Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G172200.1
Synonym Sb02g022120, HSL1
Functional annotation receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed
UniProt C5X9V5
Pfam PF08263 PF00560 PF13855 PF00069
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF218
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G28440 : HAESA-like 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g15700.1 : receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a046499
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.002G172200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G082300 - -
2 Sobic.002G172100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.003G266100 ESP4, putative, expressed K06100: symplekin
4 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G294800 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G147500 - -
7 Sobic.002G015400 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G188800 - -
9 Sobic.001G284700 - -
10 Sobic.008G159300 KUN1 - Kunitz-type trypsin inhibitor precursor, expressed -
11 Sobic.009G057100 - -
12 Sobic.008G109600 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G058300 expressed protein -
14 Sobic.006G264800 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
15 Sobic.002G059500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.006G081400 - -
17 Sobic.006G040101 - -
18 Sobic.004G220900 ethylene-insensitive protein 2, putative, expressed -
19 Sobic.009G112200 OsFBX361 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G300900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic002G172200--Sobic005G082300 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic002G172200--Sobic002G172100 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G172200--Sobic003G266100 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G172200--Sobic001G511400 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic002G172200--Sobic003G294800 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic002G172200--Sobic005G147500 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic002G172200--Sobic002G015400 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic002G172200--Sobic005G188800 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic002G172200--Sobic001G284700 Sobic005G082300--Sobic002G172200 Sobic005G082300--Sobic003G294800 Sobic005G082300--Sobic002G172100 Sobic005G082300--Sobic005G188800 Sobic005G082300--Sobic003G266100 Sobic005G082300--Sobic005G147500 Sobic005G082300--Sobic001G511400 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic005G082300--Sobic009G057100 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G082300--Sobic006G081400 Sobic002G172100--Sobic003G294800 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic005G147500 Sobic002G172100--Sobic005G082300 Sobic002G172100--Sobic003G266100 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic001G284700 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic002G172100--Sobic001G274025 Sobic003G266100--Sobic002G172200 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic003G266100--Sobic004G220900 Sobic003G266100--Sobic002G172100 Sobic003G266100--Sobic003G294800 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic003G266100--Sobic008G159300 Sobic006G004100 Sobic006G004100 Sobic003G266100--Sobic006G004100 Sobic003G266100--Sobic005G082300 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic003G266100--Sobic002G059500 Sobic003G266100--Sobic001G511400 Sobic001G511400--Sobic002G015400 Sobic001G511400--Sobic002G172200 Sobic001G511400--Sobic008G159300 Sobic001G511400--Sobic002G172100 Sobic001G511400--Sobic003G266100 Sobic001G511400--Sobic005G147500 Sobic001G511400--Sobic001G284700 Sobic001G511400--Sobic009G058300 Sobic001G511400--Sobic005G082300 Sobic003G294800--Sobic005G188800 Sobic003G294800--Sobic002G172100 Sobic003G294800--Sobic005G082300 Sobic003G294800--Sobic005G147500 Sobic003G294800--Sobic006G264800 Sobic003G294800--Sobic003G266100 Sobic003G294800--Sobic002G172200 Sobic003G294800--Sobic001G274025 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic003G294800--Sobic008G109600 Sobic005G147500--Sobic009G057100 Sobic005G147500--Sobic005G188800 Sobic005G147500--Sobic001G284700 Sobic005G147500--Sobic006G081400 Sobic005G147500--Sobic002G172100 Sobic005G147500--Sobic003G294800 Sobic005G147500--Sobic009G058300 Sobic005G147500--Sobic002G172200 Sobic005G147500--Sobic005G082300 Sobic002G015400--Sobic008G159300 Sobic002G015400--Sobic001G511400 Sobic002G015400--Sobic003G266100 Sobic002G015400--Sobic002G172200 Sobic002G015400--Sobic002G172100 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic002G015400--Sobic002G058900 Sobic002G015400--Sobic009G058300 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic002G015400--Sobic001G495700 Sobic002G015400--Sobic002G059500 Sobic005G188800--Sobic003G294800 Sobic005G188800--Sobic006G081400 Sobic005G188800--Sobic005G147500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic005G188800--Sobic004G029800 Sobic005G188800--Sobic009G057100 Sobic005G188800--Sobic005G082300 Sobic005G188800--Sobic002G172100 Sobic005G188800--Sobic008G109600 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic005G188800--Sobic005G033400 Sobic001G284700--Sobic005G147500 Sobic001G284700--Sobic009G058300 Sobic001G284700--Sobic002G172100 Sobic001G284700--Sobic006G264800 Sobic001G284700--Sobic009G057100 Sobic001G284700--Sobic001G511400 Sobic001G284700--Sobic003G294800 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic001G284700--Sobic009G112200 Sobic001G284700--Sobic005G188800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.