Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G109600.1
Synonym Sb08g016390
Functional annotation oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed
UniProt C5YP38
Pfam PF14226 PF03171
Panther DB PTHR10209:SF220 PTHR10209
NCBI CDD KOG0143; Iron/ascorbate family oxidoreductases
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G10500 : 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g07410.2 : oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3D02G437500 , TraesCS3D02G437500 , TraesCS6D02G000600 , TraesCS3B02G479500 , TraesCS3B02G486500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G109600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic008G109600--Sobic003G294800 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic008G109600--Sobic005G188800 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic008G109600--Sobic002G172100 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic008G109600--Sobic003G266100 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic008G109600--Sobic006G264800 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic008G109600--Sobic002G172200 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic008G109600--Sobic001G274025 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic008G109600--Sobic005G082300 Sobic009G021400 Sobic009G021400 Sobic008G109600--Sobic009G021400 Sobic003G294800--Sobic005G188800 Sobic003G294800--Sobic002G172100 Sobic003G294800--Sobic005G082300 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic003G294800--Sobic005G147500 Sobic003G294800--Sobic006G264800 Sobic003G294800--Sobic003G266100 Sobic003G294800--Sobic002G172200 Sobic003G294800--Sobic001G274025 Sobic003G294800--Sobic008G109600 Sobic005G188800--Sobic003G294800 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic005G188800--Sobic006G081400 Sobic005G188800--Sobic005G147500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic005G188800--Sobic004G029800 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic005G188800--Sobic009G057100 Sobic005G188800--Sobic005G082300 Sobic005G188800--Sobic002G172100 Sobic005G188800--Sobic008G109600 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic005G188800--Sobic005G033400 Sobic002G172100--Sobic003G294800 Sobic002G172100--Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic005G147500 Sobic002G172100--Sobic005G082300 Sobic002G172100--Sobic003G266100 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic009G058300 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic002G172100--Sobic001G284700 Sobic002G172100--Sobic001G274025 Sobic003G266100--Sobic002G172200 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic003G266100--Sobic004G220900 Sobic003G266100--Sobic002G172100 Sobic003G266100--Sobic003G294800 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic003G266100--Sobic008G159300 Sobic006G004100 Sobic006G004100 Sobic003G266100--Sobic006G004100 Sobic003G266100--Sobic005G082300 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic003G266100--Sobic002G059500 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic003G266100--Sobic001G511400 Sobic006G264800--Sobic001G274025 Sobic006G264800--Sobic002G172100 Sobic006G264800--Sobic009G021400 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic006G264800--Sobic001G489075 Sobic006G264800--Sobic003G294800 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic006G264800--Sobic009G112200 Sobic003G106400 Sobic003G106400 Sobic006G264800--Sobic003G106400 Sobic006G264800--Sobic009G058300 Sobic006G264800--Sobic001G284700 Sobic002G172200--Sobic005G082300 Sobic002G172200--Sobic002G172100 Sobic002G172200--Sobic003G266100 Sobic002G172200--Sobic001G511400 Sobic002G172200--Sobic003G294800 Sobic002G172200--Sobic005G147500 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic002G172200--Sobic002G015400 Sobic002G172200--Sobic005G188800 Sobic002G172200--Sobic001G284700 Sobic001G274025--Sobic006G264800 Sobic001G274025--Sobic009G021400 Sobic001G274025--Sobic003G106400 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic001G274025--Sobic002G409300 Sobic001G274025--Sobic003G294800 Sobic001G274025--Sobic002G172100 Sobic001G274025--Sobic001G489075 Sobic001G274025--Sobic009G112200 Sobic001G274025--Sobic005G188800 Sobic005G082300--Sobic002G172200 Sobic005G082300--Sobic003G294800 Sobic005G082300--Sobic002G172100 Sobic005G082300--Sobic005G188800 Sobic005G082300--Sobic003G266100 Sobic005G082300--Sobic005G147500 Sobic005G082300--Sobic001G511400 Sobic005G082300--Sobic009G057100 Sobic005G082300--Sobic006G081400 Sobic009G021400--Sobic003G106400 Sobic009G021400--Sobic001G274025 Sobic009G021400--Sobic002G409300 Sobic009G021400--Sobic006G264800 Sobic009G021400--Sobic004G220900 Sobic009G021400--Sobic001G489075 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic009G021400--Sobic007G187100 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic009G021400--Sobic009G061900 Sobic009G021400--Sobic002G172100
Octagon: transcription factors


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