Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G073250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W2S7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G153201 - -
2 Sobic.002G006600 -(PubMedID : 26976818)@aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K14272: glutamate--glyoxylate aminotransferase
3 Sobic.007G226600 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
4 Sobic.003G017100 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G534066 - -
6 Sobic.005G110200 - -
7 Sobic.002G097900 expressed protein -
8 Sobic.010G176550 - -
9 Sobic.006G182900 expressed protein -
10 Sobic.009G209300 starch synthase, putative, expressed -
11 Sobic.008G082100 - -
12 Sobic.003G191700 ELF3 protein, putative, expressed K12125: protein EARLY FLOWERING 3
13 Sobic.006G048600 - -
14 Sobic.003G429650 - -
15 Sobic.001G530900 expressed protein -
16 Sobic.003G217700 - -
17 Sobic.010G002700 expressed protein -
18 Sobic.005G118400 expressed protein -
19 Sobic.004G042200 OsFBO8 - F-box and other domain containing protein, expressed K12115: clock-associated PAS protein ZTL
20 Sobic.007G116200 expressed protein K13217: PRPF39, pre-mRNA-processing factor 39


Gene co-expression network
sample Sobic002G073250 Sobic002G073250 Sobic010G153201 Sobic010G153201 Sobic002G073250--Sobic010G153201 Sobic002G006600 Sobic002G006600 Sobic002G073250--Sobic002G006600 Sobic007G226600 Sobic007G226600 Sobic002G073250--Sobic007G226600 Sobic003G017100 Sobic003G017100 Sobic002G073250--Sobic003G017100 Sobic001G534066 Sobic001G534066 Sobic002G073250--Sobic001G534066 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic002G073250--Sobic005G110200 Sobic002G097900 Sobic002G097900 Sobic002G073250--Sobic002G097900 Sobic010G176550 Sobic010G176550 Sobic002G073250--Sobic010G176550 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic002G073250--Sobic006G182900 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic010G153201--Sobic002G097700 Sobic005G118400 Sobic005G118400 Sobic010G153201--Sobic005G118400 Sobic001G540600 Sobic001G540600 Sobic010G153201--Sobic001G540600 Sobic001G530900 Sobic001G530900 Sobic010G153201--Sobic001G530900 Sobic010G153201--Sobic002G073250 Sobic001G378100 Sobic001G378100 Sobic010G153201--Sobic001G378100 Sobic004G179400 Sobic004G179400 Sobic010G153201--Sobic004G179400 Sobic010G002700 Sobic010G002700 Sobic010G153201--Sobic010G002700 Sobic007G185700 Sobic007G185700 Sobic010G153201--Sobic007G185700 Sobic002G006600--Sobic003G017100 Sobic001G198100 Sobic001G198100 Sobic002G006600--Sobic001G198100 Sobic002G006600--Sobic010G002700 Sobic001G169900 Sobic001G169900 Sobic002G006600--Sobic001G169900 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic002G006600--Sobic003G429650 Sobic004G164400 Sobic004G164400 Sobic002G006600--Sobic004G164400 Sobic002G006600--Sobic006G182900 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic002G006600--Sobic009G209300 Sobic006G105400 Sobic006G105400 Sobic002G006600--Sobic006G105400 Sobic007G226600--Sobic002G097900 Sobic007G226600--Sobic002G073250 Sobic005G159000 Sobic005G159000 Sobic007G226600--Sobic005G159000 Sobic010G120700 Sobic010G120700 Sobic007G226600--Sobic010G120700 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic007G226600--Sobic005G039500 Sobic007G226600--Sobic002G006600 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic007G226600--Sobic001G111900 Sobic004G326200 Sobic004G326200 Sobic007G226600--Sobic004G326200 Sobic008G015500 Sobic008G015500 Sobic007G226600--Sobic008G015500 Sobic003G017100--Sobic002G006600 Sobic003G017100--Sobic010G002700 Sobic003G017100--Sobic001G198100 Sobic003G276300 Sobic003G276300 Sobic003G017100--Sobic003G276300 Sobic003G017100--Sobic001G169900 Sobic003G313300 Sobic003G313300 Sobic003G017100--Sobic003G313300 Sobic001G468700 Sobic001G468700 Sobic003G017100--Sobic001G468700 Sobic003G247400 Sobic003G247400 Sobic003G017100--Sobic003G247400 Sobic003G191700 Sobic003G191700 Sobic003G017100--Sobic003G191700 Sobic001G534066--Sobic010G176550 Sobic003G217700 Sobic003G217700 Sobic001G534066--Sobic003G217700 Sobic003G138500 Sobic003G138500 Sobic001G534066--Sobic003G138500 Sobic001G159400 Sobic001G159400 Sobic001G534066--Sobic001G159400 Sobic001G534066--Sobic002G073250 Sobic001G191600 Sobic001G191600 Sobic001G534066--Sobic001G191600 Sobic001G102500 Sobic001G102500 Sobic001G534066--Sobic001G102500 Sobic004G354200 Sobic004G354200 Sobic001G534066--Sobic004G354200 Sobic007G023200 Sobic007G023200 Sobic001G534066--Sobic007G023200 Sobic005G110300 Sobic005G110300 Sobic005G110200--Sobic005G110300 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic005G110200--Sobic002G134200 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic005G110200--Sobic007G116200 Sobic008G185300 Sobic008G185300 Sobic005G110200--Sobic008G185300 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic005G110200--Sobic005G090401 Sobic005G110200--Sobic006G182900 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic005G110200--Sobic003G280800 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic005G110200--Sobic005G032800 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic005G110200--Sobic006G032500 Sobic002G097900--Sobic007G226600 Sobic002G097900--Sobic002G073250 Sobic002G097900--Sobic005G039500 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic002G097900--Sobic003G113200 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic002G097900--Sobic001G067850 Sobic002G402600 Sobic002G402600 Sobic002G097900--Sobic002G402600 Sobic002G097900--Sobic005G159000 Sobic002G097900--Sobic005G110200 Sobic010G057700 Sobic010G057700 Sobic002G097900--Sobic010G057700 Sobic002G031400 Sobic002G031400 Sobic010G176550--Sobic002G031400 Sobic004G034800 Sobic004G034800 Sobic010G176550--Sobic004G034800 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic010G176550--Sobic001G261573 Sobic010G176550--Sobic003G217700 Sobic010G176550--Sobic007G185700 Sobic001G035900 Sobic001G035900 Sobic010G176550--Sobic001G035900 Sobic003G234900 Sobic003G234900 Sobic010G176550--Sobic003G234900 Sobic010G005600 Sobic010G005600 Sobic010G176550--Sobic010G005600 Sobic010G032900 Sobic010G032900 Sobic010G176550--Sobic010G032900 Sobic006G182900--Sobic003G429650 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic006G182900--Sobic006G048500 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic006G182900--Sobic007G161000 Sobic001G365900 Sobic001G365900 Sobic006G182900--Sobic001G365900 Sobic006G182900--Sobic007G116200 Sobic004G096600 Sobic004G096600 Sobic006G182900--Sobic004G096600 Sobic006G182900--Sobic002G134200 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic006G182900--Sobic001G214300 Sobic006G182900--Sobic009G209300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.