Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G098500.1
Synonym Sb03g008240
Functional annotation -
UniProt C5XEV2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g02150.1 : sulfated surface glycoprotein 185 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035450 , Zm00025a023749
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3B02G012100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G098500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G276600 endoglucanase, putative, expressed -
2 Sobic.001G099100 endoglucanase, putative, expressed K01179: endoglucanase
3 Sobic.009G226900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@auxin-responsive protein, putative, expressed -
4 Sobic.009G026101 - -
5 Sobic.008G055000 - -
6 Sobic.008G174900 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
7 Sobic.006G267500 katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1 homolog 1, putative, expressed K18643: katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1
8 Sobic.009G061000 DNA binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.009G153800 protein kinase, putative, expressed K08857: NIMA (never in mitosis gene a)-related kinase 1/4/5
10 Sobic.010G199700 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.001G437500 plant protein of unknown function DUF869 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G118700 -(PubMedID : 28944535)@CESA3 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
13 Sobic.004G168700 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G243800 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G051300 galactosyltransferase, putative, expressed -
16 Sobic.010G090500 expressed protein -
17 Sobic.009G125900 expressed protein -
18 Sobic.007G001900 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G468300 methyladenine glycosylase, putative, expressed K01246: DNA-3-methyladenine glycosylase I
20 Sobic.004G007600 glycosyltransferase protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G098500 Sobic003G098500 Sobic002G276600 Sobic002G276600 Sobic003G098500--Sobic002G276600 Sobic001G099100 Sobic001G099100 Sobic003G098500--Sobic001G099100 Sobic009G226900 Sobic009G226900 Sobic003G098500--Sobic009G226900 Sobic009G026101 Sobic009G026101 Sobic003G098500--Sobic009G026101 Sobic008G055000 Sobic008G055000 Sobic003G098500--Sobic008G055000 Sobic008G174900 Sobic008G174900 Sobic003G098500--Sobic008G174900 Sobic006G267500 Sobic006G267500 Sobic003G098500--Sobic006G267500 Sobic009G061000 Sobic009G061000 Sobic003G098500--Sobic009G061000 Sobic009G153800 Sobic009G153800 Sobic003G098500--Sobic009G153800 Sobic002G276600--Sobic009G061000 Sobic001G437500 Sobic001G437500 Sobic002G276600--Sobic001G437500 Sobic002G276600--Sobic001G099100 Sobic002G276600--Sobic008G174900 Sobic002G276600--Sobic006G267500 Sobic004G243800 Sobic004G243800 Sobic002G276600--Sobic004G243800 Sobic002G276600--Sobic009G026101 Sobic004G051300 Sobic004G051300 Sobic002G276600--Sobic004G051300 Sobic010G090500 Sobic010G090500 Sobic002G276600--Sobic010G090500 Sobic001G099100--Sobic004G051300 Sobic002G118700 Sobic002G118700 Sobic001G099100--Sobic002G118700 Sobic001G099100--Sobic002G276600 Sobic002G075500 Sobic002G075500 Sobic001G099100--Sobic002G075500 Sobic001G099100--Sobic010G090500 Sobic001G099100--Sobic009G026101 Sobic009G125900 Sobic009G125900 Sobic001G099100--Sobic009G125900 Sobic003G353400 Sobic003G353400 Sobic001G099100--Sobic003G353400 