Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G415300.1
Synonym PDF1.5
Functional annotation DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6Q825
Pfam PF00304
Panther DB PTHR33147 PTHR33147:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G55010 : plant defensin 1.5
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g70680.1 : DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G415300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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15 Sobic.005G058500 - -
16 Sobic.005G148100 - -
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19 Sobic.005G186250 - -
20 Sobic.008G181250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic005G178200 Sobic005G178200 Sobic003G415300--Sobic005G178200 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic003G415300--Sobic009G086100 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic003G415300--Sobic003G326300 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic003G415300--Sobic008G188200 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic003G415300--Sobic010G195301 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic003G415300--Sobic008G082300 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic003G415300--Sobic005G189000 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic003G415300--Sobic005G083220 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic003G415300--Sobic002G358000 Sobic005G178200--Sobic003G415300 Sobic005G178200--Sobic008G188200 Sobic005G178200--Sobic010G195301 Sobic005G058500 Sobic005G058500 Sobic005G178200--Sobic005G058500 Sobic005G178200--Sobic009G086100 Sobic004G354500 Sobic004G354500 Sobic005G178200--Sobic004G354500 Sobic005G178200--Sobic003G326300 Sobic005G178200--Sobic008G082300 Sobic008G069200 Sobic008G069200 Sobic005G178200--Sobic008G069200 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic009G086100--Sobic009G019700 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic009G086100--Sobic003G415200 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic009G086100--Sobic005G189800 Sobic009G086100--Sobic003G415300 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic009G086100--Sobic008G144201 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic009G086100--Sobic005G148100 Sobic009G086100--Sobic005G083220 Sobic009G086100--Sobic005G189000 Sobic009G086100--Sobic003G326300 Sobic007G196100 Sobic007G196100 Sobic003G326300--Sobic007G196100 Sobic002G105900 Sobic002G105900 Sobic003G326300--Sobic002G105900 Sobic003G326300--Sobic003G415300 Sobic005G227151 Sobic005G227151 Sobic003G326300--Sobic005G227151 Sobic003G326300--Sobic009G086100 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic003G326300--Sobic004G207500 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic003G326300--Sobic003G099900 Sobic003G326300--Sobic005G189000 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic003G326300--Sobic005G146000 Sobic008G188200--Sobic008G069200 Sobic008G188200--Sobic005G178200 Sobic008G188200--Sobic003G415300 Sobic008G188200--Sobic003G326300 Sobic008G188200--Sobic005G058500 Sobic008G188200--Sobic008G082300 Sobic008G188200--Sobic010G195301 Sobic008G188200--Sobic009G086100 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic008G188200--Sobic008G184000 Sobic010G195301--Sobic003G415300 Sobic010G195301--Sobic005G178200 Sobic010G195301--Sobic009G086100 Sobic010G195301--Sobic008G188200 Sobic010G195301--Sobic008G082300 Sobic010G195301--Sobic003G326300 Sobic010G195301--Sobic002G358000 Sobic010G195301--Sobic005G189000 Sobic010G195301--Sobic008G144201 Sobic008G082300--Sobic002G358000 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic008G082300--Sobic007G131100 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic008G082300--Sobic009G007100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic008G082300--Sobic010G035000 Sobic008G082300--Sobic003G415300 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic008G082300--Sobic005G184400 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic008G082300--Sobic006G105300 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic008G082300--Sobic005G186250 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic008G082300--Sobic005G184600 Sobic005G189000--Sobic005G083220 Sobic005G189000--Sobic008G144201 Sobic005G189000--Sobic004G207500 Sobic005G189000--Sobic005G186250 Sobic005G189000--Sobic009G007100 Sobic005G189000--Sobic003G415200 Sobic005G189000--Sobic009G086100 Sobic005G189000--Sobic009G019700 Sobic005G189000--Sobic003G326300 Sobic005G083220--Sobic005G189000 Sobic005G083220--Sobic008G144201 Sobic005G083220--Sobic003G415200 Sobic005G083220--Sobic004G207500 Sobic005G083220--Sobic009G086100 Sobic005G083220--Sobic009G019700 Sobic005G083220--Sobic005G148100 Sobic005G083220--Sobic005G186250 Sobic005G083220--Sobic009G007100 Sobic002G358000--Sobic008G082300 Sobic002G358000--Sobic009G007100 Sobic002G358000--Sobic007G131100 Sobic002G358000--Sobic010G035000 Sobic002G358000--Sobic005G184400 Sobic002G358000--Sobic005G186250 Sobic002G358000--Sobic005G184600 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic002G358000--Sobic006G142850 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic002G358000--Sobic007G049000
Octagon: transcription factors


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