Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G060700.2,Sobic.006G060700.1
Synonym Sb06g014880
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
basic proline-rich protein, putative, expressed
UniProt C5YFC1
Pfam -
Panther DB PTHR22814 PTHR22814:SF119
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g32850.2 : basic proline-rich protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011635
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G060700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G008500 protein phosphatase 2c, putative, expressed -
2 Sobic.003G305300 - -
3 Sobic.007G090415 - -
4 Sobic.008G131700 PsbP, putative, expressed -
5 Sobic.002G190100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
6 Sobic.009G083300 white-brown complex homolog protein 12, putative, expressed -
7 Sobic.006G060200 basic proline-rich protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G242600 expressed protein -
9 Sobic.005G084000 expressed protein -
10 Sobic.008G130700 expressed protein -
11 Sobic.003G074700 thylakoid lumenal protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G212000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@S1 RNA binding domain containing protein, expressed K02945: RP-S1, small subunit ribosomal protein S1
13 Sobic.003G069200 transferase family protein, putative, expressed K13065: E2.3.1.133, shikimate O-hydroxycinnamoyltransferase
14 Sobic.010G126100 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.002G215000 chlorophyll A-B binding protein, putative, expressed K08908: light-harvesting complex I chlorophyll a/b binding protein 2
16 Sobic.004G143400 - -
17 Sobic.003G095000 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G300800 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed K00128: aldehyde dehydrogenase (NAD+)
19 Sobic.004G249400 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
20 Sobic.004G246800 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G060700 Sobic006G060700 Sobic008G008500 Sobic008G008500 Sobic006G060700--Sobic008G008500 Sobic003G305300 Sobic003G305300 Sobic006G060700--Sobic003G305300 Sobic007G090415 Sobic007G090415 Sobic006G060700--Sobic007G090415 Sobic008G131700 Sobic008G131700 Sobic006G060700--Sobic008G131700 Sobic002G190100 Sobic002G190100 Sobic006G060700--Sobic002G190100 Sobic009G083300 Sobic009G083300 Sobic006G060700--Sobic009G083300 Sobic006G060200 Sobic006G060200 Sobic006G060700--Sobic006G060200 Sobic002G242600 Sobic002G242600 Sobic006G060700--Sobic002G242600 Sobic005G084000 Sobic005G084000 Sobic006G060700--Sobic005G084000 Sobic002G064400 Sobic002G064400 Sobic008G008500--Sobic002G064400 Sobic008G008500--Sobic009G083300 Sobic007G123200 Sobic007G123200 Sobic008G008500--Sobic007G123200 Sobic008G130700 Sobic008G130700 Sobic008G008500--Sobic008G130700 Sobic008G008500--Sobic002G190100 Sobic008G008500--Sobic007G090415 Sobic001G142400 Sobic001G142400 Sobic008G008500--Sobic001G142400 Sobic003G071600 Sobic003G071600 Sobic008G008500--Sobic003G071600 Sobic006G060500 Sobic006G060500 Sobic008G008500--Sobic006G060500 Sobic003G305300--Sobic008G131700 Sobic002G215000 Sobic002G215000 Sobic003G305300--Sobic002G215000 Sobic009G212000 Sobic009G212000 Sobic003G305300--Sobic009G212000 Sobic003G132300 Sobic003G132300 Sobic003G305300--Sobic003G132300 Sobic003G074700 Sobic003G074700 Sobic003G305300--Sobic003G074700 Sobic003G305300--Sobic005G084000 