Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G224200.1
Synonym Sb05g027320
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
RGH1A, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RKF3
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF484
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46530 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g37880.1 : stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ86321 , KQJ86320
Barley HORVU3Hr1G099740.18 , HORVU3Hr1G099740.16 , HORVU3Hr1G099740.17 , HORVU3Hr1G099740.15 , HORVU3Hr1G099740.12 , HORVU3Hr1G099740.13 , HORVU3Hr1G099740.10 , HORVU3Hr1G099740.8 , HORVU3Hr1G099740.9 , HORVU3Hr1G099740.4 , HORVU3Hr1G099740.5 , HORVU3Hr1G099740.6 , HORVU3Hr1G099740.7 , HORVU3Hr1G099740.1 , HORVU3Hr1G099740.2 , HORVU3Hr1G099740.3
Wheat TraesCS4A02G491300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G259100 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@auxin responsive protein, putative, expressed K14488: SAUR family protein
2 Sobic.004G014600 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
3 Sobic.005G182800 NB-ARC domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G333000 hypothetical protein -
5 Sobic.006G135300 expressed protein -
6 Sobic.007G073000 - -
7 Sobic.007G135100 - -
8 Sobic.007G186500 resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.007G090600 CSLC3 - cellulose synthase-like family C, expressed -
10 Sobic.006G092700 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
11 Sobic.006G003600 transporter family protein, putative, expressed -
12 Sobic.009G065700 - -
13 Sobic.008G164450 - -
14 Sobic.002G289500 carbohydrate binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G182900 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G165100 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.001G274400 serine/threonine-protein kinase BRI1-like 2 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.003G215300 pleiotropic drug resistance protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G037600 C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, expressed -
20 Sobic.005G052700 ZOS11-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G224200 Sobic005G224200 Sobic002G259100 Sobic002G259100 Sobic005G224200--Sobic002G259100 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic005G224200--Sobic004G014600 Sobic005G182800 Sobic005G182800 Sobic005G224200--Sobic005G182800 Sobic004G333000 Sobic004G333000 Sobic005G224200--Sobic004G333000 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic005G224200--Sobic006G135300 Sobic007G073000 Sobic007G073000 Sobic005G224200--Sobic007G073000 Sobic007G135100 Sobic007G135100 Sobic005G224200--Sobic007G135100 Sobic007G186500 Sobic007G186500 Sobic005G224200--Sobic007G186500 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic005G224200--Sobic007G090600 Sobic002G259100--Sobic005G224200 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic002G259100--Sobic001G503000 Sobic006G209000 Sobic006G209000 Sobic002G259100--Sobic006G209000 Sobic005G115300 Sobic005G115300 Sobic002G259100--Sobic005G115300 Sobic010G096700 Sobic010G096700 Sobic002G259100--Sobic010G096700 Sobic003G215300 Sobic003G215300 Sobic002G259100--Sobic003G215300 Sobic002G259100--Sobic007G073000 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic002G259100--Sobic004G312500 Sobic002G259100--Sobic005G182800 Sobic003G441601 Sobic003G441601 Sobic004G014600--Sobic003G441601 Sobic004G014600--Sobic007G090600 Sobic009G165100 Sobic009G165100 Sobic004G014600--Sobic009G165100 Sobic004G014600--Sobic005G182800 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic004G014600--Sobic003G079100 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic004G014600--Sobic010G213600 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic004G014600--Sobic005G182900 Sobic006G031100 Sobic006G031100 Sobic004G014600--Sobic006G031100 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic004G014600--Sobic002G289500 Sobic005G182800--Sobic005G182900 Sobic005G182800--Sobic004G014600 Sobic005G182800--Sobic003G079100 Sobic008G138900 Sobic008G138900 Sobic005G182800--Sobic008G138900 Sobic005G182800--Sobic006G031100 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G182800--Sobic002G019000 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic005G182800--Sobic005G216600 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic005G182800--Sobic004G009200 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G182800--Sobic005G065700 Sobic006G003600 Sobic006G003600 Sobic004G333000--Sobic006G003600 Sobic004G333000--Sobic005G224200 Sobic007G057400 Sobic007G057400 Sobic004G333000--Sobic007G057400 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic004G333000--Sobic006G092700 Sobic004G119800 Sobic004G119800 Sobic004G333000--Sobic004G119800 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic004G333000--Sobic010G082000 Sobic001G360500 Sobic001G360500 Sobic004G333000--Sobic001G360500 Sobic004G333000--Sobic002G259100 Sobic004G333000--Sobic006G135300 Sobic006G135300--Sobic006G092700 Sobic006G135300--Sobic010G082000 Sobic006G135300--Sobic007G073000 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic006G135300--Sobic010G028100 Sobic006G019700 Sobic006G019700 Sobic006G135300--Sobic006G019700 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic006G135300--Sobic010G152400 Sobic003G322100 Sobic003G322100 Sobic006G135300--Sobic003G322100 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic006G135300--Sobic004G306900 Sobic002G146000 Sobic002G146000 Sobic006G135300--Sobic002G146000 Sobic007G073000--Sobic006G092700 Sobic007G073000--Sobic003G322100 Sobic007G073000--Sobic003G215300 Sobic007G073000--Sobic002G146000 Sobic007G073000--Sobic006G135300 Sobic002G195600 Sobic002G195600 Sobic007G073000--Sobic002G195600 Sobic007G073000--Sobic010G082000 Sobic007G090472 Sobic007G090472 Sobic007G073000--Sobic007G090472 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic007G073000--Sobic003G240400 Sobic007G135100--Sobic007G073000 Sobic007G135100--Sobic004G014600 Sobic005G046801 Sobic005G046801 Sobic007G135100--Sobic005G046801 Sobic007G135100--Sobic010G028100 Sobic007G135100--Sobic002G146000 Sobic007G135100--Sobic006G092700 Sobic007G135100--Sobic002G195600 Sobic007G135100--Sobic005G224200 Sobic007G135100--Sobic007G090600 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic007G186500--Sobic004G121600 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic007G186500--Sobic010G268700 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic007G186500--Sobic006G097900 Sobic007G186500--Sobic005G216600 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic007G186500--Sobic003G161400 Sobic001G301000 Sobic001G301000 Sobic007G186500--Sobic001G301000 Sobic008G010500 Sobic008G010500 Sobic007G186500--Sobic008G010500 Sobic003G007400 Sobic003G007400 Sobic007G186500--Sobic003G007400 Sobic007G186500--Sobic005G182900 Sobic007G090600--Sobic006G031100 Sobic003G282300 Sobic003G282300 Sobic007G090600--Sobic003G282300 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic007G090600--Sobic004G322000 Sobic007G090600--Sobic003G215300 Sobic007G090600--Sobic004G014600 Sobic006G196400 Sobic006G196400 Sobic007G090600--Sobic006G196400 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic007G090600--Sobic006G205700 Sobic007G090600--Sobic003G240400 Sobic002G115600 Sobic002G115600 Sobic007G090600--Sobic002G115600
Octagon: transcription factors


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