Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G107300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YIF1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g41770.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G083160 - -
2 Sobic.005G226150 - -
3 Sobic.010G022600 encodes granule-bound ADP-glucose-gluosyl transferase(PubMedID : 20585750)@-(PubMedID : 9866201)@starch synthase, putative, expressed K13679: granule-bound starch synthase
4 Sobic.008G088881 - -
5 Sobic.002G360900 GASR9 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
6 Sobic.001G233900 expressed protein -
7 Sobic.003G247700 cold acclimation protein WCOR413, putative, expressed -
8 Sobic.003G323000 - -
9 Sobic.007G070700 OsFBX265 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G218100 transcription initiation factor IIB, putative, expressed K03124: TFIIB, GTF2B, SUA7, transcription initiation factor TFIIB
11 Sobic.007G025300 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G101200 paired amphipathic helix repeat-containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G103066 - -
14 Sobic.004G099750 - -
15 Sobic.009G001600 "kafirin seed storage protein, similar to Beta-kafirin precursor"(PubMedID : 21853065)@PROLM24 - Prolamin precursor, expressed -
16 Sobic.009G245750 - -
17 Sobic.001G253501 - -
18 Sobic.001G535900 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
19 Sobic.005G174900 - -
20 Sobic.002G211700 storage protein(PubMedID : 16668596)@"kafirin seed storage protein, delta-kafirin precursor"(PubMedID : 21853065)@PROLM23 - Prolamin precursor, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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