Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G083160.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHA2
Pfam PF01852
Panther DB PTHR24326 PTHR24326:SF288
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008289; lipid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G00730 : Homeobox-leucine zipper family protein / lipid-binding START domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g45250.1 : homeobox and START domains containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G107300 - -
2 Sobic.005G226150 - -
3 Sobic.010G022600 encodes granule-bound ADP-glucose-gluosyl transferase(PubMedID : 20585750)@-(PubMedID : 9866201)@starch synthase, putative, expressed K13679: granule-bound starch synthase
4 Sobic.008G088881 - -
5 Sobic.009G218100 transcription initiation factor IIB, putative, expressed K03124: TFIIB, GTF2B, SUA7, transcription initiation factor TFIIB
6 Sobic.002G360900 GASR9 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
7 Sobic.001G233900 expressed protein -
8 Sobic.003G101200 paired amphipathic helix repeat-containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G323000 - -
10 Sobic.003G342000 bet v I allergen family protein, putative, expressed K14496: abscisic acid receptor PYR/PYL family
11 Sobic.007G070700 OsFBX265 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G015800 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G247700 cold acclimation protein WCOR413, putative, expressed -
14 Sobic.008G064250 - -
15 Sobic.001G253501 - -
16 Sobic.009G245750 - -
17 Sobic.009G001600 "kafirin seed storage protein, similar to Beta-kafirin precursor"(PubMedID : 21853065)@PROLM24 - Prolamin precursor, expressed -
18 Sobic.002G077600 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
19 Sobic.007G049400 OsFBX381 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G112250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic005G083160--Sobic010G107300 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic005G083160--Sobic005G226150 Sobic010G022600 Sobic010G022600 Sobic005G083160--Sobic010G022600 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic005G083160--Sobic008G088881 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic005G083160--Sobic009G218100 Sobic002G360900 Sobic002G360900 Sobic005G083160--Sobic002G360900 Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic005G083160--Sobic001G233900 Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic005G083160--Sobic003G101200 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic005G083160--Sobic003G323000 Sobic010G107300--Sobic005G083160 Sobic010G107300--Sobic005G226150 Sobic010G107300--Sobic010G022600 Sobic010G107300--Sobic008G088881 Sobic010G107300--Sobic002G360900 Sobic010G107300--Sobic001G233900 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic010G107300--Sobic003G247700 Sobic010G107300--Sobic003G323000 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic010G107300--Sobic007G070700 Sobic005G226150--Sobic003G247700 Sobic005G226150--Sobic007G070700 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic005G226150--Sobic009G245750 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic005G226150--Sobic001G253501 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic005G226150--Sobic008G103066 Sobic005G226150--Sobic008G088881 Sobic009G001600 Sobic009G001600 Sobic005G226150--Sobic009G001600 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic005G226150--Sobic005G174900 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic005G226150--Sobic007G025300 Sobic010G022600--Sobic005G226150 Sobic010G022600--Sobic010G107300 Sobic002G417900 Sobic002G417900 Sobic010G022600--Sobic002G417900 Sobic004G085100 Sobic004G085100 Sobic010G022600--Sobic004G085100 Sobic001G362900 Sobic001G362900 Sobic010G022600--Sobic001G362900 Sobic002G088000 Sobic002G088000 Sobic010G022600--Sobic002G088000 Sobic010G022600--Sobic005G083160 Sobic004G171500 Sobic004G171500 Sobic010G022600--Sobic004G171500 Sobic001G297800 Sobic001G297800 Sobic010G022600--Sobic001G297800 Sobic008G088881--Sobic005G226150 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic008G088881--Sobic009G007500 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic008G088881--Sobic006G062700 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic008G088881--Sobic008G088450 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic008G088881--Sobic001G112250 Sobic008G088881--Sobic008G103066 Sobic008G088881--Sobic007G070700 Sobic008G088881--Sobic005G174900 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic008G088881--Sobic001G249233 Sobic009G218100--Sobic005G083160 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic009G218100--Sobic008G064250 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic009G218100--Sobic005G165632 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic009G218100--Sobic002G016250 Sobic009G218100--Sobic010G107300 Sobic003G342000 Sobic003G342000 Sobic009G218100--Sobic003G342000 Sobic009G218100--Sobic003G101200 Sobic008G113350 Sobic008G113350 Sobic009G218100--Sobic008G113350 Sobic009G218100--Sobic002G360900 Sobic002G360900--Sobic008G088881 Sobic002G360900--Sobic010G107300 Sobic002G360900--Sobic005G083160 Sobic002G360900--Sobic001G233900 Sobic002G360900--Sobic005G226150 Sobic002G360900--Sobic010G022600 Sobic001G324800 Sobic001G324800 Sobic002G360900--Sobic001G324800 Sobic002G360900--Sobic003G323000 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic002G360900--Sobic003G303500 Sobic001G233900--Sobic008G088881 Sobic001G233900--Sobic005G226150 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic001G233900--Sobic005G225000 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic001G233900--Sobic005G199101 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic001G233900--Sobic010G153800 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic001G233900--Sobic002G091800 Sobic001G233900--Sobic010G107300 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic001G233900--Sobic002G344900 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic001G233900--Sobic010G148600 Sobic003G101200--Sobic005G083160 Sobic003G101200--Sobic010G107300 Sobic003G101200--Sobic009G218100 Sobic002G015800 Sobic002G015800 Sobic003G101200--Sobic002G015800 Sobic001G509100 Sobic001G509100 Sobic003G101200--Sobic001G509100 Sobic002G099866 Sobic002G099866 Sobic003G101200--Sobic002G099866 Sobic004G262100 Sobic004G262100 Sobic003G101200--Sobic004G262100 Sobic003G101200--Sobic002G360900 Sobic003G101200--Sobic010G022600 Sobic001G259300 Sobic001G259300 Sobic003G323000--Sobic001G259300 Sobic008G013100 Sobic008G013100 Sobic003G323000--Sobic008G013100 Sobic003G105600 Sobic003G105600 Sobic003G323000--Sobic003G105600 Sobic003G350900 Sobic003G350900 Sobic003G323000--Sobic003G350900 Sobic005G188000 Sobic005G188000 Sobic003G323000--Sobic005G188000 Sobic009G022700 Sobic009G022700 Sobic003G323000--Sobic009G022700 Sobic009G186400 Sobic009G186400 Sobic003G323000--Sobic009G186400 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic003G323000--Sobic008G064000 Sobic006G059900 Sobic006G059900 Sobic003G323000--Sobic006G059900
Octagon: transcription factors


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