Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G040101.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RC29
Pfam PF03004
Panther DB PTHR33063:SF5 PTHR33063
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g37230.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G059500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G300900 - -
3 Sobic.007G025100 expressed protein -
4 Sobic.005G035500 expressed protein -
5 Sobic.003G266100 ESP4, putative, expressed K06100: symplekin
6 Sobic.001G297700 expressed protein -
7 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G172200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.006G004100 no apical meristem protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G082300 - -
11 Sobic.007G131100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
12 Sobic.008G159300 KUN1 - Kunitz-type trypsin inhibitor precursor, expressed -
13 Sobic.002G015400 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G294800 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G031400 early nodulin 93 ENOD93 protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G058900 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G188800 - -
18 Sobic.010G035000 - -
19 Sobic.005G185400 - -
20 Sobic.002G172100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic006G040101--Sobic002G059500 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic006G040101--Sobic002G300900 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic006G040101--Sobic007G025100 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic006G040101--Sobic005G035500 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic006G040101--Sobic003G266100 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic006G040101--Sobic001G297700 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic006G040101--Sobic001G511400 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic006G040101--Sobic002G172200 Sobic006G004100 Sobic006G004100 Sobic006G040101--Sobic006G004100 Sobic002G059500--Sobic006G040101 Sobic002G059500--Sobic002G300900 Sobic002G059500--Sobic003G266100 Sobic002G059500--Sobic005G035500 Sobic002G059500--Sobic006G004100 Sobic002G059500--Sobic007G025100 Sobic002G059500--Sobic001G511400 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic002G059500--Sobic008G159300 Sobic002G059500--Sobic002G172200 Sobic002G300900--Sobic007G025100 Sobic002G300900--Sobic006G040101 Sobic002G300900--Sobic002G059500 Sobic002G300900--Sobic001G297700 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic002G300900--Sobic007G131100 Sobic002G300900--Sobic001G511400 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic002G300900--Sobic010G035000 Sobic002G300900--Sobic002G172200 Sobic002G300900--Sobic003G266100 Sobic007G025100--Sobic002G300900 Sobic007G025100--Sobic007G131100 Sobic007G025100--Sobic001G297700 Sobic007G025100--Sobic006G040101 Sobic007G025100--Sobic010G035000 Sobic007G025100--Sobic002G059500 Sobic007G025100--Sobic005G035500 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic007G025100--Sobic006G105300 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic007G025100--Sobic008G082300 Sobic005G035500--Sobic002G059500 Sobic005G035500--Sobic006G040101 Sobic005G035500--Sobic007G025100 Sobic005G035500--Sobic002G300900 Sobic005G035500--Sobic006G004100 Sobic010G111400 Sobic010G111400 Sobic005G035500--Sobic010G111400 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic005G035500--Sobic002G058900 Sobic005G035500--Sobic007G131100 Sobic005G035500--Sobic003G266100 Sobic003G266100--Sobic002G172200 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic003G266100--Sobic004G220900 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic003G266100--Sobic002G172100 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic003G266100--Sobic003G294800 Sobic003G266100--Sobic008G159300 Sobic003G266100--Sobic006G004100 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic003G266100--Sobic005G082300 Sobic003G266100--Sobic002G059500 Sobic003G266100--Sobic001G511400 Sobic001G297700--Sobic010G035000 Sobic001G297700--Sobic006G105300 Sobic001G297700--Sobic007G025100 Sobic001G297700--Sobic002G300900 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic001G297700--Sobic005G184500 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic005G185400 Sobic001G297700--Sobic007G131100 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic001G297700--Sobic003G319050 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic001G297700--Sobic005G184400 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic001G511400--Sobic002G015400 Sobic001G511400--Sobic002G172200 Sobic001G511400--Sobic008G159300 Sobic001G511400--Sobic002G172100 Sobic001G511400--Sobic003G266100 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic001G511400--Sobic005G147500 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic001G511400--Sobic001G284700 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic001G511400--Sobic009G058300 Sobic001G511400--Sobic005G082300 Sobic002G172200--Sobic005G082300 Sobic002G172200--Sobic002G172100 Sobic002G172200--Sobic003G266100 Sobic002G172200--Sobic001G511400 Sobic002G172200--Sobic003G294800 Sobic002G172200--Sobic005G147500 Sobic002G172200--Sobic002G015400 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic002G172200--Sobic005G188800 Sobic002G172200--Sobic001G284700 Sobic006G004100--Sobic004G220900 Sobic006G004100--Sobic003G266100 Sobic006G004100--Sobic002G059500 Sobic005G197000 Sobic005G197000 Sobic006G004100--Sobic005G197000 Sobic006G004100--Sobic002G058900 Sobic007G037200 Sobic007G037200 Sobic006G004100--Sobic007G037200 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic006G004100--Sobic002G217000 Sobic006G004100--Sobic008G159300 Sobic006G004100--Sobic006G040101
Octagon: transcription factors


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