Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G227050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RK29
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g02800.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G209900 expressed protein -
2 Sobic.005G196500 embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G154100 expressed protein -
4 Sobic.002G179700 3-ketoacyl-CoA synthase precursor, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
5 Sobic.001G356400 expansin precursor, putative, expressed -
6 Sobic.010G107200 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
7 Sobic.006G001400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.007G103800 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
9 Sobic.007G123200 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G315000 - -
11 Sobic.007G012800 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.003G333000 LTPL65 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
13 Sobic.006G233600 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
14 Sobic.005G227000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@aspartic protease, putative, expressed -
15 Sobic.002G201100 ZF-HD protein dimerisation region containing protein, expressed -
16 Sobic.003G420800 glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00006: glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD+)
17 Sobic.008G008500 protein phosphatase 2c, putative, expressed -
18 Sobic.009G134000 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
19 Sobic.001G228100 gene responsible for epi-cuticular wax accumulation in sorghum.(PubMedID : 29379518)@GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.005G188500 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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