Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G060500.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PKH2
Pfam -
Panther DB PTHR22814 PTHR22814:SF135
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g32860.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055962
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G109000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@chalcone isomerase 3, putative, expressed -
2 Sobic.008G171100 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
3 Sobic.004G300800 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed K00128: aldehyde dehydrogenase (NAD+)
4 Sobic.002G033000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
5 Sobic.002G209800 ZOS9-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.007G090415 - -
7 Sobic.006G001400 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.008G008500 protein phosphatase 2c, putative, expressed -
9 Sobic.009G059100 Cupin domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G215600 expressed protein -
11 Sobic.009G055900 fasciclin-like arabinogalactan protein 8 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.001G453200 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
13 Sobic.002G190100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
14 Sobic.005G020200 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
15 Sobic.008G130700 expressed protein -
16 Sobic.003G157500 oxidoreductase, 2OG-FeII oxygenase domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G253800 - -
18 Sobic.001G215300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G249400 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
20 Sobic.005G141000 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Sobic009G059100--Sobic003G096100 Sobic009G059100--Sobic001G435600
Octagon: transcription factors


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