Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G415600.1,Sobic.003G415600.2
Synonym PDF1.5
Functional annotation DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6Q813
Pfam PF00304
Panther DB PTHR33147 PTHR33147:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G55010 : plant defensin 1.5
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g70680.1 : DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G415600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G256500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
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17 Sobic.004G270800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@WD repeat-containing protein, putative, expressed K03363: cell division cycle 20, cofactor of APC complex
18 Sobic.004G308100 uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G345200 protein kinase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G331000 exostosin family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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