Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G148600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PSL3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G196200 cytochrome P450, putative, expressed K12639: CYP724B1, cytochrome P450 family 724 subfamily B polypeptide 1
2 Sobic.005G074800 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
3 Sobic.005G090500 - -
4 Sobic.009G039900 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
5 Sobic.006G064700 expressed protein -
6 Sobic.005G153400 - -
7 Sobic.009G039100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
8 Sobic.007G082900 - -
9 Sobic.005G074900 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.001G328900 expressed protein -
11 Sobic.002G345400 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
12 Sobic.010G219300 DEFL27 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
13 Sobic.010G034900 expressed protein -
14 Sobic.009G051301 - -
15 Sobic.005G102451 - -
16 Sobic.007G205200 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
18 Sobic.005G056100 - -
19 Sobic.003G303500 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
20 Sobic.008G064000 LTPL36 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G148600 Sobic005G148600 Sobic004G196200 Sobic004G196200 Sobic005G148600--Sobic004G196200 Sobic005G074800 Sobic005G074800 Sobic005G148600--Sobic005G074800 Sobic005G090500 Sobic005G090500 Sobic005G148600--Sobic005G090500 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic005G148600--Sobic009G039900 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic005G148600--Sobic006G064700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic005G148600--Sobic005G153400 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic005G148600--Sobic009G039100 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic005G148600--Sobic007G082900 Sobic005G074900 Sobic005G074900 Sobic005G148600--Sobic005G074900 Sobic004G196200--Sobic005G148600 Sobic004G196200--Sobic005G074800 Sobic004G196200--Sobic007G082900 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic004G196200--Sobic010G219300 Sobic004G196200--Sobic009G039900 Sobic004G196200--Sobic005G090500 Sobic004G196200--Sobic005G153400 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic004G196200--Sobic010G034900 Sobic004G196200--Sobic005G074900 Sobic005G074800--Sobic005G148600 Sobic005G074800--Sobic004G196200 Sobic005G074800--Sobic005G090500 Sobic005G074800--Sobic010G034900 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic005G074800--Sobic002G345400 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic005G074800--Sobic005G102451 Sobic005G074800--Sobic010G219300 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic005G074800--Sobic005G056100 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic005G074800--Sobic008G064000 Sobic005G090500--Sobic005G074800 Sobic005G090500--Sobic005G148600 Sobic002G053100 Sobic002G053100 Sobic005G090500--Sobic002G053100 Sobic005G090500--Sobic004G196200 Sobic006G271400 Sobic006G271400 Sobic005G090500--Sobic006G271400 Sobic004G171500 Sobic004G171500 Sobic005G090500--Sobic004G171500 Sobic005G090500--Sobic006G064700 Sobic008G001700 Sobic008G001700 Sobic005G090500--Sobic008G001700 Sobic005G090500--Sobic005G074900 Sobic009G039900--Sobic005G153400 Sobic009G039900--Sobic006G064700 Sobic009G039900--Sobic009G039100 Sobic009G039900--Sobic005G148600 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic009G039900--Sobic001G328900 Sobic009G039900--Sobic002G345400 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic009G039900--Sobic010G195600 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic009G039900--Sobic005G051700 Sobic009G039900--Sobic004G196200 Sobic006G064700--Sobic009G039100 Sobic006G064700--Sobic009G039900 Sobic006G064700--Sobic002G345400 Sobic006G064700--Sobic001G328900 Sobic006G064700--Sobic005G102451 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic006G064700--Sobic003G303500 Sobic006G064700--Sobic005G153400 Sobic006G064700--Sobic005G148600 Sobic006G064700--Sobic010G195600 Sobic005G153400--Sobic005G051700 Sobic005G153400--Sobic001G328900 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic005G153400--Sobic005G116000 Sobic005G153400--Sobic009G039900 Sobic005G153400--Sobic010G195600 Sobic005G153400--Sobic002G345400 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic005G153400--Sobic007G205200 Sobic005G153400--Sobic009G039100 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic005G153400--Sobic005G153600 Sobic009G039100--Sobic006G064700 Sobic009G039100--Sobic002G345400 Sobic009G039100--Sobic001G328900 Sobic009G039100--Sobic005G102451 Sobic009G039100--Sobic009G039900 Sobic009G039100--Sobic003G303500 Sobic009G039100--Sobic005G153400 Sobic009G039100--Sobic010G195600 Sobic009G039100--Sobic007G205200 Sobic007G082900--Sobic010G219300 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic007G082900--Sobic005G187100 Sobic007G082900--Sobic004G196200 Sobic007G082900--Sobic010G034900 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic007G082900--Sobic003G024700 Sobic007G082900--Sobic005G153600 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic007G082900--Sobic005G225000 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic007G082900--Sobic005G199101 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic007G082900--Sobic010G153800 Sobic006G036201 Sobic006G036201 Sobic005G074900--Sobic006G036201 Sobic009G051301 Sobic009G051301 Sobic005G074900--Sobic009G051301 Sobic005G074900--Sobic005G148600 Sobic005G074900--Sobic004G196200 Sobic005G074900--Sobic005G090500 Sobic005G074900--Sobic006G271400 Sobic005G074900--Sobic005G074800 Sobic009G086800 Sobic009G086800 Sobic005G074900--Sobic009G086800 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic005G074900--Sobic006G279000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.