Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G345400.1
Synonym Sb02g036850, LCR73
Functional annotation DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt C5XC94
Pfam PF00304
Panther DB PTHR33147 PTHR33147:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02147 : low-molecular-weight cysteine-rich 73
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g07624.1 : gamma-thionin family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic002G345400--Sobic005G102451 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic002G345400--Sobic001G328900 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic002G345400--Sobic007G205200 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic002G345400--Sobic001G096500 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic002G345400--Sobic009G039100 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic002G345400--Sobic003G303500 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic002G345400--Sobic005G056100 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic002G345400--Sobic010G109700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic002G345400--Sobic005G153400 Sobic005G102451--Sobic002G345400 Sobic005G102451--Sobic005G056100 Sobic005G102451--Sobic001G096500 Sobic005G102451--Sobic010G109700 Sobic005G102451--Sobic003G303500 Sobic005G102451--Sobic007G205200 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic005G102451--Sobic008G081000 Sobic005G102451--Sobic001G328900 Sobic005G102451--Sobic009G039100 Sobic001G328900--Sobic002G345400 Sobic001G328900--Sobic007G205200 Sobic001G328900--Sobic005G153400 Sobic001G328900--Sobic009G039100 Sobic001G328900--Sobic005G102451 Sobic001G328900--Sobic001G096500 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic001G328900--Sobic005G051700 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic001G328900--Sobic005G116000 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic001G328900--Sobic006G064700 Sobic007G205200--Sobic001G096500 Sobic007G205200--Sobic002G345400 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic007G205200--Sobic005G153600 Sobic007G205200--Sobic001G328900 Sobic007G205200--Sobic005G102451 Sobic007G205200--Sobic005G056100 Sobic007G205200--Sobic010G109700 Sobic007G205200--Sobic005G116000 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic007G205200--Sobic010G219300 Sobic001G096500--Sobic007G205200 Sobic001G096500--Sobic005G056100 Sobic001G096500--Sobic010G109700 Sobic001G096500--Sobic005G153600 Sobic001G096500--Sobic005G102451 Sobic001G096500--Sobic002G345400 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic001G096500--Sobic001G249233 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic001G096500--Sobic010G148600 Sobic001G096500--Sobic001G328900 Sobic009G039100--Sobic006G064700 Sobic009G039100--Sobic002G345400 Sobic009G039100--Sobic001G328900 Sobic009G039100--Sobic005G102451 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic009G039100--Sobic009G039900 Sobic009G039100--Sobic003G303500 Sobic009G039100--Sobic005G153400 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic009G039100--Sobic010G195600 Sobic009G039100--Sobic007G205200 Sobic003G303500--Sobic005G102451 Sobic003G303500--Sobic002G345400 Sobic003G303500--Sobic008G081000 Sobic003G303500--Sobic009G039100 Sobic003G303500--Sobic005G056100 Sobic003G303500--Sobic001G328900 Sobic003G303500--Sobic010G109700 Sobic003G303500--Sobic001G096500 Sobic003G303500--Sobic007G205200 Sobic005G056100--Sobic010G109700 Sobic005G056100--Sobic001G096500 Sobic005G056100--Sobic008G081000 Sobic005G056100--Sobic005G102451 Sobic005G056100--Sobic001G249233 Sobic005G056100--Sobic007G205200 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic005G056100--Sobic006G062700 Sobic005G056100--Sobic002G345400 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic005G056100--Sobic008G088450 Sobic010G109700--Sobic005G056100 Sobic010G109700--Sobic001G096500 Sobic010G109700--Sobic001G249233 Sobic010G109700--Sobic008G081000 Sobic010G109700--Sobic005G102451 Sobic010G109700--Sobic006G062700 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic010G109700--Sobic005G174900 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic010G109700--Sobic007G025300 Sobic010G109700--Sobic008G088450 Sobic005G153400--Sobic005G051700 Sobic005G153400--Sobic001G328900 Sobic005G153400--Sobic005G116000 Sobic005G153400--Sobic009G039900 Sobic005G153400--Sobic010G195600 Sobic005G153400--Sobic002G345400 Sobic005G153400--Sobic007G205200 Sobic005G153400--Sobic009G039100 Sobic005G153400--Sobic005G153600
Octagon: transcription factors


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