Sobic006G229300 Sobic006G229300 Sobic003G305300--Sobic006G229300 Sobic007G210600 Sobic007G210600 Sobic003G305300--Sobic007G210600 Sobic009G136900 Sobic009G136900 Sobic003G305300--Sobic009G136900 Sobic007G090415--Sobic008G130700 Sobic001G275800 Sobic001G275800 Sobic007G090415--Sobic001G275800 Sobic005G141000 Sobic005G141000 Sobic007G090415--Sobic005G141000 Sobic005G203600 Sobic005G203600 Sobic007G090415--Sobic005G203600 Sobic007G090415--Sobic002G190100 Sobic005G020200 Sobic005G020200 Sobic007G090415--Sobic005G020200 Sobic007G090415--Sobic007G123200 Sobic007G090415--Sobic008G008500 Sobic001G215300 Sobic001G215300 Sobic007G090415--Sobic001G215300 Sobic008G131700--Sobic003G074700 Sobic008G131700--Sobic002G215000 Sobic008G131700--Sobic005G084000 Sobic001G495300 Sobic001G495300 Sobic008G131700--Sobic001G495300 Sobic008G131700--Sobic003G305300 Sobic004G246800 Sobic004G246800 Sobic008G131700--Sobic004G246800 Sobic008G131700--Sobic007G210600 Sobic008G131700--Sobic006G060200 Sobic002G209600 Sobic002G209600 Sobic008G131700--Sobic002G209600 Sobic006G025700 Sobic006G025700 Sobic002G190100--Sobic006G025700 Sobic006G263800 Sobic006G263800 Sobic002G190100--Sobic006G263800 Sobic002G190100--Sobic008G130700 Sobic002G190100--Sobic002G242600 Sobic001G027600 Sobic001G027600 Sobic002G190100--Sobic001G027600 Sobic004G044000 Sobic004G044000 Sobic002G190100--Sobic004G044000 Sobic004G253800 Sobic004G253800 Sobic002G190100--Sobic004G253800 Sobic009G059100 Sobic009G059100 Sobic002G190100--Sobic009G059100 Sobic001G120000 Sobic001G120000 Sobic002G190100--Sobic001G120000 Sobic003G069200 Sobic003G069200 Sobic009G083300--Sobic003G069200 Sobic009G083300--Sobic008G008500 Sobic006G155700 Sobic006G155700 Sobic009G083300--Sobic006G155700 Sobic004G015700 Sobic004G015700 Sobic009G083300--Sobic004G015700 Sobic009G083300--Sobic002G064400 Sobic009G083300--Sobic005G084000 Sobic009G083300--Sobic003G071600 Sobic009G083300--Sobic001G142400 Sobic001G099000 Sobic001G099000 Sobic009G083300--Sobic001G099000 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic006G060200--Sobic001G269300 Sobic006G060200--Sobic002G215000 Sobic001G217700 Sobic001G217700 Sobic006G060200--Sobic001G217700 Sobic006G060200--Sobic008G131700 Sobic001G233400 Sobic001G233400 Sobic006G060200--Sobic001G233400 Sobic005G036600 Sobic005G036600 Sobic006G060200--Sobic005G036600 Sobic003G137100 Sobic003G137100 Sobic006G060200--Sobic003G137100 Sobic006G060200--Sobic001G495300 Sobic006G060200--Sobic005G084000 Sobic002G242600--Sobic004G044000 Sobic007G013400 Sobic007G013400 Sobic002G242600--Sobic007G013400 Sobic003G030900 Sobic003G030900 Sobic002G242600--Sobic003G030900 Sobic003G383500 Sobic003G383500 Sobic002G242600--Sobic003G383500 Sobic009G001500 Sobic009G001500 Sobic002G242600--Sobic009G001500 Sobic002G242600--Sobic002G190100 Sobic002G242600--Sobic001G027600 Sobic001G475600 Sobic001G475600 Sobic002G242600--Sobic001G475600 Sobic006G248200 Sobic006G248200 Sobic002G242600--Sobic006G248200 Sobic005G084000--Sobic001G495300 Sobic005G084000--Sobic007G210600 Sobic005G084000--Sobic008G131700 Sobic005G084000--Sobic001G142400 Sobic005G084000--Sobic003G074700 Sobic004G143400 Sobic004G143400 Sobic005G084000--Sobic004G143400 Sobic005G084000--Sobic009G083300 Sobic007G201400 Sobic007G201400 Sobic005G084000--Sobic007G201400 Sobic005G084000--Sobic003G069200
Octagon: transcription factors


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