Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G074800.1
Synonym
Functional annotation LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt A0A1B6PQQ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g13960.1 : LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G148600 - -
2 Sobic.004G196200 cytochrome P450, putative, expressed K12639: CYP724B1, cytochrome P450 family 724 subfamily B polypeptide 1
3 Sobic.005G090500 - -
4 Sobic.010G034900 expressed protein -
5 Sobic.002G345400 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
6 Sobic.005G102451 - -
7 Sobic.010G219300 DEFL27 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
8 Sobic.005G056100 - -
9 Sobic.008G064000 LTPL36 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.010G109700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
11 Sobic.009G039100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
12 Sobic.007G082900 - -
13 Sobic.001G328900 expressed protein -
14 Sobic.009G039900 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
15 Sobic.008G081000 - -
16 Sobic.006G064700 expressed protein -
17 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
18 Sobic.003G024700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
19 Sobic.007G205200 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G417900 nucleotidyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G074800 Sobic005G074800 Sobic005G148600 Sobic005G148600 Sobic005G074800--Sobic005G148600 Sobic004G196200 Sobic004G196200 Sobic005G074800--Sobic004G196200 Sobic005G090500 Sobic005G090500 Sobic005G074800--Sobic005G090500 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic005G074800--Sobic010G034900 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic005G074800--Sobic002G345400 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic005G074800--Sobic005G102451 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic005G074800--Sobic010G219300 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic005G074800--Sobic005G056100 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic005G074800--Sobic008G064000 Sobic005G148600--Sobic004G196200 Sobic005G148600--Sobic005G074800 Sobic005G148600--Sobic005G090500 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic005G148600--Sobic009G039900 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic005G148600--Sobic006G064700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic005G148600--Sobic005G153400 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic005G148600--Sobic009G039100 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic005G148600--Sobic007G082900 Sobic005G074900 Sobic005G074900 Sobic005G148600--Sobic005G074900 Sobic004G196200--Sobic005G148600 Sobic004G196200--Sobic005G074800 Sobic004G196200--Sobic007G082900 Sobic004G196200--Sobic010G219300 Sobic004G196200--Sobic009G039900 Sobic004G196200--Sobic005G090500 Sobic004G196200--Sobic005G153400 Sobic004G196200--Sobic010G034900 Sobic004G196200--Sobic005G074900 Sobic005G090500--Sobic005G074800 Sobic005G090500--Sobic005G148600 Sobic002G053100 Sobic002G053100 Sobic005G090500--Sobic002G053100 Sobic005G090500--Sobic004G196200 Sobic006G271400 Sobic006G271400 Sobic005G090500--Sobic006G271400 Sobic004G171500 Sobic004G171500 Sobic005G090500--Sobic004G171500 Sobic005G090500--Sobic006G064700 Sobic008G001700 Sobic008G001700 Sobic005G090500--Sobic008G001700 Sobic005G090500--Sobic005G074900 Sobic010G034900--Sobic008G064000 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic010G034900--Sobic003G024700 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic010G034900--Sobic001G249233 Sobic010G034900--Sobic010G219300 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic010G034900--Sobic005G174900 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic010G034900--Sobic006G062700 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic010G034900--Sobic010G148600 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic010G034900--Sobic010G109700 Sobic007G083300 Sobic007G083300 Sobic010G034900--Sobic007G083300 Sobic002G345400--Sobic005G102451 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic002G345400--Sobic001G328900 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic002G345400--Sobic007G205200 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic002G345400--Sobic001G096500 Sobic002G345400--Sobic009G039100 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic002G345400--Sobic003G303500 Sobic002G345400--Sobic005G056100 Sobic002G345400--Sobic010G109700 Sobic002G345400--Sobic005G153400 Sobic005G102451--Sobic002G345400 Sobic005G102451--Sobic005G056100 Sobic005G102451--Sobic001G096500 Sobic005G102451--Sobic010G109700 Sobic005G102451--Sobic003G303500 Sobic005G102451--Sobic007G205200 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic005G102451--Sobic008G081000 Sobic005G102451--Sobic001G328900 Sobic005G102451--Sobic009G039100 Sobic010G219300--Sobic003G024700 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic010G219300--Sobic005G187100 Sobic010G219300--Sobic010G034900 Sobic010G219300--Sobic007G082900 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic010G219300--Sobic005G153600 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic010G219300--Sobic005G225000 Sobic010G219300--Sobic010G148600 Sobic010G219300--Sobic001G096500 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic010G219300--Sobic005G199101 Sobic005G056100--Sobic010G109700 Sobic005G056100--Sobic001G096500 Sobic005G056100--Sobic008G081000 Sobic005G056100--Sobic005G102451 Sobic005G056100--Sobic001G249233 Sobic005G056100--Sobic007G205200 Sobic005G056100--Sobic006G062700 Sobic005G056100--Sobic002G345400 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic005G056100--Sobic008G088450 Sobic008G064000--Sobic010G034900 Sobic008G064000--Sobic007G083300 Sobic003G156100 Sobic003G156100 Sobic008G064000--Sobic003G156100 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic008G064000--Sobic007G070700 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic008G064000--Sobic003G247700 SobicK043500 SobicK043500 Sobic008G064000--SobicK043500 Sobic002G211700 Sobic002G211700 Sobic008G064000--Sobic002G211700 Sobic001G535900 Sobic001G535900 Sobic008G064000--Sobic001G535900 Sobic005G188000 Sobic005G188000 Sobic008G064000--Sobic005G188000
Octagon: transcription factors


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