Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G125900.1
Synonym Sb09g019340
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YXI7
Pfam PF03385
Panther DB PTHR31362 PTHR31362:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G41770 : Protein of unknown function (DUF288)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g32500.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043568
Brachypodium KQK06488
Barley -
Wheat TraesCS1B02G255800 , TraesCS1D02G244300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G063400 "CESA1-like or CESA10-like homologous to the Arabidopsis, up-regulated in addition of GA3"(PubMedID : 26198258)@CESA1 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
2 Sobic.009G026101 - -
3 Sobic.002G075500 CESA8 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
4 Sobic.002G118700 -(PubMedID : 28944535)@CESA3 - cellulose synthase, expressed K10999: cellulose synthase A
5 Sobic.010G090500 expressed protein -
6 Sobic.004G265600 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
7 Sobic.010G096100 ras-related protein, putative, expressed K04392: Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1
8 Sobic.004G051300 galactosyltransferase, putative, expressed -
9 Sobic.003G254700 glycosyltransferase family 43 protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G208600 receptor kinase like protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G007600 glycosyltransferase protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G075000 Late embryogenesis abundant hydroxyproline-rich glycoprotein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G334900 X8 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G133900 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
15 Sobic.001G099100 endoglucanase, putative, expressed K01179: endoglucanase
16 Sobic.008G178800 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase, putative, expressed K00549: 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase
17 Sobic.008G174900 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G017500 beta-hexosaminidase precursor, putative, expressed K12373: hexosaminidase
19 Sobic.009G246700 CAS1 domain-containing protein 1 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.001G073150 - K15449: tRNA wybutosine-synthesizing protein 1


Gene co-expression network
sample Sobic009G125900 Sobic009G125900 Sobic009G063400 Sobic009G063400 Sobic009G125900--Sobic009G063400 Sobic009G026101 Sobic009G026101 Sobic009G125900--Sobic009G026101 Sobic002G075500 Sobic002G075500 Sobic009G125900--Sobic002G075500 Sobic002G118700 Sobic002G118700 Sobic009G125900--Sobic002G118700 Sobic010G090500 Sobic010G090500 Sobic009G125900--Sobic010G090500 Sobic004G265600 Sobic004G265600 Sobic009G125900--Sobic004G265600 Sobic010G096100 Sobic010G096100 Sobic009G125900--Sobic010G096100 Sobic004G051300 Sobic004G051300 Sobic009G125900--Sobic004G051300 Sobic003G254700 Sobic003G254700 Sobic009G125900--Sobic003G254700 Sobic009G063400--Sobic009G125900 Sobic009G063400--Sobic002G075500 Sobic009G063400--Sobic009G026101 Sobic009G063400--Sobic002G118700 Sobic009G063400--Sobic010G096100 Sobic001G334900 Sobic001G334900 Sobic009G063400--Sobic001G334900 Sobic009G063400--Sobic010G090500 Sobic001G208600 Sobic001G208600 Sobic009G063400--Sobic001G208600 Sobic006G075000 Sobic006G075000 Sobic009G063400--Sobic006G075000 Sobic001G133900 Sobic001G133900 Sobic009G026101--Sobic001G133900 Sobic009G026101--Sobic009G063400 Sobic009G026101--Sobic009G125900 Sobic009G246700 Sobic009G246700 Sobic009G026101--Sobic009G246700 Sobic009G206500 Sobic009G206500 Sobic009G026101--Sobic009G206500 Sobic009G026101--Sobic002G075500 Sobic009G026101--Sobic006G075000 Sobic009G026101--Sobic003G254700 Sobic009G026101--Sobic010G096100 Sobic002G075500--Sobic009G063400 Sobic002G075500--Sobic009G125900 Sobic002G075500--Sobic002G118700 Sobic002G075500--Sobic009G026101 Sobic002G075500--Sobic004G051300 Sobic001G099100 Sobic001G099100 Sobic002G075500--Sobic001G099100 Sobic007G180900 Sobic007G180900 Sobic002G075500--Sobic007G180900 Sobic002G075500--Sobic003G254700 Sobic006G156600 Sobic006G156600 Sobic002G075500--Sobic006G156600 Sobic002G118700--Sobic009G063400 Sobic002G118700--Sobic009G125900 Sobic002G118700--Sobic002G075500 Sobic002G118700--Sobic001G099100 Sobic002G118700--Sobic004G051300 Sobic002G118700--Sobic009G026101 Sobic002G118700--Sobic010G090500 Sobic002G118700--Sobic007G180900 Sobic002G276600 Sobic002G276600 Sobic002G118700--Sobic002G276600 Sobic001G159800 Sobic001G159800 Sobic010G090500--Sobic001G159800 Sobic010G120300 Sobic010G120300 Sobic010G090500--Sobic010G120300 Sobic010G090500--Sobic009G206500 Sobic009G079100 Sobic009G079100 Sobic010G090500--Sobic009G079100 Sobic001G437500 Sobic001G437500 Sobic010G090500--Sobic001G437500 Sobic006G267500 Sobic006G267500 Sobic010G090500--Sobic006G267500 Sobic001G073150 Sobic001G073150 Sobic010G090500--Sobic001G073150 Sobic009G061000 Sobic009G061000 Sobic010G090500--Sobic009G061000 Sobic010G090500--Sobic009G125900 Sobic004G265600--Sobic009G125900 Sobic001G116000 Sobic001G116000 Sobic004G265600--Sobic001G116000 Sobic004G265600--Sobic009G063400 Sobic004G265600--Sobic009G026101 Sobic004G203900 Sobic004G203900 Sobic004G265600--Sobic004G203900 Sobic004G265600--Sobic002G075500 Sobic004G265600--Sobic003G254700 Sobic004G265600--Sobic010G090500 Sobic008G174900 Sobic008G174900 Sobic004G265600--Sobic008G174900 Sobic010G096100--Sobic006G075000 Sobic010G096100--Sobic001G208600 Sobic010G096100--Sobic009G063400 Sobic010G096100--Sobic009G026101 Sobic010G096100--Sobic009G125900 Sobic009G017500 Sobic009G017500 Sobic010G096100--Sobic009G017500 Sobic009G251100 Sobic009G251100 Sobic010G096100--Sobic009G251100 Sobic001G484000 Sobic001G484000 Sobic010G096100--Sobic001G484000 Sobic010G114000 Sobic010G114000 Sobic010G096100--Sobic010G114000 Sobic004G051300--Sobic001G099100 Sobic004G051300--Sobic002G118700 Sobic004G051300--Sobic009G125900 Sobic004G051300--Sobic002G075500 Sobic004G051300--Sobic009G026101 Sobic004G051300--Sobic002G276600 Sobic004G051300--Sobic009G079100 Sobic004G051300--Sobic010G090500 Sobic004G051300--Sobic009G063400 Sobic004G111100 Sobic004G111100 Sobic003G254700--Sobic004G111100 Sobic004G007600 Sobic004G007600 Sobic003G254700--Sobic004G007600 Sobic003G254700--Sobic001G133900 Sobic003G254700--Sobic009G026101 Sobic001G072600 Sobic001G072600 Sobic003G254700--Sobic001G072600 Sobic003G254700--Sobic009G246700 Sobic003G254700--Sobic009G125900 Sobic003G254700--Sobic002G075500 Sobic002G218900 Sobic002G218900 Sobic003G254700--Sobic002G218900
Octagon: transcription factors


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