Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G101200.1
Synonym
Functional annotation paired amphipathic helix repeat-containing protein, putative, expressed
UniProt C5XEX6
Pfam PF02671
Panther DB PTHR12346
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G24200 : Paired amphipathic helix (PAH2) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g25200.1 : paired amphipathic helix repeat-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035431
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G083160 - -
2 Sobic.010G107300 - -
3 Sobic.009G218100 transcription initiation factor IIB, putative, expressed K03124: TFIIB, GTF2B, SUA7, transcription initiation factor TFIIB
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11 Sobic.001G452100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase
12 Sobic.008G064250 - -
13 Sobic.003G035001 - -
14 Sobic.005G165632 - -
15 Sobic.001G394900 expressed protein -
16 Sobic.008G088881 - -
17 Sobic.003G092600 seven in absentia protein family protein, expressed -
18 Sobic.002G016250 - -
19 Sobic.005G226150 - -
20 Sobic.003G167200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic003G101200--Sobic005G083160 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic003G101200--Sobic010G107300 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic003G101200--Sobic009G218100 Sobic002G015800 Sobic002G015800 Sobic003G101200--Sobic002G015800 Sobic001G509100 Sobic001G509100 Sobic003G101200--Sobic001G509100 Sobic002G099866 Sobic002G099866 Sobic003G101200--Sobic002G099866 Sobic004G262100 Sobic004G262100 Sobic003G101200--Sobic004G262100 Sobic002G360900 Sobic002G360900 Sobic003G101200--Sobic002G360900 Sobic010G022600 Sobic010G022600 Sobic003G101200--Sobic010G022600 Sobic005G083160--Sobic010G107300 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic005G083160--Sobic005G226150 Sobic005G083160--Sobic010G022600 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic005G083160--Sobic008G088881 Sobic005G083160--Sobic009G218100 Sobic005G083160--Sobic002G360900 Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic005G083160--Sobic001G233900 Sobic005G083160--Sobic003G101200 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic005G083160--Sobic003G323000 Sobic010G107300--Sobic005G083160 Sobic010G107300--Sobic005G226150 Sobic010G107300--Sobic010G022600 Sobic010G107300--Sobic008G088881 Sobic010G107300--Sobic002G360900 Sobic010G107300--Sobic001G233900 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic010G107300--Sobic003G247700 Sobic010G107300--Sobic003G323000 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic010G107300--Sobic007G070700 Sobic009G218100--Sobic005G083160 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic009G218100--Sobic008G064250 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic009G218100--Sobic005G165632 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic009G218100--Sobic002G016250 Sobic009G218100--Sobic010G107300 Sobic003G342000 Sobic003G342000 Sobic009G218100--Sobic003G342000 Sobic009G218100--Sobic003G101200 Sobic008G113350 Sobic008G113350 Sobic009G218100--Sobic008G113350 Sobic009G218100--Sobic002G360900 Sobic003G092600 Sobic003G092600 Sobic002G015800--Sobic003G092600 Sobic001G261529 Sobic001G261529 Sobic002G015800--Sobic001G261529 Sobic005G083280 Sobic005G083280 Sobic002G015800--Sobic005G083280 Sobic002G015800--Sobic004G262100 Sobic002G015800--Sobic001G509100 Sobic001G324800 Sobic001G324800 Sobic002G015800--Sobic001G324800 Sobic002G015800--Sobic010G022600 Sobic002G015800--Sobic010G107300 Sobic004G322901 Sobic004G322901 Sobic002G015800--Sobic004G322901 Sobic001G509100--Sobic002G099866 Sobic001G509100--Sobic002G015800 Sobic001G509100--Sobic003G092600 Sobic003G035001 Sobic003G035001 Sobic001G509100--Sobic003G035001 Sobic001G509100--Sobic004G262100 Sobic002G266600 Sobic002G266600 Sobic001G509100--Sobic002G266600 Sobic001G509100--Sobic001G261529 Sobic009G132400 Sobic009G132400 Sobic001G509100--Sobic009G132400 Sobic001G509100--Sobic003G101200 Sobic002G099866--Sobic002G266600 Sobic002G099866--Sobic001G509100 Sobic002G099866--Sobic009G132400 Sobic001G264600 Sobic001G264600 Sobic002G099866--Sobic001G264600 Sobic003G167200 Sobic003G167200 Sobic002G099866--Sobic003G167200 Sobic002G099866--Sobic001G261529 Sobic002G099866--Sobic003G035001 Sobic002G099866--Sobic002G015800 Sobic007G086701 Sobic007G086701 Sobic002G099866--Sobic007G086701 Sobic004G262100--Sobic002G015800 Sobic004G262100--Sobic003G092600 Sobic004G262100--Sobic001G324800 Sobic004G262100--Sobic001G509100 Sobic004G262100--Sobic002G360900 Sobic004G262100--Sobic001G261529 Sobic004G262100--Sobic005G083280 Sobic004G262100--Sobic003G101200 Sobic004G262100--Sobic010G022600 Sobic002G360900--Sobic008G088881 Sobic002G360900--Sobic010G107300 Sobic002G360900--Sobic005G083160 Sobic002G360900--Sobic001G233900 Sobic002G360900--Sobic005G226150 Sobic002G360900--Sobic010G022600 Sobic002G360900--Sobic001G324800 Sobic002G360900--Sobic003G323000 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic002G360900--Sobic003G303500 Sobic010G022600--Sobic005G226150 Sobic010G022600--Sobic010G107300 Sobic002G417900 Sobic002G417900 Sobic010G022600--Sobic002G417900 Sobic004G085100 Sobic004G085100 Sobic010G022600--Sobic004G085100 Sobic001G362900 Sobic001G362900 Sobic010G022600--Sobic001G362900 Sobic002G088000 Sobic002G088000 Sobic010G022600--Sobic002G088000 Sobic010G022600--Sobic005G083160 Sobic004G171500 Sobic004G171500 Sobic010G022600--Sobic004G171500 Sobic001G297800 Sobic001G297800 Sobic010G022600--Sobic001G297800
Octagon: transcription factors


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