Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G171800.2,Sobic.005G171800.1,Sobic.005G171800.3
Synonym
Functional annotation OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PT24
Pfam PF03478
Panther DB PTHR33110 PTHR33110:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03390 : Protein of unknown function (DUF295)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g25140.1 : OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015836
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G037200 expressed protein -
2 Sobic.008G168400 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed K14494: DELLA protein
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6 Sobic.004G212350 - -
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9 Sobic.010G181900 expressed protein -
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11 Sobic.005G021100 - -
12 Sobic.001G129900 indole-3-acetate beta-glucosyltransferase, putative, expressed K13692: UDP-glucose:(indol-3-yl)acetate beta-D-glucosyltransferase
13 Sobic.005G079300 terpene synthase, putative, expressed -
14 Sobic.003G063900 - -
15 Sobic.003G106400 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
16 Sobic.009G052400 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
17 Sobic.008G031400 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
18 Sobic.004G133600 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@"ZmSWEET4c(Ortholog in maize:Sosso et al., 2015(PubMedID : 31659882)@Zhang et al., 2015)"(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
19 Sobic.001G392900 - -
20 Sobic.002G409300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G171800 Sobic005G171800 Sobic007G037200 Sobic007G037200 Sobic005G171800--Sobic007G037200 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic005G171800--Sobic008G168400 Sobic007G187100 Sobic007G187100 Sobic005G171800--Sobic007G187100 Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic005G171800--Sobic005G032500 Sobic009G061900 Sobic009G061900 Sobic005G171800--Sobic009G061900 Sobic004G212350 Sobic004G212350 Sobic005G171800--Sobic004G212350 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic005G171800--Sobic002G293100 Sobic002G100000 Sobic002G100000 Sobic005G171800--Sobic002G100000 Sobic010G181900 Sobic010G181900 Sobic005G171800--Sobic010G181900 Sobic007G037200--Sobic005G032500 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic007G037200--Sobic004G220900 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic007G037200--Sobic002G058900 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic007G037200--Sobic008G159300 Sobic007G037200--Sobic002G100000 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic007G037200--Sobic002G217000 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic007G037200--Sobic008G031400 Sobic003G106400 Sobic003G106400 Sobic007G037200--Sobic003G106400 Sobic007G037200--Sobic004G212350 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic008G168400--Sobic001G129900 Sobic002G381600 Sobic002G381600 Sobic008G168400--Sobic002G381600 Sobic005G079300 Sobic005G079300 Sobic008G168400--Sobic005G079300 Sobic006G080500 Sobic006G080500 Sobic008G168400--Sobic006G080500 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic008G168400--Sobic009G052400 Sobic003G063900 Sobic003G063900 Sobic008G168400--Sobic003G063900 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic008G168400--Sobic005G021100 Sobic008G168400--Sobic007G187100 Sobic001G392900 Sobic001G392900 Sobic008G168400--Sobic001G392900 Sobic007G187100--Sobic009G061900 Sobic007G187100--Sobic005G079300 Sobic007G187100--Sobic001G129900 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic007G187100--Sobic002G192600 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic007G187100--Sobic002G409300 Sobic007G187100--Sobic004G212350 Sobic004G133600 Sobic004G133600 Sobic007G187100--Sobic004G133600 Sobic007G187100--Sobic008G168400 Sobic005G186300 Sobic005G186300 Sobic007G187100--Sobic005G186300 Sobic005G032500--Sobic007G037200 Sobic005G032500--Sobic002G100000 Sobic005G032500--Sobic008G031400 Sobic005G032500--Sobic002G058900 Sobic005G032500--Sobic008G159300 Sobic005G032500--Sobic002G217000 Sobic005G032500--Sobic004G220900 Sobic002G101200 Sobic002G101200 Sobic005G032500--Sobic002G101200 Sobic005G032500--Sobic004G212350 Sobic009G061900--Sobic007G187100 Sobic009G061900--Sobic005G186300 Sobic001G200900 Sobic001G200900 Sobic009G061900--Sobic001G200900 Sobic009G061900--Sobic002G192600 Sobic009G061900--Sobic002G409300 Sobic009G061900--Sobic009G052400 Sobic009G061900--Sobic001G129900 Sobic009G061900--Sobic004G133600 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic009G061900--Sobic005G174000 Sobic004G212350--Sobic007G187100 Sobic004G212350--Sobic009G061900 Sobic004G212350--Sobic002G100000 Sobic004G212350--Sobic008G168400 Sobic004G212350--Sobic005G079300 Sobic004G212350--Sobic001G129900 Sobic004G212350--Sobic002G381600 Sobic004G139700 Sobic004G139700 Sobic004G212350--Sobic004G139700 Sobic004G212350--Sobic002G409300 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic002G293100--Sobic004G171600 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic002G293100--Sobic005G077900 Sobic002G293100--Sobic005G174000 Sobic002G293100--Sobic001G200900 Sobic002G293100--Sobic005G021100 Sobic002G293100--Sobic009G061900 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic002G293100--Sobic001G489075 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic002G293100--Sobic002G089500 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic002G293100--Sobic001G233600 Sobic005G089101 Sobic005G089101 Sobic002G100000--Sobic005G089101 Sobic002G100000--Sobic004G212350 Sobic002G100000--Sobic007G037200 Sobic002G100000--Sobic010G181900 Sobic002G100000--Sobic005G032500 Sobic002G100000--Sobic002G217000 Sobic002G100000--Sobic008G168400 Sobic002G100000--Sobic004G220900 Sobic002G100000--Sobic007G187100 Sobic010G181900--Sobic008G168400 Sobic010G181900--Sobic002G100000 Sobic010G181900--Sobic005G089101 Sobic003G307600 Sobic003G307600 Sobic010G181900--Sobic003G307600 Sobic010G181900--Sobic003G063900 Sobic010G181900--Sobic005G079300 Sobic010G181900--Sobic007G187100 Sobic010G181900--Sobic004G212350 Sobic010G181900--Sobic002G381600
Octagon: transcription factors


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