Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G326300.1
Synonym Sb03g037220
Functional annotation LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt C5XMG8
Pfam PF14368
Panther DB PTHR33286 PTHR33286:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G30880 : Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g58660.1 : LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039845
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3D02G323200 , TraesCS3D02G323300
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G326300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G196100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11844: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45
2 Sobic.002G105900 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G415300 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
4 Sobic.005G227151 - -
5 Sobic.009G086100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
6 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
7 Sobic.003G099900 expressed protein -
8 Sobic.005G189000 - -
9 Sobic.005G146000 - -
10 Sobic.005G083220 - -
11 Sobic.008G188200 - -
12 Sobic.009G007100 glutelin, putative, expressed -
13 Sobic.008G144201 - -
14 Sobic.005G148100 - -
15 Sobic.003G415200 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
16 Sobic.004G132200 - -
17 Sobic.009G019700 - -
18 Sobic.008G082300 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
19 Sobic.005G189800 - -
20 Sobic.002G273000 OsFBL7 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic003G326300--Sobic007G196100 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic003G326300--Sobic002G105900 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic003G326300--Sobic003G415300 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic003G326300--Sobic005G227151 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic003G326300--Sobic009G086100 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic003G326300--Sobic004G207500 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic003G326300--Sobic003G099900 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic003G326300--Sobic005G189000 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic003G326300--Sobic005G146000 Sobic007G196100--Sobic003G326300 Sobic007G196100--Sobic005G146000 Sobic007G196100--Sobic002G105900 Sobic007G196100--Sobic005G227151 Sobic004G132200 Sobic004G132200 Sobic007G196100--Sobic004G132200 Sobic007G196100--Sobic003G099900 Sobic007G196100--Sobic004G207500 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic007G196100--Sobic005G083220 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic007G196100--Sobic005G148100 Sobic002G105900--Sobic005G227151 Sobic002G105900--Sobic003G099900 Sobic002G105900--Sobic007G196100 Sobic002G105900--Sobic004G207500 Sobic002G105900--Sobic003G326300 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic002G105900--Sobic004G029700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic002G105900--Sobic008G184500 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic002G105900--Sobic002G273000 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic002G105900--Sobic006G142850 Sobic005G178200 Sobic005G178200 Sobic003G415300--Sobic005G178200 Sobic003G415300--Sobic009G086100 Sobic003G415300--Sobic003G326300 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic003G415300--Sobic008G188200 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic003G415300--Sobic010G195301 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic003G415300--Sobic008G082300 Sobic003G415300--Sobic005G189000 Sobic003G415300--Sobic005G083220 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic003G415300--Sobic002G358000 Sobic005G227151--Sobic002G105900 Sobic005G227151--Sobic003G099900 Sobic005G227151--Sobic004G207500 Sobic005G227151--Sobic007G196100 Sobic005G227151--Sobic003G326300 Sobic005G227151--Sobic006G142850 Sobic005G227151--Sobic004G029700 Sobic005G227151--Sobic008G184500 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G227151--Sobic005G186250 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic009G086100--Sobic009G019700 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic009G086100--Sobic003G415200 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic009G086100--Sobic005G189800 Sobic009G086100--Sobic003G415300 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic009G086100--Sobic008G144201 Sobic009G086100--Sobic005G148100 Sobic009G086100--Sobic005G083220 Sobic009G086100--Sobic005G189000 Sobic009G086100--Sobic003G326300 Sobic004G207500--Sobic005G186250 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic004G207500--Sobic009G007100 Sobic004G207500--Sobic005G189000 Sobic004G207500--Sobic005G227151 Sobic004G207500--Sobic006G142850 Sobic004G207500--Sobic005G083220 Sobic004G207500--Sobic002G105900 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic004G207500--Sobic007G049000 Sobic004G207500--Sobic003G099900 Sobic003G099900--Sobic005G227151 Sobic003G099900--Sobic002G105900 Sobic003G099900--Sobic004G207500 Sobic003G099900--Sobic007G196100 Sobic003G099900--Sobic003G326300 Sobic003G099900--Sobic006G142850 Sobic003G099900--Sobic005G186250 Sobic003G099900--Sobic005G189000 Sobic003G099900--Sobic009G007100 Sobic005G189000--Sobic005G083220 Sobic005G189000--Sobic008G144201 Sobic005G189000--Sobic004G207500 Sobic005G189000--Sobic005G186250 Sobic005G189000--Sobic009G007100 Sobic005G189000--Sobic003G415200 Sobic005G189000--Sobic009G086100 Sobic005G189000--Sobic009G019700 Sobic005G189000--Sobic003G326300 Sobic005G146000--Sobic004G132200 Sobic005G146000--Sobic007G196100 Sobic005G148201 Sobic005G148201 Sobic005G146000--Sobic005G148201 Sobic005G146000--Sobic005G148100 Sobic005G150000 Sobic005G150000 Sobic005G146000--Sobic005G150000 Sobic005G146000--Sobic003G326300 Sobic005G146000--Sobic005G189800 Sobic005G146000--Sobic009G019700 Sobic004G316300 Sobic004G316300 Sobic005G146000--Sobic004G316300
Octagon: transcription factors


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