Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G082300.1
Synonym LCR73
Functional annotation DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6PC65
Pfam PF00304
Panther DB PTHR33147 PTHR33147:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02147 : low-molecular-weight cysteine-rich 73
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g70680.1 : DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G358000 transmembrane receptor, putative, expressed -
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16 Sobic.005G189000 - -
17 Sobic.008G188200 - -
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19 Sobic.008G184000 aspartic proteinase, putative, expressed -
20 Sobic.010G195301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic008G082300--Sobic002G358000 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic008G082300--Sobic007G131100 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic008G082300--Sobic009G007100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic008G082300--Sobic010G035000 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic008G082300--Sobic003G415300 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic008G082300--Sobic005G184400 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic008G082300--Sobic006G105300 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic008G082300--Sobic005G186250 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic008G082300--Sobic005G184600 Sobic002G358000--Sobic008G082300 Sobic002G358000--Sobic009G007100 Sobic002G358000--Sobic007G131100 Sobic002G358000--Sobic010G035000 Sobic002G358000--Sobic005G184400 Sobic002G358000--Sobic005G186250 Sobic002G358000--Sobic005G184600 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic002G358000--Sobic006G142850 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic002G358000--Sobic007G049000 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic007G131100--Sobic007G025100 Sobic007G131100--Sobic010G035000 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic007G131100--Sobic001G297700 Sobic007G131100--Sobic008G082300 Sobic007G131100--Sobic002G358000 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic007G131100--Sobic002G300900 Sobic007G131100--Sobic006G105300 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic007G131100--Sobic008G184000 Sobic007G131100--Sobic005G184400 Sobic009G007100--Sobic005G186250 Sobic009G007100--Sobic007G049000 Sobic009G007100--Sobic005G184400 Sobic009G007100--Sobic006G142850 Sobic009G007100--Sobic005G184600 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic009G007100--Sobic004G207500 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic009G007100--Sobic005G189000 Sobic009G007100--Sobic002G358000 Sobic009G007100--Sobic008G082300 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic010G035000--Sobic005G185400 Sobic005G178200 Sobic005G178200 Sobic003G415300--Sobic005G178200 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic003G415300--Sobic009G086100 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic003G415300--Sobic003G326300 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic003G415300--Sobic008G188200 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic003G415300--Sobic010G195301 Sobic003G415300--Sobic008G082300 Sobic003G415300--Sobic005G189000 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic003G415300--Sobic005G083220 Sobic003G415300--Sobic002G358000 Sobic005G184400--Sobic005G184600 Sobic005G184400--Sobic007G049000 Sobic005G184400--Sobic006G142850 Sobic005G184400--Sobic006G105300 Sobic005G184400--Sobic005G184500 Sobic005G184400--Sobic010G035000 Sobic005G184400--Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic009G007100 Sobic005G184400--Sobic005G185400 Sobic006G105300--Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic005G184400 Sobic006G105300--Sobic005G184600 Sobic006G105300--Sobic005G184500 Sobic006G105300--Sobic007G049000 Sobic006G105300--Sobic006G142850 Sobic006G105300--Sobic001G297700 Sobic006G105300--Sobic005G185400 Sobic006G105300--Sobic009G007100 Sobic005G186250--Sobic009G007100 Sobic005G186250--Sobic007G049000 Sobic005G186250--Sobic006G142850 Sobic005G186250--Sobic004G207500 Sobic005G186250--Sobic005G184400 Sobic005G186250--Sobic005G184600 Sobic005G186250--Sobic005G189000 Sobic005G186250--Sobic005G083220 Sobic005G186250--Sobic006G105300 Sobic005G184600--Sobic005G184400 Sobic005G184600--Sobic007G049000 Sobic005G184600--Sobic006G142850 Sobic005G184600--Sobic006G105300 Sobic005G184600--Sobic005G184500 Sobic005G184600--Sobic005G186250 Sobic005G184600--Sobic010G035000 Sobic005G184600--Sobic009G007100 Sobic005G184600--Sobic005G185400
Octagon: transcription factors


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