Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G029700.1
Synonym ULP1A
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XTU5
Pfam PF02902
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06910 : UB-like protease 1A
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g13750.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G184500 aspartic proteinase, putative, expressed -
2 Sobic.003G103100 - -
3 Sobic.002G105900 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G227151 - -
5 Sobic.003G319050 - -
6 Sobic.008G184000 aspartic proteinase, putative, expressed -
7 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G007300 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14962: WDR82, SWD2, COMPASS component SWD2
9 Sobic.003G099900 expressed protein -
10 Sobic.005G052200 expressed protein -
11 Sobic.007G199500 MBTB30 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.007G196100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11844: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45
13 Sobic.010G133150 - -
14 Sobic.004G114700 - -
15 Sobic.002G273000 OsFBL7 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
16 Sobic.006G142850 - -
17 Sobic.005G124400 - -
18 Sobic.001G269650 - -
19 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic004G029700--Sobic008G184500 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic004G029700--Sobic003G103100 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic004G029700--Sobic002G105900 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic004G029700--Sobic005G227151 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic004G029700--Sobic003G319050 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic004G029700--Sobic008G184000 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic004G029700--Sobic002G097100 Sobic002G007300 Sobic002G007300 Sobic004G029700--Sobic002G007300 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic004G029700--Sobic003G099900 Sobic008G184500--Sobic004G029700 Sobic008G184500--Sobic003G103100 Sobic008G184500--Sobic002G105900 Sobic008G184500--Sobic003G319050 Sobic008G184500--Sobic005G227151 Sobic008G184500--Sobic008G184000 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic008G184500--Sobic005G176875 Sobic008G184500--Sobic002G097100 Sobic008G184500--Sobic002G007300 Sobic003G103100--Sobic004G029700 Sobic003G103100--Sobic008G184500 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic003G103100--Sobic005G052200 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic003G103100--Sobic005G042400 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic003G103100--Sobic004G114700 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic003G103100--Sobic005G124400 Sobic003G103100--Sobic008G184000 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic003G103100--Sobic009G062300 Sobic003G103100--Sobic002G105900 Sobic002G105900--Sobic005G227151 Sobic002G105900--Sobic003G099900 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic002G105900--Sobic007G196100 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic002G105900--Sobic004G207500 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic002G105900--Sobic003G326300 Sobic002G105900--Sobic004G029700 Sobic002G105900--Sobic008G184500 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic002G105900--Sobic002G273000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic002G105900--Sobic006G142850 Sobic005G227151--Sobic002G105900 Sobic005G227151--Sobic003G099900 Sobic005G227151--Sobic004G207500 Sobic005G227151--Sobic007G196100 Sobic005G227151--Sobic003G326300 Sobic005G227151--Sobic006G142850 Sobic005G227151--Sobic004G029700 Sobic005G227151--Sobic008G184500 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G227151--Sobic005G186250 Sobic003G319050--Sobic002G097100 Sobic003G319050--Sobic002G007300 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic003G319050--Sobic001G297700 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic003G319050--Sobic007G199500 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic003G319050--Sobic004G071100 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic003G319050--Sobic006G105300 Sobic003G319050--Sobic008G184500 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic003G319050--Sobic002G015500 Sobic003G319050--Sobic004G029700 Sobic008G184000--Sobic004G029700 Sobic008G184000--Sobic005G227151 Sobic008G184000--Sobic008G184500 Sobic008G184000--Sobic002G105900 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic008G184000--Sobic007G131100 Sobic008G184000--Sobic003G319050 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic008G184000--Sobic010G035000 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic008G184000--Sobic007G025100 Sobic008G184000--Sobic001G297700 Sobic002G097100--Sobic002G015500 Sobic002G097100--Sobic003G319050 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic002G097100--Sobic001G495700 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic002G097100--Sobic010G133150 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic002G097100--Sobic009G057100 Sobic002G097100--Sobic007G199500 Sobic002G097100--Sobic004G071100 Sobic002G097100--Sobic002G007300 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic002G097100--Sobic005G147500 Sobic002G007300--Sobic003G319050 Sobic002G007300--Sobic002G097100 Sobic002G007300--Sobic006G105300 Sobic002G007300--Sobic001G297700 Sobic002G007300--Sobic004G071100 Sobic002G007300--Sobic002G015500 Sobic002G007300--Sobic007G199500 Sobic002G007300--Sobic009G057100 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic002G007300--Sobic005G033400 Sobic003G099900--Sobic005G227151 Sobic003G099900--Sobic002G105900 Sobic003G099900--Sobic004G207500 Sobic003G099900--Sobic007G196100 Sobic003G099900--Sobic003G326300 Sobic003G099900--Sobic006G142850 Sobic003G099900--Sobic005G186250 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic003G099900--Sobic005G189000 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic003G099900--Sobic009G007100
Octagon: transcription factors


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