Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G153600.1
Synonym
Functional annotation DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6PSP8
Pfam PF00304
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g70680.1 : DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034103
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G153600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G225000 - -
2 Sobic.007G205200 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G199101 - K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
4 Sobic.010G153800 - -
5 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
6 Sobic.010G219300 DEFL27 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
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8 Sobic.005G116000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
9 Sobic.005G187100 - -
10 Sobic.003G024700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
11 Sobic.001G249233 - -
12 Sobic.002G091800 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
13 Sobic.010G109700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
14 Sobic.001G328900 expressed protein -
15 Sobic.005G056100 - -
16 Sobic.005G140400 - -
17 Sobic.002G345400 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.002G344900 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.005G174900 - -
20 Sobic.006G062700 transferase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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