Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G192600.1
Synonym ANAC038, NAC038, ANAC039, Sb02g023960
Functional annotation no apical meristem protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W530
Pfam PF02365
Panther DB PTHR31744:SF10 PTHR31744
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G18270 : Arabidopsis NAC domain containing protein 87
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g38720.1 : no apical meristem protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035399 , Zm00025a023838
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G543500 , TraesCS7D02G543500
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.002G192600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G133600 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@"ZmSWEET4c(Ortholog in maize:Sosso et al., 2015(PubMedID : 31659882)@Zhang et al., 2015)"(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
2 Sobic.005G186300 - -
3 Sobic.009G052400 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
4 Sobic.002G078800 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
5 Sobic.001G129900 indole-3-acetate beta-glucosyltransferase, putative, expressed K13692: UDP-glucose:(indol-3-yl)acetate beta-D-glucosyltransferase
6 Sobic.009G061900 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.007G205400 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.006G080500 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.006G015750 - -
10 Sobic.003G091400 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G409250 - -
12 Sobic.007G187100 terpene synthase, putative, expressed -
13 Sobic.005G079300 terpene synthase, putative, expressed -
14 Sobic.001G200900 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.010G060100 leucoanthocyanidin dioxygenase, putative, expressed -
16 Sobic.002G381600 uncharacterized glycosyl hydrolase Rv2006/MT2062, putative, expressed K01087: trehalose 6-phosphate phosphatase
17 Sobic.006G178400 monocopper oxidase, putative, expressed -
18 Sobic.008G168400 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed K14494: DELLA protein
19 Sobic.005G056300 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G409300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic004G133600 Sobic004G133600 Sobic002G192600--Sobic004G133600 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic002G192600--Sobic005G186300 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic002G192600--Sobic009G052400 Sobic002G078800 Sobic002G078800 Sobic002G192600--Sobic002G078800 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic002G192600--Sobic001G129900 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic002G192600--Sobic009G061900 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic002G192600--Sobic007G205400 Sobic006G080500 Sobic006G080500 Sobic002G192600--Sobic006G080500 Sobic006G015750 Sobic006G015750 Sobic002G192600--Sobic006G015750 Sobic004G133600--Sobic002G192600 Sobic010G060100 Sobic010G060100 Sobic004G133600--Sobic010G060100 Sobic004G133600--Sobic009G052400 Sobic004G133600--Sobic001G129900 Sobic004G133600--Sobic007G205400 Sobic002G381600 Sobic002G381600 Sobic004G133600--Sobic002G381600 Sobic004G133600--Sobic006G080500 Sobic005G079300 Sobic005G079300 Sobic004G133600--Sobic005G079300 Sobic004G133600--Sobic009G061900 Sobic005G186300--Sobic002G192600 Sobic005G186300--Sobic009G061900 Sobic005G186300--Sobic007G205400 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic005G186300--Sobic002G409300 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic005G186300--Sobic001G200900 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic005G186300--Sobic007G187100 Sobic005G186300--Sobic004G133600 Sobic005G186300--Sobic002G078800 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic005G186300--Sobic005G174000 Sobic009G052400--Sobic001G129900 Sobic009G052400--Sobic006G080500 Sobic009G052400--Sobic002G381600 Sobic009G052400--Sobic002G192600 Sobic009G052400--Sobic004G133600 Sobic009G052400--Sobic005G079300 Sobic009G052400--Sobic002G078800 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic009G052400--Sobic008G168400 Sobic006G178400 Sobic006G178400 Sobic009G052400--Sobic006G178400 Sobic002G078800--Sobic006G015750 Sobic003G091400 Sobic003G091400 Sobic002G078800--Sobic003G091400 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic002G078800--Sobic002G409250 Sobic002G078800--Sobic002G192600 Sobic002G078800--Sobic006G080500 Sobic002G078800--Sobic006G178400 Sobic002G078800--Sobic009G052400 Sobic003G135000 Sobic003G135000 Sobic002G078800--Sobic003G135000 Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic002G078800--Sobic005G193700 Sobic001G129900--Sobic006G080500 Sobic001G129900--Sobic009G052400 Sobic001G129900--Sobic002G381600 Sobic001G129900--Sobic008G168400 Sobic001G129900--Sobic005G079300 Sobic001G129900--Sobic002G192600 Sobic001G129900--Sobic004G133600 Sobic005G056300 Sobic005G056300 Sobic001G129900--Sobic005G056300 Sobic001G129900--Sobic007G187100 Sobic009G061900--Sobic007G187100 Sobic009G061900--Sobic005G186300 Sobic009G061900--Sobic001G200900 Sobic009G061900--Sobic002G192600 Sobic009G061900--Sobic002G409300 Sobic009G061900--Sobic009G052400 Sobic009G061900--Sobic001G129900 Sobic009G061900--Sobic004G133600 Sobic009G061900--Sobic005G174000 Sobic007G205400--Sobic005G186300 Sobic007G205400--Sobic002G192600 Sobic007G205400--Sobic010G060100 Sobic007G205400--Sobic004G133600 Sobic007G205400--Sobic009G061900 Sobic007G205400--Sobic002G078800 Sobic007G205400--Sobic001G200900 Sobic007G205400--Sobic002G409250 Sobic007G205400--Sobic002G409300 Sobic006G080500--Sobic001G129900 Sobic006G080500--Sobic009G052400 Sobic006G080500--Sobic005G056300 Sobic006G080500--Sobic003G135000 Sobic006G080500--Sobic002G381600 Sobic006G080500--Sobic005G079300 Sobic006G080500--Sobic002G078800 Sobic006G080500--Sobic008G168400 Sobic006G080500--Sobic002G192600 Sobic006G015750--Sobic003G091400 Sobic006G015750--Sobic002G409250 Sobic006G015750--Sobic002G078800 Sobic006G015750--Sobic002G192600 Sobic006G015750--Sobic005G193700 Sobic006G015750--Sobic006G178400 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic006G015750--Sobic001G253400 Sobic006G015750--Sobic006G080500 Sobic006G015750--Sobic009G052400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.