Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G003600.1
Synonym TBL29, Sb08g000470, ESK1
Functional annotation PMR5, putative, expressed
UniProt C5YQ14
Pfam PF14416 PF13839
Panther DB PTHR32285 PTHR32285:SF49
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G55990 : Plant protein of unknown function (DUF828)
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g01380.1 : proteins of unknown function domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036717 , Zm00025a013220 , Zm00025a033244 , Zm00025a053657 , Zm00025a044366 , Zm00025a056956 , Zm00025a004540 , Zm00025a023286 , Zm00025a043430 , Zm00025a001990
Brachypodium KQK10416 , KQK14489 , KQJ92646
Barley HORVU5Hr1G048030.1 , HORVU3Hr1G087740.7 , HORVU3Hr1G087740.6 , HORVU3Hr1G087740.5 , HORVU3Hr1G087740.3 , HORVU3Hr1G087740.2 , HORVU3Hr1G087740.1 , HORVU2Hr1G014140.8 , HORVU2Hr1G014140.9 , HORVU2Hr1G014140.2 , HORVU2Hr1G014140.3 , HORVU2Hr1G014140.4 , HORVU2Hr1G014140.5 , HORVU2Hr1G014140.6 , HORVU2Hr1G014140.7 , HORVU2Hr1G014140.10 , HORVU2Hr1G014140.11
Wheat TraesCS3B02G382900 , TraesCS5A02G153600 , TraesCS5B02G152100 , TraesCS5B02G152100 , TraesCS2A02G086900 , TraesCS3D02G344400 , TraesCS5D02G158900 , TraesCS3A02G350400 , TraesCS2D02G084200 , TraesCS2B02G101600
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cDNA sequences
Sobic.008G003600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G052400 proline-rich family protein, putative, expressed -
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3 Sobic.001G145500 trafficking protein particle complex subunit 1, putative, expressed -
4 Sobic.010G008100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
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6 Sobic.002G342500 glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif, putative, expressed -
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10 Sobic.001G105100 neighbor of COX4, putative, expressed -
11 Sobic.002G131900 expressed protein -
12 Sobic.006G203100 expressed protein -
13 Sobic.006G257001 - -
14 Sobic.007G013300 protein kinase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G104000 ranBP1 domain containing protein, expressed K15306: Ran-binding protein 1
16 Sobic.001G230100 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal precursor, putative, expressed K07513: acetyl-CoA acyltransferase 1
17 Sobic.005G010500 expressed protein -
18 Sobic.006G109700 UBA and UBX domain-containing protein, putative, expressed K14012: SHP1, UBX1, UBX domain-containing protein 1
19 Sobic.010G212200 synthase, putative, expressed K02377: TSTA3, GDP-L-fucose synthase
20 Sobic.001G199300 GIL1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G003600 Sobic008G003600 Sobic003G052400 Sobic003G052400 Sobic008G003600--Sobic003G052400 Sobic009G229300 Sobic009G229300 Sobic008G003600--Sobic009G229300 Sobic001G145500 Sobic001G145500 Sobic008G003600--Sobic001G145500 Sobic010G008100 Sobic010G008100 Sobic008G003600--Sobic010G008100 Sobic006G034800 Sobic006G034800 Sobic008G003600--Sobic006G034800 Sobic002G342500 Sobic002G342500 Sobic008G003600--Sobic002G342500 Sobic001G408100 Sobic001G408100 Sobic008G003600--Sobic001G408100 Sobic003G030800 Sobic003G030800 Sobic008G003600--Sobic003G030800 Sobic009G168000 Sobic009G168000 Sobic008G003600--Sobic009G168000 Sobic010G017000 Sobic010G017000 Sobic003G052400--Sobic010G017000 Sobic003G052400--Sobic001G408100 Sobic002G348600 Sobic002G348600 Sobic003G052400--Sobic002G348600 Sobic001G067900 Sobic001G067900 Sobic003G052400--Sobic001G067900 Sobic003G052400--Sobic008G003600 Sobic003G217100 Sobic003G217100 Sobic003G052400--Sobic003G217100 Sobic009G160200 Sobic009G160200 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Octagon: transcription factors


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