Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G183700.1
Synonym Sb08g022550
Functional annotation cbbY protein-related, putative, expressed
UniProt C5YSV9
Pfam -
Panther DB PTHR18901 PTHR18901:SF28
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45170 : Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g43520.1 : cbbY protein-related, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004805
Brachypodium KQJ85689 , KQJ85688
Barley HORVU5Hr1G003910.8 , HORVU5Hr1G003910.2 , HORVU5Hr1G003910.4 , HORVU5Hr1G003910.5 , HORVU5Hr1G003910.6 , HORVU5Hr1G003910.7 , HORVU5Hr1G003910.3
Wheat TraesCS5D02G023500 , TraesCS5A02G016300 , TraesCS5B02G014500 , TraesCS5B02G014500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G183700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G040900 CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K03262: translation initiation factor 5
2 Sobic.009G124000 mesophyll envelope protein(PubMedID : 26976818)@expressed protein -
3 Sobic.003G083400 cytoskeletal protein, putative, expressed -
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9 Sobic.003G128400 OsClp1 - Putative Clp protease homologue, expressed K01358: clpP, ATP-dependent Clp protease, protease subunit
10 Sobic.005G117300 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G156100 phosphoglycerate mutase, putative, expressed -
12 Sobic.006G055800 mttA/Hcf106 family protein, putative, expressed -
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14 Sobic.004G336000 chaperone protein dnaJ, putative, expressed K03686: molecular chaperone DnaJ
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16 Sobic.004G359100 expressed protein -
17 Sobic.001G025400 fumarylacetoacetase, putative, expressed K01557: acylpyruvate hydrolase
18 Sobic.007G208300 peptidase, putative, expressed K14677: aminoacylase
19 Sobic.002G043600 prolyl-tRNA synthetase, putative, expressed K01881: PARS, prolyl-tRNA synthetase
20 Sobic.001G120500 toc64, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G183700 Sobic008G183700 Sobic004G040900 Sobic004G040900 Sobic008G183700--Sobic004G040900 Sobic009G124000 Sobic009G124000 Sobic008G183700--Sobic009G124000 Sobic003G083400 Sobic003G083400 Sobic008G183700--Sobic003G083400 Sobic008G067100 Sobic008G067100 Sobic008G183700--Sobic008G067100 Sobic001G402500 Sobic001G402500 Sobic008G183700--Sobic001G402500 Sobic005G231100 Sobic005G231100 Sobic008G183700--Sobic005G231100 Sobic001G401700 Sobic001G401700 Sobic008G183700--Sobic001G401700 Sobic004G055500 Sobic004G055500 Sobic008G183700--Sobic004G055500 Sobic003G128400 Sobic003G128400 Sobic008G183700--Sobic003G128400 Sobic002G359400 Sobic002G359400 Sobic004G040900--Sobic002G359400 Sobic002G294800 Sobic002G294800 Sobic004G040900--Sobic002G294800 Sobic010G013200 Sobic010G013200 Sobic004G040900--Sobic010G013200 Sobic004G040900--Sobic001G402500 Sobic008G070800 Sobic008G070800 Sobic004G040900--Sobic008G070800 Sobic001G120500 Sobic001G120500 Sobic004G040900--Sobic001G120500 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Octagon: transcription factors


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