Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G188500.1
Synonym Sb05g024590
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RJD9
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45530 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g46690.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G488400 "PGL1(Ortholog in rice:Heang and Sassa, 2012)"(PubMedID : 31659850)@bHLH family protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G044200 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
3 Sobic.007G189400 BEE 1, putative, expressed -
4 Sobic.006G032800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@glycosyl hydrolase family 10 protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G012800 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
6 Sobic.008G035400 stress responsive A/B Barrel domain containing protein, expressed -
7 Sobic.010G065700 expressed protein -
8 Sobic.005G209900 expressed protein -
9 Sobic.010G107200 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
10 Sobic.002G382500 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G027700 OsSAUR24 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
12 Sobic.009G154100 expressed protein -
13 Sobic.003G041801 - -
14 Sobic.004G340000 expressed protein -
15 Sobic.008G158000 expressed protein -
16 Sobic.008G187400 - -
17 Sobic.009G260200 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G438500 POEI1 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
19 Sobic.002G068400 - -
20 Sobic.004G248100 endoglucanase, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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