Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G025100.1
Synonym Sb07g002195
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YMI3 , C6JRQ7
Pfam PF05623
Panther DB PTHR32010 PTHR32010:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G49220 : Protein of unknown function (DUF789)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g57870.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040332
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G025100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G300900 - -
2 Sobic.007G131100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
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13 Sobic.005G185400 - -
14 Sobic.005G184500 - -
15 Sobic.003G319050 - -
16 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G071100 - -
18 Sobic.002G358000 transmembrane receptor, putative, expressed -
19 Sobic.010G111400 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
20 Sobic.005G184400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic007G025100--Sobic002G300900 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic007G025100--Sobic007G131100 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic007G025100--Sobic001G297700 Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic007G025100--Sobic006G040101 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic007G025100--Sobic010G035000 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic007G025100--Sobic002G059500 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic007G025100--Sobic005G035500 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic007G025100--Sobic006G105300 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic007G025100--Sobic008G082300 Sobic002G300900--Sobic007G025100 Sobic002G300900--Sobic006G040101 Sobic002G300900--Sobic002G059500 Sobic002G300900--Sobic001G297700 Sobic002G300900--Sobic007G131100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G300900--Sobic001G511400 Sobic002G300900--Sobic010G035000 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic002G300900--Sobic002G172200 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G300900--Sobic003G266100 Sobic007G131100--Sobic007G025100 Sobic007G131100--Sobic010G035000 Sobic007G131100--Sobic001G297700 Sobic007G131100--Sobic008G082300 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic007G131100--Sobic002G358000 Sobic007G131100--Sobic002G300900 Sobic007G131100--Sobic006G105300 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic007G131100--Sobic008G184000 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic007G131100--Sobic005G184400 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic005G184400 Sobic006G040101--Sobic002G059500 Sobic006G040101--Sobic002G300900 Sobic006G040101--Sobic007G025100 Sobic006G040101--Sobic005G035500 Sobic006G040101--Sobic003G266100 Sobic006G040101--Sobic001G297700 Sobic006G040101--Sobic001G511400 Sobic006G040101--Sobic002G172200 Sobic006G004100 Sobic006G004100 Sobic006G040101--Sobic006G004100 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic010G035000--Sobic005G185400 Sobic002G059500--Sobic006G040101 Sobic002G059500--Sobic002G300900 Sobic002G059500--Sobic003G266100 Sobic002G059500--Sobic005G035500 Sobic002G059500--Sobic006G004100 Sobic002G059500--Sobic007G025100 Sobic002G059500--Sobic001G511400 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic002G059500--Sobic008G159300 Sobic002G059500--Sobic002G172200 Sobic005G035500--Sobic002G059500 Sobic005G035500--Sobic006G040101 Sobic005G035500--Sobic007G025100 Sobic005G035500--Sobic002G300900 Sobic005G035500--Sobic006G004100 Sobic010G111400 Sobic010G111400 Sobic005G035500--Sobic010G111400 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic005G035500--Sobic002G058900 Sobic005G035500--Sobic007G131100 Sobic005G035500--Sobic003G266100 Sobic006G105300--Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic005G184400 Sobic006G105300--Sobic005G184600 Sobic006G105300--Sobic005G184500 Sobic006G105300--Sobic007G049000 Sobic006G105300--Sobic006G142850 Sobic006G105300--Sobic001G297700 Sobic006G105300--Sobic005G185400 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic006G105300--Sobic009G007100 Sobic008G082300--Sobic002G358000 Sobic008G082300--Sobic007G131100 Sobic008G082300--Sobic009G007100 Sobic008G082300--Sobic010G035000 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic008G082300--Sobic003G415300 Sobic008G082300--Sobic005G184400 Sobic008G082300--Sobic006G105300 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic008G082300--Sobic005G186250 Sobic008G082300--Sobic005G184600
Octagon: transcription factors


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