Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G015750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RCN0
Pfam PF06839
Panther DB PTHR33248 PTHR33248:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G33393 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g08530.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G091400 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G409250 - -
3 Sobic.002G078800 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
4 Sobic.002G192600 no apical meristem protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G193700 - -
6 Sobic.006G178400 monocopper oxidase, putative, expressed -
7 Sobic.001G253400 AP2 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.006G080500 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G052400 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
10 Sobic.003G135000 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
11 Sobic.001G158600 MYB family transcription factor, putative, expressed -
12 Sobic.005G186300 - -
13 Sobic.004G133600 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@"ZmSWEET4c(Ortholog in maize:Sosso et al., 2015(PubMedID : 31659882)@Zhang et al., 2015)"(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
14 Sobic.001G129900 indole-3-acetate beta-glucosyltransferase, putative, expressed K13692: UDP-glucose:(indol-3-yl)acetate beta-D-glucosyltransferase
15 Sobic.009G040000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
16 Sobic.007G205400 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G056300 no apical meristem protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G200900 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
19 Sobic.005G079300 terpene synthase, putative, expressed -
20 Sobic.004G139700 OsSCP7 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16296: serine carboxypeptidase-like clade I


Gene co-expression network
sample Sobic006G015750 Sobic006G015750 Sobic003G091400 Sobic003G091400 Sobic006G015750--Sobic003G091400 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic006G015750--Sobic002G409250 Sobic002G078800 Sobic002G078800 Sobic006G015750--Sobic002G078800 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic006G015750--Sobic002G192600 Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic006G015750--Sobic005G193700 Sobic006G178400 Sobic006G178400 Sobic006G015750--Sobic006G178400 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic006G015750--Sobic001G253400 Sobic006G080500 Sobic006G080500 Sobic006G015750--Sobic006G080500 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic006G015750--Sobic009G052400 Sobic003G091400--Sobic006G015750 Sobic003G091400--Sobic002G409250 Sobic003G091400--Sobic002G078800 Sobic003G091400--Sobic005G193700 Sobic003G091400--Sobic006G178400 Sobic003G091400--Sobic002G192600 Sobic003G091400--Sobic001G253400 Sobic003G091400--Sobic006G080500 Sobic003G135000 Sobic003G135000 Sobic003G091400--Sobic003G135000 Sobic002G409250--Sobic003G091400 Sobic002G409250--Sobic006G015750 Sobic002G409250--Sobic002G078800 Sobic002G409250--Sobic005G193700 Sobic002G409250--Sobic001G253400 Sobic002G409250--Sobic006G178400 Sobic002G409250--Sobic002G192600 Sobic002G409250--Sobic006G080500 Sobic002G409250--Sobic003G135000 Sobic002G078800--Sobic006G015750 Sobic002G078800--Sobic003G091400 Sobic002G078800--Sobic002G409250 Sobic002G078800--Sobic002G192600 Sobic002G078800--Sobic006G080500 Sobic002G078800--Sobic006G178400 Sobic002G078800--Sobic009G052400 Sobic002G078800--Sobic003G135000 Sobic002G078800--Sobic005G193700 Sobic004G133600 Sobic004G133600 Sobic002G192600--Sobic004G133600 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic002G192600--Sobic005G186300 Sobic002G192600--Sobic009G052400 Sobic002G192600--Sobic002G078800 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic002G192600--Sobic001G129900 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic002G192600--Sobic009G061900 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic002G192600--Sobic007G205400 Sobic002G192600--Sobic006G080500 Sobic002G192600--Sobic006G015750 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic005G193700--Sobic001G158600 Sobic005G193700--Sobic001G253400 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic005G193700--Sobic006G051750 Sobic005G193700--Sobic002G409250 Sobic005G193700--Sobic003G091400 Sobic005G193700--Sobic006G015750 Sobic005G193700--Sobic003G135000 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic005G193700--Sobic004G261000 Sobic005G193700--Sobic002G078800 Sobic006G178400--Sobic003G135000 Sobic006G178400--Sobic002G078800 Sobic006G178400--Sobic009G052400 Sobic006G178400--Sobic006G080500 Sobic006G178400--Sobic002G409250 Sobic006G178400--Sobic003G091400 Sobic006G178400--Sobic006G015750 Sobic006G178400--Sobic005G193700 Sobic005G056300 Sobic005G056300 Sobic006G178400--Sobic005G056300 Sobic001G253400--Sobic001G158600 Sobic001G253400--Sobic005G193700 Sobic001G253400--Sobic006G051750 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic001G253400--Sobic009G040000 Sobic001G253400--Sobic002G409250 Sobic001G253400--Sobic003G091400 Sobic001G253400--Sobic006G015750 Sobic001G253400--Sobic004G261000 Sobic001G253400--Sobic003G135000 Sobic006G080500--Sobic001G129900 Sobic006G080500--Sobic009G052400 Sobic006G080500--Sobic005G056300 Sobic006G080500--Sobic003G135000 Sobic002G381600 Sobic002G381600 Sobic006G080500--Sobic002G381600 Sobic005G079300 Sobic005G079300 Sobic006G080500--Sobic005G079300 Sobic006G080500--Sobic002G078800 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic006G080500--Sobic008G168400 Sobic006G080500--Sobic002G192600 Sobic009G052400--Sobic001G129900 Sobic009G052400--Sobic006G080500 Sobic009G052400--Sobic002G381600 Sobic009G052400--Sobic002G192600 Sobic009G052400--Sobic004G133600 Sobic009G052400--Sobic005G079300 Sobic009G052400--Sobic002G078800 Sobic009G052400--Sobic008G168400 Sobic009G052400--Sobic006G178400
Octagon: transcription factors


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