic002G162000 Sobic004G135500--Sobic002G162000 Sobic003G347300 Sobic003G347300 Sobic004G135500--Sobic003G347300 Sobic002G218700 Sobic002G218700 Sobic004G135500--Sobic002G218700 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic004G227500--Sobic006G022500 Sobic002G316500 Sobic002G316500 Sobic004G227500--Sobic002G316500 Sobic010G046400 Sobic010G046400 Sobic004G227500--Sobic010G046400 Sobic004G227500--Sobic001G494100 Sobic004G227500--Sobic004G135500 Sobic010G173900 Sobic010G173900 Sobic004G227500--Sobic010G173900 Sobic001G315400 Sobic001G315400 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Octagon: transcription factors


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