Sobic009G079100 Sobic009G079100 Sobic001G099100--Sobic009G079100 Sobic003G062000 Sobic003G062000 Sobic009G226900--Sobic003G062000 Sobic001G224300 Sobic001G224300 Sobic009G226900--Sobic001G224300 Sobic003G296400 Sobic003G296400 Sobic009G226900--Sobic003G296400 Sobic002G205500 Sobic002G205500 Sobic009G226900--Sobic002G205500 Sobic003G387500 Sobic003G387500 Sobic009G226900--Sobic003G387500 Sobic006G036400 Sobic006G036400 Sobic009G226900--Sobic006G036400 Sobic001G406700 Sobic001G406700 Sobic009G226900--Sobic001G406700 Sobic005G087200 Sobic005G087200 Sobic009G226900--Sobic005G087200 Sobic006G075000 Sobic006G075000 Sobic009G226900--Sobic006G075000 Sobic001G133900 Sobic001G133900 Sobic009G026101--Sobic001G133900 Sobic009G063400 Sobic009G063400 Sobic009G026101--Sobic009G063400 Sobic009G026101--Sobic009G125900 Sobic009G246700 Sobic009G246700 Sobic009G026101--Sobic009G246700 Sobic009G206500 Sobic009G206500 Sobic009G026101--Sobic009G206500 Sobic009G026101--Sobic002G075500 Sobic009G026101--Sobic006G075000 Sobic003G254700 Sobic003G254700 Sobic009G026101--Sobic003G254700 Sobic010G096100 Sobic010G096100 Sobic009G026101--Sobic010G096100 Sobic007G001900 Sobic007G001900 Sobic008G055000--Sobic007G001900 Sobic008G055000--Sobic009G226900 Sobic008G055000--Sobic003G098500 Sobic004G168700 Sobic004G168700 Sobic008G055000--Sobic004G168700 Sobic008G055000--Sobic005G087200 Sobic010G196400 Sobic010G196400 Sobic008G055000--Sobic010G196400 Sobic008G112200 Sobic008G112200 Sobic008G055000--Sobic008G112200 Sobic010G199700 Sobic010G199700 Sobic008G055000--Sobic010G199700 Sobic003G085200 Sobic003G085200 Sobic008G055000--Sobic003G085200 Sobic008G174900--Sobic002G276600 Sobic008G174900--Sobic001G437500 Sobic008G174900--Sobic004G243800 Sobic008G174900--Sobic006G267500 Sobic008G174900--Sobic010G090500 Sobic008G174900--Sobic009G026101 Sobic008G174900--Sobic009G226900 Sobic008G174900--Sobic010G096100 Sobic008G174900--Sobic009G206500 Sobic006G267500--Sobic009G061000 Sobic006G267500--Sobic009G206500 Sobic009G212100 Sobic009G212100 Sobic006G267500--Sobic009G212100 Sobic006G254500 Sobic006G254500 Sobic006G267500--Sobic006G254500 Sobic006G267500--Sobic001G437500 Sobic004G315700 Sobic004G315700 Sobic006G267500--Sobic004G315700 Sobic006G267500--Sobic010G090500 Sobic005G204700 Sobic005G204700 Sobic006G267500--Sobic005G204700 Sobic001G296800 Sobic001G296800 Sobic006G267500--Sobic001G296800 Sobic009G061000--Sobic006G267500 Sobic009G073400 Sobic009G073400 Sobic009G061000--Sobic009G073400 Sobic009G061000--Sobic001G437500 Sobic009G061000--Sobic002G276600 Sobic001G159800 Sobic001G159800 Sobic009G061000--Sobic001G159800 Sobic009G061000--Sobic010G090500 Sobic009G061000--Sobic009G206500 Sobic009G167100 Sobic009G167100 Sobic009G061000--Sobic009G167100 Sobic001G051300 Sobic001G051300 Sobic009G061000--Sobic001G051300 Sobic008G059800 Sobic008G059800 Sobic009G153800--Sobic008G059800 Sobic002G003200 Sobic002G003200 Sobic009G153800--Sobic002G003200 Sobic004G344200 Sobic004G344200 Sobic009G153800--Sobic004G344200 Sobic009G153800--Sobic010G199700 Sobic003G352800 Sobic003G352800 Sobic009G153800--Sobic003G352800 Sobic009G153800--Sobic008G112200 Sobic002G164600 Sobic002G164600 Sobic009G153800--Sobic002G164600 Sobic009G241600 Sobic009G241600 Sobic009G153800--Sobic009G241600 Sobic003G236701 Sobic003G236701 Sobic009G153800--Sobic003G236701
Octagon: transcription factors


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