Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G036901.1,Sobic.010G036901.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VRC1 , A0A1W0VRA6
Pfam -
Panther DB PTHR33120 PTHR33120:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g12480.2,LOC_Os02g12480.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G064800 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor
2 Sobic.010G255400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@histone acetyltransferase HAC1, putative, expressed K04498: EP300, CREBBP, E1A/CREB-binding protein
3 Sobic.002G304500 mutS family domain IV containing protein, expressed K08740: DNA mismatch repair protein MSH4
4 Sobic.001G053350 - -
5 Sobic.001G485500 - -
6 Sobic.008G007800 - -
7 Sobic.003G293400 oligosaccharyl transferase, putative, expressed K07151: dolichyl-diphosphooligosaccharide---protein glycosyltransferase
8 Sobic.006G189000 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K10577: UBE2I, ubiquitin-conjugating enzyme E2 I
9 Sobic.001G131900 glycosyl transferase family 8, putative, expressed K13648: alpha-1,4-galacturonosyltransferase
10 Sobic.005G201200 - -
11 Sobic.008G007700 expressed protein -
12 Sobic.004G328100 expressed protein -
13 Sobic.004G026600 - -
14 Sobic.001G076600 hydrolase, acting on carbon-nitrogen, putative, expressed -
15 Sobic.004G213400 ATP8, putative, expressed -
16 Sobic.010G013600 syntaxin, putative, expressed K08489: syntaxin 16
17 Sobic.010G009600 OsFBX182 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G435300 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
19 Sobic.004G298600 histone-lysine N-methyltransferase, putative, expressed K11420: [histone H3]-lysine9 N-trimethyltransferase EHMT
20 Sobic.001G371750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic010G036901--Sobic004G064800 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic010G036901--Sobic010G255400 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic010G036901--Sobic002G304500 Sobic001G053350 Sobic001G053350 Sobic010G036901--Sobic001G053350 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic010G036901--Sobic001G485500 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic010G036901--Sobic008G007800 Sobic003G293400 Sobic003G293400 Sobic010G036901--Sobic003G293400 Sobic006G189000 Sobic006G189000 Sobic010G036901--Sobic006G189000 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic010G036901--Sobic001G131900 Sobic004G064800--Sobic008G007800 Sobic004G064800--Sobic002G304500 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic004G064800--Sobic005G201200 Sobic004G064800--Sobic010G255400 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic004G064800--Sobic006G199500 Sobic009G048700 Sobic009G048700 Sobic004G064800--Sobic009G048700 Sobic008G007700 Sobic008G007700 Sobic004G064800--Sobic008G007700 Sobic002G016000 Sobic002G016000 Sobic004G064800--Sobic002G016000 Sobic009G006700 Sobic009G006700 Sobic004G064800--Sobic009G006700 Sobic010G255400--Sobic008G007800 Sobic010G255400--Sobic004G064800 Sobic010G255400--Sobic005G201200 Sobic010G255400--Sobic002G016000 Sobic008G041300 Sobic008G041300 Sobic010G255400--Sobic008G041300 Sobic010G255400--Sobic002G304500 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic010G255400--Sobic001G076600 Sobic002G158300 Sobic002G158300 Sobic010G255400--Sobic002G158300 Sobic010G255400--Sobic006G199500 Sobic002G304500--Sobic004G064800 Sobic002G304500--Sobic005G201200 Sobic002G304500--Sobic008G007800 Sobic002G304500--Sobic010G255400 Sobic002G304500--Sobic002G016000 Sobic002G304500--Sobic006G199500 Sobic004G328100 Sobic004G328100 Sobic002G304500--Sobic004G328100 Sobic002G304500--Sobic008G007700 Sobic004G038400 Sobic004G038400 Sobic002G304500--Sobic004G038400 Sobic001G053350--Sobic001G485500 Sobic004G215200 Sobic004G215200 Sobic001G053350--Sobic004G215200 Sobic001G053350--Sobic010G255400 Sobic001G053350--Sobic005G201200 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic001G053350--Sobic008G121501 Sobic001G053350--Sobic008G007800 Sobic001G075200 Sobic001G075200 Sobic001G053350--Sobic001G075200 Sobic009G050800 Sobic009G050800 Sobic001G053350--Sobic009G050800 Sobic001G053350--Sobic010G036901 Sobic001G485500--Sobic001G053350 Sobic001G485500--Sobic004G215200 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic001G485500--Sobic003G275400 Sobic001G485500--Sobic010G255400 Sobic001G485500--Sobic010G036901 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic001G485500--Sobic009G168200 Sobic001G485500--Sobic005G201200 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic001G485500--Sobic009G163400 Sobic010G062900 Sobic010G062900 Sobic001G485500--Sobic010G062900 Sobic008G007800--Sobic004G064800 Sobic008G007800--Sobic005G201200 Sobic008G007800--Sobic009G048700 Sobic008G007800--Sobic006G199500 Sobic008G007800--Sobic009G006700 Sobic009G145000 Sobic009G145000 Sobic008G007800--Sobic009G145000 Sobic008G007800--Sobic010G255400 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic008G007800--Sobic002G243400 Sobic009G008000 Sobic009G008000 Sobic008G007800--Sobic009G008000 Sobic003G293400--Sobic001G131900 Sobic003G352900 Sobic003G352900 Sobic003G293400--Sobic003G352900 Sobic004G198300 Sobic004G198300 Sobic003G293400--Sobic004G198300 Sobic003G293400--Sobic001G076600 Sobic002G420100 Sobic002G420100 Sobic003G293400--Sobic002G420100 Sobic003G293400--Sobic004G038400 Sobic004G026600 Sobic004G026600 Sobic003G293400--Sobic004G026600 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic003G293400--Sobic004G298600 Sobic007G144100 Sobic007G144100 Sobic003G293400--Sobic007G144100 Sobic001G385300 Sobic001G385300 Sobic006G189000--Sobic001G385300 Sobic006G189000--Sobic001G076600 Sobic003G376900 Sobic003G376900 Sobic006G189000--Sobic003G376900 Sobic006G189000--Sobic001G131900 Sobic006G189000--Sobic003G352900 Sobic006G189000--Sobic004G298600 Sobic010G009700 Sobic010G009700 Sobic006G189000--Sobic010G009700 Sobic005G045800 Sobic005G045800 Sobic006G189000--Sobic005G045800 Sobic001G380700 Sobic001G380700 Sobic006G189000--Sobic001G380700 Sobic001G131900--Sobic003G293400 Sobic001G131900--Sobic003G352900 Sobic001G131900--Sobic004G038400 Sobic001G131900--Sobic001G076600 Sobic001G131900--Sobic001G385300 Sobic001G131900--Sobic005G045800 Sobic001G131900--Sobic004G298600 Sobic001G131900--Sobic002G420100 Sobic001G131900--Sobic007G144100
Octagon: transcription factors


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