Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G207500.3,Sobic.006G207500.2
Synonym Sb06g027840
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YFJ5 , A0A1B6PN26
Pfam -
Panther DB PTHR33972 PTHR33972:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G16840 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g51770.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056970 , Zm00025a009874
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G207500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G267500 bZIP orthologous(PubMedID : 28671251)@E2F-related protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G065400 X0001, putative, expressed -
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5 Sobic.006G222400 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
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10 Sobic.006G257001 - -
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12 Sobic.001G367000 TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, putative, expressed -
13 Sobic.003G361500 zinc finger family protein, putative, expressed -
14 Sobic.010G045833 - -
15 Sobic.008G111700 expressed protein -
16 Sobic.005G010500 expressed protein -
17 Sobic.003G405700 exo70 exocyst complex subunit domain containing protein, expressed K07195: EXOC7, exocyst complex component 7
18 Sobic.001G285300 expressed protein -
19 Sobic.010G219100 protein kinase APK1B, chloroplast precursor, putative, expressed -
20 Sobic.002G368400 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17


Gene co-expression network
sample Sobic006G207500 Sobic006G207500 Sobic010G267500 Sobic010G267500 Sobic006G207500--Sobic010G267500 Sobic010G065400 Sobic010G065400 Sobic006G207500--Sobic010G065400 Sobic009G031200 Sobic009G031200 Sobic006G207500--Sobic009G031200 Sobic006G183000 Sobic006G183000 Sobic006G207500--Sobic006G183000 Sobic006G222400 Sobic006G222400 Sobic006G207500--Sobic006G222400 Sobic007G097900 Sobic007G097900 Sobic006G207500--Sobic007G097900 Sobic003G052400 Sobic003G052400 Sobic006G207500--Sobic003G052400 Sobic001G061700 Sobic001G061700 Sobic006G207500--Sobic001G061700 Sobic008G137600 Sobic008G137600 Sobic006G207500--Sobic008G137600 Sobic010G267500--Sobic006G207500 Sobic004G060600 Sobic004G060600 Sobic010G267500--Sobic004G060600 Sobic010G267500--Sobic007G097900 Sobic003G369500 Sobic003G369500 Sobic010G267500--Sobic003G369500 Sobic003G402600 Sobic003G402600 Sobic010G267500--Sobic003G402600 Sobic007G226100 Sobic007G226100 Sobic010G267500--Sobic007G226100 Sobic003G361500 Sobic003G361500 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Octagon: transcription factors


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