Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G207500.1
Synonym Sb04g025300
Functional annotation GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
UniProt C5XX67
Pfam PF00657
Panther DB PTHR22835 PTHR22835:SF194
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016788; hydrolase activity, acting on ester bonds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G28610 : GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g39590.1 : GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021259
Brachypodium KQK00237
Barley HORVU1Hr1G061910.1 , HORVU1Hr1G061910.2
Wheat TraesCS1D02G250200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G207500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G086100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase


Gene co-expression network
sample Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic004G207500--Sobic005G186250 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic004G207500--Sobic009G007100 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic004G207500--Sobic005G189000 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic004G207500--Sobic005G227151 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic004G207500--Sobic006G142850 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic004G207500--Sobic005G083220 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic004G207500--Sobic002G105900 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic004G207500--Sobic007G049000 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic004G207500--Sobic003G099900 Sobic005G186250--Sobic009G007100 Sobic005G186250--Sobic007G049000 Sobic005G186250--Sobic006G142850 Sobic005G186250--Sobic004G207500 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic005G186250--Sobic005G184400 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic005G186250--Sobic005G184600 Sobic005G186250--Sobic005G189000 Sobic005G186250--Sobic005G083220 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic005G186250--Sobic006G105300 Sobic009G007100--Sobic005G186250 Sobic009G007100--Sobic007G049000 Sobic009G007100--Sobic005G184400 Sobic009G007100--Sobic006G142850 Sobic009G007100--Sobic005G184600 Sobic009G007100--Sobic004G207500 Sobic009G007100--Sobic005G189000 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic009G007100--Sobic002G358000 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic009G007100--Sobic008G082300 Sobic005G189000--Sobic005G083220 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic005G189000--Sobic008G144201 Sobic005G189000--Sobic004G207500 Sobic005G189000--Sobic005G186250 Sobic005G189000--Sobic009G007100 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic005G189000--Sobic003G415200 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic005G189000--Sobic009G086100 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G189000--Sobic009G019700 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic005G189000--Sobic003G326300 Sobic005G227151--Sobic002G105900 Sobic005G227151--Sobic003G099900 Sobic005G227151--Sobic004G207500 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic005G227151--Sobic007G196100 Sobic005G227151--Sobic003G326300 Sobic005G227151--Sobic006G142850 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic005G227151--Sobic004G029700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic005G227151--Sobic008G184500 Sobic005G227151--Sobic005G186250 Sobic006G142850--Sobic007G049000 Sobic006G142850--Sobic005G184600 Sobic006G142850--Sobic005G184400 Sobic006G142850--Sobic005G186250 Sobic006G142850--Sobic006G105300 Sobic006G142850--Sobic009G007100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic006G142850--Sobic010G035000 Sobic006G142850--Sobic004G207500 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic006G142850--Sobic005G184500 Sobic005G083220--Sobic005G189000 Sobic005G083220--Sobic008G144201 Sobic005G083220--Sobic003G415200 Sobic005G083220--Sobic004G207500 Sobic005G083220--Sobic009G086100 Sobic005G083220--Sobic009G019700 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic005G083220--Sobic005G148100 Sobic005G083220--Sobic005G186250 Sobic005G083220--Sobic009G007100 Sobic002G105900--Sobic005G227151 Sobic002G105900--Sobic003G099900 Sobic002G105900--Sobic007G196100 Sobic002G105900--Sobic004G207500 Sobic002G105900--Sobic003G326300 Sobic002G105900--Sobic004G029700 Sobic002G105900--Sobic008G184500 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic002G105900--Sobic002G273000 Sobic002G105900--Sobic006G142850 Sobic007G049000--Sobic005G184600 Sobic007G049000--Sobic005G184400 Sobic007G049000--Sobic006G142850 Sobic007G049000--Sobic005G186250 Sobic007G049000--Sobic006G105300 Sobic007G049000--Sobic009G007100 Sobic007G049000--Sobic005G184500 Sobic007G049000--Sobic010G035000 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic007G049000--Sobic005G185400 Sobic003G099900--Sobic005G227151 Sobic003G099900--Sobic002G105900 Sobic003G099900--Sobic004G207500 Sobic003G099900--Sobic007G196100 Sobic003G099900--Sobic003G326300 Sobic003G099900--Sobic006G142850 Sobic003G099900--Sobic005G186250 Sobic003G099900--Sobic005G189000 Sobic003G099900--Sobic009G007100
Octagon: transcription factors


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