Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G058300.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P736
Pfam PF07797
Panther DB PTHR33130 PTHR33130:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G60410 : Protein of unknown function (DUF1639)
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G058300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G108300 expressed protein -
2 Sobic.001G284700 - -
3 Sobic.002G172100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.005G147500 - -
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6 Sobic.006G264800 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
7 Sobic.008G088900 hypothetical protein -
8 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G015400 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G489075 - -
11 Sobic.002G172200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.005G174200 - -
13 Sobic.009G057100 - -
14 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
15 Sobic.008G184100 aspartic proteinase, putative, expressed -
16 Sobic.009G112200 OsFBX361 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G091500 expressed protein -
18 Sobic.003G294800 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G274025 - -
20 Sobic.005G082300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic009G058300--Sobic002G108300 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic009G058300--Sobic001G284700 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic009G058300--Sobic002G172100 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic009G058300--Sobic005G147500 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic009G058300--Sobic007G032500 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic009G058300--Sobic006G264800 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic009G058300--Sobic008G088900 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic009G058300--Sobic001G511400 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic009G058300--Sobic002G015400 Sobic002G108300--Sobic008G088900 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic002G108300--Sobic003G091500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic002G108300--Sobic008G184100 Sobic002G108300--Sobic009G058300 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic002G108300--Sobic001G489075 Sobic002G108300--Sobic007G032500 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic002G108300--Sobic004G171600 Sobic005G146966 Sobic005G146966 Sobic002G108300--Sobic005G146966 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic002G108300--Sobic005G174000 Sobic001G284700--Sobic005G147500 Sobic001G284700--Sobic009G058300 Sobic001G284700--Sobic002G172100 Sobic001G284700--Sobic006G264800 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic001G284700--Sobic009G057100 Sobic001G284700--Sobic001G511400 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic001G284700--Sobic003G294800 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic001G284700--Sobic009G112200 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic001G284700--Sobic005G188800 Sobic002G172100--Sobic003G294800 Sobic002G172100--Sobic006G264800 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic005G147500 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic002G172100--Sobic005G082300 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic001G284700 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic002G172100--Sobic001G274025 Sobic005G147500--Sobic009G057100 Sobic005G147500--Sobic005G188800 Sobic005G147500--Sobic001G284700 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G147500--Sobic006G081400 Sobic005G147500--Sobic002G172100 Sobic005G147500--Sobic003G294800 Sobic005G147500--Sobic009G058300 Sobic005G147500--Sobic002G172200 Sobic005G147500--Sobic005G082300 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic007G032500--Sobic005G174200 Sobic007G032500--Sobic009G058300 Sobic007G032500--Sobic002G108300 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic007G032500--Sobic001G495700 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic007G032500--Sobic002G015500 Sobic007G032500--Sobic008G088900 Sobic007G032500--Sobic002G015400 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic007G032500--Sobic010G133150 Sobic001G374600 Sobic001G374600 Sobic007G032500--Sobic001G374600 Sobic006G264800--Sobic001G274025 Sobic006G264800--Sobic002G172100 Sobic009G021400 Sobic009G021400 Sobic006G264800--Sobic009G021400 Sobic006G264800--Sobic001G489075 Sobic006G264800--Sobic003G294800 Sobic006G264800--Sobic009G112200 Sobic003G106400 Sobic003G106400 Sobic006G264800--Sobic003G106400 Sobic006G264800--Sobic009G058300 Sobic006G264800--Sobic001G284700 Sobic008G088900--Sobic002G108300 Sobic008G088900--Sobic003G091500 Sobic008G088900--Sobic008G184100 Sobic008G088900--Sobic004G171600 Sobic008G088900--Sobic001G489075 Sobic008G088900--Sobic005G174000 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic008G088900--Sobic005G077900 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic008G088900--Sobic002G007700 Sobic008G088900--Sobic005G146966 Sobic001G511400--Sobic002G015400 Sobic001G511400--Sobic002G172200 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic001G511400--Sobic008G159300 Sobic001G511400--Sobic002G172100 Sobic001G511400--Sobic003G266100 Sobic001G511400--Sobic005G147500 Sobic001G511400--Sobic001G284700 Sobic001G511400--Sobic009G058300 Sobic001G511400--Sobic005G082300 Sobic002G015400--Sobic008G159300 Sobic002G015400--Sobic001G511400 Sobic002G015400--Sobic003G266100 Sobic002G015400--Sobic002G172200 Sobic002G015400--Sobic002G172100 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic002G015400--Sobic002G058900 Sobic002G015400--Sobic009G058300 Sobic002G015400--Sobic001G495700 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic002G015400--Sobic002G059500
Octagon: transcription factors


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