Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G105300.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PLB8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g38550.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G035000 - -
2 Sobic.005G184400 - -
3 Sobic.005G184600 - -
4 Sobic.005G184500 - -
5 Sobic.007G049000 OsFBX382 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G142850 - -
7 Sobic.001G297700 expressed protein -
8 Sobic.005G185400 - -
9 Sobic.009G007100 glutelin, putative, expressed -
10 Sobic.005G186250 - -
11 Sobic.007G131100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
12 Sobic.003G319050 - -
13 Sobic.010G031400 early nodulin 93 ENOD93 protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G071100 - -
15 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
16 Sobic.007G025100 expressed protein -
17 Sobic.008G082300 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.005G033400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G358000 transmembrane receptor, putative, expressed -
20 Sobic.002G007300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14962: WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2


Gene co-expression network
sample Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic010G035000 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic006G105300--Sobic005G184400 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic006G105300--Sobic005G184600 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic006G105300--Sobic005G184500 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic006G105300--Sobic007G049000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic006G105300--Sobic006G142850 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic006G105300--Sobic001G297700 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic006G105300--Sobic005G185400 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic006G105300--Sobic009G007100 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic010G035000--Sobic005G185400 Sobic005G184400--Sobic005G184600 Sobic005G184400--Sobic007G049000 Sobic005G184400--Sobic006G142850 Sobic005G184400--Sobic006G105300 Sobic005G184400--Sobic005G184500 Sobic005G184400--Sobic010G035000 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic009G007100 Sobic005G184400--Sobic005G185400 Sobic005G184600--Sobic005G184400 Sobic005G184600--Sobic007G049000 Sobic005G184600--Sobic006G142850 Sobic005G184600--Sobic006G105300 Sobic005G184600--Sobic005G184500 Sobic005G184600--Sobic005G186250 Sobic005G184600--Sobic010G035000 Sobic005G184600--Sobic009G007100 Sobic005G184600--Sobic005G185400 Sobic005G184500--Sobic005G185400 Sobic005G184500--Sobic006G105300 Sobic005G184500--Sobic005G184600 Sobic005G184500--Sobic005G184400 Sobic005G184500--Sobic007G049000 Sobic005G184500--Sobic010G035000 Sobic005G184500--Sobic001G297700 Sobic005G184500--Sobic006G142850 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic005G184500--Sobic010G031400 Sobic007G049000--Sobic005G184600 Sobic007G049000--Sobic005G184400 Sobic007G049000--Sobic006G142850 Sobic007G049000--Sobic005G186250 Sobic007G049000--Sobic006G105300 Sobic007G049000--Sobic009G007100 Sobic007G049000--Sobic005G184500 Sobic007G049000--Sobic010G035000 Sobic007G049000--Sobic005G185400 Sobic006G142850--Sobic007G049000 Sobic006G142850--Sobic005G184600 Sobic006G142850--Sobic005G184400 Sobic006G142850--Sobic005G186250 Sobic006G142850--Sobic006G105300 Sobic006G142850--Sobic009G007100 Sobic006G142850--Sobic010G035000 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic005G184400 Sobic005G185400--Sobic005G184500 Sobic005G185400--Sobic006G105300 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G185400--Sobic006G081400 Sobic005G185400--Sobic001G297700 Sobic005G185400--Sobic005G184600 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic005G185400--Sobic005G033400 Sobic005G185400--Sobic005G184400 Sobic005G185400--Sobic010G031400 Sobic005G185400--Sobic010G035000 Sobic009G007100--Sobic005G186250 Sobic009G007100--Sobic007G049000 Sobic009G007100--Sobic005G184400 Sobic009G007100--Sobic006G142850 Sobic009G007100--Sobic005G184600 Sobic009G007100--Sobic004G207500 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic009G007100--Sobic005G189000 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic009G007100--Sobic002G358000 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic009G007100--Sobic008G082300
Octagon: transcription factors


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