Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G319050.1,Sobic.003G319050.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VZY9 , A0A1W0VZW8
Pfam -
Panther DB PTHR33157 PTHR33157:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g41770.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G007300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14962: WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2
3 Sobic.001G297700 expressed protein -
4 Sobic.007G199500 MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.004G071100 - -
6 Sobic.006G105300 expressed protein -
7 Sobic.008G184500 aspartic proteinase, putative, expressed -
8 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G029700 expressed protein -
10 Sobic.010G035000 - -
11 Sobic.005G184500 - -
12 Sobic.006G142850 - -
13 Sobic.009G057100 - -
14 Sobic.005G185400 - -
15 Sobic.005G227151 - -
16 Sobic.010G133150 - -
17 Sobic.008G184000 aspartic proteinase, putative, expressed -
18 Sobic.005G184600 - -
19 Sobic.005G184400 - -
20 Sobic.001G495700 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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