Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G409300.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W7S1
Pfam -
Panther DB PTHR14493 PTHR14493:SF41
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G07500 : Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g47240.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049086
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G409300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G021400 Jacalin-like lectin domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G061900 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.005G186300 - -
4 Sobic.003G106400 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
5 Sobic.001G274025 - -
6 Sobic.007G187100 terpene synthase, putative, expressed -
7 Sobic.001G489075 - -
8 Sobic.001G200900 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
9 Sobic.007G205400 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G192600 no apical meristem protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G174000 - -
12 Sobic.006G264800 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
13 Sobic.005G146966 - -
14 Sobic.004G133600 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@"ZmSWEET4c(Ortholog in maize:Sosso et al., 2015(PubMedID : 31659882)@Zhang et al., 2015)"(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
15 Sobic.004G212350 - -
16 Sobic.002G293100 ZOS9-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.010G060100 leucoanthocyanidin dioxygenase, putative, expressed -
18 Sobic.004G171600 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G077900 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G052400 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase


Gene co-expression network
sample Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic009G021400 Sobic009G021400 Sobic002G409300--Sobic009G021400 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic002G409300--Sobic009G061900 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic002G409300--Sobic005G186300 Sobic003G106400 Sobic003G106400 Sobic002G409300--Sobic003G106400 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic002G409300--Sobic001G274025 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic002G409300--Sobic007G187100 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic002G409300--Sobic001G489075 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic002G409300--Sobic001G200900 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic002G409300--Sobic007G205400 Sobic009G021400--Sobic003G106400 Sobic009G021400--Sobic001G274025 Sobic009G021400--Sobic002G409300 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic009G021400--Sobic006G264800 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic009G021400--Sobic004G220900 Sobic009G021400--Sobic001G489075 Sobic009G021400--Sobic007G187100 Sobic009G021400--Sobic009G061900 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic009G021400--Sobic002G172100 Sobic009G061900--Sobic007G187100 Sobic009G061900--Sobic005G186300 Sobic009G061900--Sobic001G200900 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic009G061900--Sobic002G192600 Sobic009G061900--Sobic002G409300 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic009G061900--Sobic009G052400 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic009G061900--Sobic001G129900 Sobic004G133600 Sobic004G133600 Sobic009G061900--Sobic004G133600 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic009G061900--Sobic005G174000 Sobic005G186300--Sobic002G192600 Sobic005G186300--Sobic009G061900 Sobic005G186300--Sobic007G205400 Sobic005G186300--Sobic002G409300 Sobic005G186300--Sobic001G200900 Sobic005G186300--Sobic007G187100 Sobic005G186300--Sobic004G133600 Sobic002G078800 Sobic002G078800 Sobic005G186300--Sobic002G078800 Sobic005G186300--Sobic005G174000 Sobic003G106400--Sobic009G021400 Sobic003G106400--Sobic002G409300 Sobic003G106400--Sobic004G220900 Sobic003G106400--Sobic001G274025 Sobic003G106400--Sobic001G489075 Sobic003G106400--Sobic006G264800 Sobic003G106400--Sobic007G187100 Sobic003G106400--Sobic009G061900 Sobic003G106400--Sobic002G172100 Sobic001G274025--Sobic006G264800 Sobic001G274025--Sobic009G021400 Sobic001G274025--Sobic003G106400 Sobic001G274025--Sobic002G409300 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic001G274025--Sobic003G294800 Sobic001G274025--Sobic002G172100 Sobic001G274025--Sobic001G489075 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic001G274025--Sobic009G112200 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic001G274025--Sobic005G188800 Sobic007G187100--Sobic009G061900 Sobic005G079300 Sobic005G079300 Sobic007G187100--Sobic005G079300 Sobic007G187100--Sobic001G129900 Sobic007G187100--Sobic002G192600 Sobic007G187100--Sobic002G409300 Sobic004G212350 Sobic004G212350 Sobic007G187100--Sobic004G212350 Sobic007G187100--Sobic004G133600 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic007G187100--Sobic008G168400 Sobic007G187100--Sobic005G186300 Sobic001G489075--Sobic005G174000 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic001G489075--Sobic008G088900 Sobic005G146966 Sobic005G146966 Sobic001G489075--Sobic005G146966 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic001G489075--Sobic004G171600 Sobic001G489075--Sobic002G409300 Sobic001G489075--Sobic006G264800 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic001G489075--Sobic002G108300 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic001G489075--Sobic002G293100 Sobic001G489075--Sobic001G200900 Sobic001G200900--Sobic005G174000 Sobic001G200900--Sobic004G171600 Sobic001G200900--Sobic009G061900 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic001G200900--Sobic005G077900 Sobic001G200900--Sobic005G186300 Sobic001G200900--Sobic002G192600 Sobic001G200900--Sobic002G293100 Sobic001G200900--Sobic009G052400 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic001G200900--Sobic001G233600 Sobic007G205400--Sobic005G186300 Sobic007G205400--Sobic002G192600 Sobic010G060100 Sobic010G060100 Sobic007G205400--Sobic010G060100 Sobic007G205400--Sobic004G133600 Sobic007G205400--Sobic009G061900 Sobic007G205400--Sobic002G078800 Sobic007G205400--Sobic001G200900 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic007G205400--Sobic002G409250 Sobic007G205400--Sobic002G409300
Octagon: transcription factors


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