Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G142850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5REC3
Pfam PF02902
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06910 : UB-like protease 1A
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g25680.1 : ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G049000 OsFBX382 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G184600 - -
3 Sobic.005G184400 - -
4 Sobic.005G186250 - -
5 Sobic.006G105300 expressed protein -
6 Sobic.009G007100 glutelin, putative, expressed -
7 Sobic.010G035000 - -
8 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
9 Sobic.005G184500 - -
10 Sobic.005G227151 - -
11 Sobic.001G297700 expressed protein -
12 Sobic.005G185400 - -
13 Sobic.002G105900 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G319050 - -
15 Sobic.003G099900 expressed protein -
16 Sobic.005G189000 - -
17 Sobic.002G358000 transmembrane receptor, putative, expressed -
18 Sobic.005G205800 ATXR, putative, expressed -
19 Sobic.008G082300 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
20 Sobic.007G131100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase


Gene co-expression network
sample Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic006G142850--Sobic007G049000 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic006G142850--Sobic005G184600 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic006G142850--Sobic005G184400 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic006G142850--Sobic005G186250 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic006G142850--Sobic006G105300 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic006G142850--Sobic009G007100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic006G142850--Sobic010G035000 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic004G207500 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic006G142850--Sobic005G184500 Sobic007G049000--Sobic005G184600 Sobic007G049000--Sobic005G184400 Sobic007G049000--Sobic006G142850 Sobic007G049000--Sobic005G186250 Sobic007G049000--Sobic006G105300 Sobic007G049000--Sobic009G007100 Sobic007G049000--Sobic005G184500 Sobic007G049000--Sobic010G035000 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic007G049000--Sobic005G185400 Sobic005G184600--Sobic005G184400 Sobic005G184600--Sobic007G049000 Sobic005G184600--Sobic006G142850 Sobic005G184600--Sobic006G105300 Sobic005G184600--Sobic005G184500 Sobic005G184600--Sobic005G186250 Sobic005G184600--Sobic010G035000 Sobic005G184600--Sobic009G007100 Sobic005G184600--Sobic005G185400 Sobic005G184400--Sobic005G184600 Sobic005G184400--Sobic007G049000 Sobic005G184400--Sobic006G142850 Sobic005G184400--Sobic006G105300 Sobic005G184400--Sobic005G184500 Sobic005G184400--Sobic010G035000 Sobic005G184400--Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic009G007100 Sobic005G184400--Sobic005G185400 Sobic005G186250--Sobic009G007100 Sobic005G186250--Sobic007G049000 Sobic005G186250--Sobic006G142850 Sobic005G186250--Sobic004G207500 Sobic005G186250--Sobic005G184400 Sobic005G186250--Sobic005G184600 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic005G186250--Sobic005G189000 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic005G186250--Sobic005G083220 Sobic005G186250--Sobic006G105300 Sobic006G105300--Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic005G184400 Sobic006G105300--Sobic005G184600 Sobic006G105300--Sobic005G184500 Sobic006G105300--Sobic007G049000 Sobic006G105300--Sobic006G142850 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic006G105300--Sobic001G297700 Sobic006G105300--Sobic005G185400 Sobic006G105300--Sobic009G007100 Sobic009G007100--Sobic005G186250 Sobic009G007100--Sobic007G049000 Sobic009G007100--Sobic005G184400 Sobic009G007100--Sobic006G142850 Sobic009G007100--Sobic005G184600 Sobic009G007100--Sobic004G207500 Sobic009G007100--Sobic005G189000 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic009G007100--Sobic002G358000 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic009G007100--Sobic008G082300 Sobic010G035000--Sobic006G105300 Sobic010G035000--Sobic001G297700 Sobic010G035000--Sobic005G184400 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic010G035000--Sobic007G131100 Sobic010G035000--Sobic005G184600 Sobic010G035000--Sobic005G184500 Sobic010G035000--Sobic007G049000 Sobic010G035000--Sobic006G142850 Sobic010G035000--Sobic005G185400 Sobic004G207500--Sobic005G186250 Sobic004G207500--Sobic009G007100 Sobic004G207500--Sobic005G189000 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic004G207500--Sobic005G227151 Sobic004G207500--Sobic006G142850 Sobic004G207500--Sobic005G083220 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic004G207500--Sobic002G105900 Sobic004G207500--Sobic007G049000 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic004G207500--Sobic003G099900 Sobic005G184500--Sobic005G185400 Sobic005G184500--Sobic006G105300 Sobic005G184500--Sobic005G184600 Sobic005G184500--Sobic005G184400 Sobic005G184500--Sobic007G049000 Sobic005G184500--Sobic010G035000 Sobic005G184500--Sobic001G297700 Sobic005G184500--Sobic006G142850 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic005G184500--Sobic010G031400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.