Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G131100.2,Sobic.007G131100.1
Synonym Sb07g020680
Functional annotation jmjC domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R9P0 , A0A1Z5R9S4
Pfam PF02373
Panther DB PTHR12549 PTHR12549:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology K15601; [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G11950 : Transcription factor jumonji (jmjC) domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g31594.1 : jmjC domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.010G031400 early nodulin 93 ENOD93 protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G035500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic007G131100--Sobic007G025100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic007G131100--Sobic010G035000 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic007G131100--Sobic001G297700 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic007G131100--Sobic008G082300 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic007G131100--Sobic002G358000 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic007G131100--Sobic002G300900 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic007G131100--Sobic006G105300 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic007G131100--Sobic008G184000 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic007G131100--Sobic005G184400 Sobic007G025100--Sobic002G300900 Sobic007G025100--Sobic007G131100 Sobic007G025100--Sobic001G297700 Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic007G025100--Sobic006G040101 Sobic007G025100--Sobic010G035000 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic007G025100--Sobic002G059500 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic007G025100--Sobic005G035500 Sobic007G025100--Sobic006G105300 Sobic007G025100--Sobic008G082300 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic010G035000--Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic005G184400 Sobic008G082300--Sobic002G358000 Sobic008G082300--Sobic007G131100 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic008G082300--Sobic009G007100 Sobic008G082300--Sobic010G035000 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic008G082300--Sobic003G415300 Sobic008G082300--Sobic005G184400 Sobic008G082300--Sobic006G105300 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic008G082300--Sobic005G186250 Sobic008G082300--Sobic005G184600 Sobic002G358000--Sobic008G082300 Sobic002G358000--Sobic009G007100 Sobic002G358000--Sobic007G131100 Sobic002G358000--Sobic010G035000 Sobic002G358000--Sobic005G184400 Sobic002G358000--Sobic005G186250 Sobic002G358000--Sobic005G184600 Sobic002G358000--Sobic006G142850 Sobic002G358000--Sobic007G049000 Sobic002G300900--Sobic007G025100 Sobic002G300900--Sobic006G040101 Sobic002G300900--Sobic002G059500 Sobic002G300900--Sobic001G297700 Sobic002G300900--Sobic007G131100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G300900--Sobic001G511400 Sobic002G300900--Sobic010G035000 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic002G300900--Sobic002G172200 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G300900--Sobic003G266100 Sobic006G105300--Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic005G184400 Sobic006G105300--Sobic005G184600 Sobic006G105300--Sobic005G184500 Sobic006G105300--Sobic007G049000 Sobic006G105300--Sobic006G142850 Sobic006G105300--Sobic001G297700 Sobic006G105300--Sobic005G185400 Sobic006G105300--Sobic009G007100 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic008G184000--Sobic004G029700 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic008G184000--Sobic005G227151 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic008G184000--Sobic008G184500 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic008G184000--Sobic002G105900 Sobic008G184000--Sobic007G131100 Sobic008G184000--Sobic003G319050 Sobic008G184000--Sobic010G035000 Sobic008G184000--Sobic007G025100 Sobic008G184000--Sobic001G297700 Sobic005G184400--Sobic005G184600 Sobic005G184400--Sobic007G049000 Sobic005G184400--Sobic006G142850 Sobic005G184400--Sobic006G105300 Sobic005G184400--Sobic005G184500 Sobic005G184400--Sobic010G035000 Sobic005G184400--Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic009G007100 Sobic005G184400--Sobic005G185400
Octagon: transcription factors


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