Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G429650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W1H9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G048500 - -
2 Sobic.006G182900 expressed protein -
3 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
4 Sobic.005G144400 - -
5 Sobic.003G179201 - -
6 Sobic.001G287201 - -
7 Sobic.002G243900 - -
8 Sobic.001G214300 expressed protein -
9 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G209300 starch synthase, putative, expressed -
11 Sobic.006G216800 AAA family ATPase, putative, expressed K13339: PEX6, peroxin-6
12 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
13 Sobic.007G096600 - -
14 Sobic.006G079400 - -
15 Sobic.002G145101 - -
16 Sobic.001G274200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
17 Sobic.007G116200 expressed protein K13217: PRPF39, pre-mRNA-processing factor 39
18 Sobic.002G006600 -(PubMedID : 26976818)@aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K14272: glutamate--glyoxylate aminotransferase
19 Sobic.001G318432 - -
20 Sobic.002G133400 CTR1-like protein kinase, putative, expressed K14510: serine/threonine-protein kinase CTR1


Gene co-expression network
sample Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic003G429650--Sobic006G048500 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic003G429650--Sobic006G182900 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic003G429650--Sobic003G148000 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic003G429650--Sobic005G144400 Sobic003G179201 Sobic003G179201 Sobic003G429650--Sobic003G179201 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic003G429650--Sobic001G287201 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic003G429650--Sobic002G243900 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic003G429650--Sobic001G214300 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G429650--Sobic002G006900 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic006G182900--Sobic003G429650 Sobic006G182900--Sobic006G048500 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic006G182900--Sobic007G161000 Sobic001G365900 Sobic001G365900 Sobic006G182900--Sobic001G365900 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic006G182900--Sobic007G116200 Sobic004G096600 Sobic004G096600 Sobic006G182900--Sobic004G096600 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic006G182900--Sobic002G134200 Sobic006G182900--Sobic001G214300 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic006G182900--Sobic009G209300 Sobic003G148000--Sobic005G144400 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G145101 Sobic003G148000--Sobic006G048500 Sobic003G148000--Sobic002G243900 Sobic003G148000--Sobic001G214300 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic003G429650 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic003G148000--Sobic004G258700 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic005G144400--Sobic007G178700 Sobic003G179201--Sobic003G429650 Sobic003G179201--Sobic006G048500 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic003G179201--Sobic006G216800 Sobic002G133400 Sobic002G133400 Sobic003G179201--Sobic002G133400 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic003G179201--Sobic003G332800 Sobic003G179201--Sobic003G148000 Sobic010G202000 Sobic010G202000 Sobic003G179201--Sobic010G202000 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic003G179201--Sobic008G162900 Sobic004G082400 Sobic004G082400 Sobic003G179201--Sobic004G082400 Sobic001G287201--Sobic003G429650 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic001G287201--Sobic003G280800 Sobic001G287201--Sobic002G243900 Sobic001G287201--Sobic006G048500 Sobic001G287201--Sobic004G007100 Sobic001G287201--Sobic006G182900 Sobic001G287201--Sobic002G006900 Sobic001G287201--Sobic007G096600 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic001G287201--Sobic009G104201 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic004G341900 Sobic004G341900 Sobic001G214300--Sobic004G341900 Sobic001G214300--Sobic003G148000 Sobic001G214300--Sobic002G006900 Sobic001G214300--Sobic005G144400 Sobic001G214300--Sobic003G176500 Sobic003G029700 Sobic003G029700 Sobic001G214300--Sobic003G029700 Sobic001G214300--Sobic002G243900 Sobic001G214300--Sobic006G048500 Sobic001G214300--Sobic007G096600 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic002G006900--Sobic008G047800 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic002G006900--Sobic007G065400 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic002G006900--Sobic003G200200 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic002G006900--Sobic003G372700 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic002G006900--Sobic009G040600 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic002G006900--Sobic001G155000 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic002G006900--Sobic002G309600 Sobic002G006900--Sobic001G214300 Sobic001G512700 Sobic001G512700 Sobic002G006900--Sobic001G512700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.