Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G148600.2
Synonym AtWRKY22, WRKY22
Functional annotation WRKY31, expressed
UniProt A0A1W0VT45
Pfam PF03106
Panther DB PTHR31282 PTHR31282:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G01250 : WRKY family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g30860.1 : WRKY31, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G080950.3 , HORVU7Hr1G080950.2 , HORVU7Hr1G080950.1 , HORVU7Hr1G080950.4
Wheat TraesCS7A02G343000 , TraesCS7D02G336400 , TraesCS7A02G343000 , TraesCS7B02G240000
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G140400 - -
2 Sobic.001G249233 - -
3 Sobic.005G174900 - -
4 Sobic.002G091800 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
5 Sobic.005G225000 - -
6 Sobic.003G024700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
7 Sobic.006G062700 transferase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G199101 - K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
9 Sobic.010G153800 - -
10 Sobic.005G153600 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
11 Sobic.010G219300 DEFL27 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
12 Sobic.002G344900 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
13 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
14 Sobic.010G034900 expressed protein -
15 Sobic.010G109700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
16 Sobic.005G187100 - -
17 Sobic.007G049400 OsFBX381 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G056100 - -
19 Sobic.007G070700 OsFBX265 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G112066 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic010G148600--Sobic005G140400 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic010G148600--Sobic001G249233 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic010G148600--Sobic005G174900 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic010G148600--Sobic002G091800 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic010G148600--Sobic005G225000 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic010G148600--Sobic003G024700 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic010G148600--Sobic006G062700 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic010G148600--Sobic005G199101 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic010G148600--Sobic010G153800 Sobic005G140400--Sobic005G174900 Sobic005G140400--Sobic002G091800 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic005G140400--Sobic007G049400 Sobic005G140400--Sobic010G148600 Sobic005G140400--Sobic001G249233 Sobic005G140400--Sobic006G062700 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic005G140400--Sobic005G112066 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic005G140400--Sobic007G070700 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic005G140400--Sobic002G077500 Sobic001G249233--Sobic005G174900 Sobic001G249233--Sobic006G062700 Sobic001G249233--Sobic010G148600 Sobic001G249233--Sobic005G140400 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic001G249233--Sobic010G109700 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic001G249233--Sobic007G025300 Sobic001G249233--Sobic003G024700 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic001G249233--Sobic005G056100 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic001G249233--Sobic008G103066 Sobic005G174900--Sobic001G249233 Sobic005G174900--Sobic006G062700 Sobic005G174900--Sobic005G140400 Sobic005G174900--Sobic007G025300 Sobic005G174900--Sobic008G103066 Sobic005G174900--Sobic010G148600 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic005G174900--Sobic001G253501 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic005G174900--Sobic009G245750 Sobic005G174900--Sobic007G070700 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic002G091800--Sobic002G344900 Sobic002G091800--Sobic005G140400 Sobic002G091800--Sobic010G148600 Sobic002G091800--Sobic005G112066 Sobic002G091800--Sobic005G199101 Sobic002G091800--Sobic010G153800 Sobic002G091800--Sobic005G225000 Sobic002G091800--Sobic002G077500 Sobic002G091800--Sobic007G049400 Sobic005G225000--Sobic005G199101 Sobic005G225000--Sobic010G153800 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic005G225000--Sobic005G153600 Sobic005G225000--Sobic010G148600 Sobic005G225000--Sobic002G091800 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic005G225000--Sobic005G187100 Sobic005G225000--Sobic002G344900 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic005G225000--Sobic010G219300 Sobic005G225000--Sobic005G140400 Sobic003G024700--Sobic010G219300 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic003G024700--Sobic010G034900 Sobic003G024700--Sobic010G148600 Sobic003G024700--Sobic001G249233 Sobic003G024700--Sobic005G174900 Sobic003G024700--Sobic006G062700 Sobic003G024700--Sobic005G140400 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic003G024700--Sobic001G096500 Sobic003G024700--Sobic010G109700 Sobic006G062700--Sobic005G174900 Sobic006G062700--Sobic001G249233 Sobic006G062700--Sobic008G103066 Sobic006G062700--Sobic007G025300 Sobic006G062700--Sobic005G140400 Sobic006G062700--Sobic010G148600 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic006G062700--Sobic001G112250 Sobic006G062700--Sobic007G070700 Sobic006G062700--Sobic010G109700 Sobic005G199101--Sobic010G153800 Sobic005G199101--Sobic005G225000 Sobic005G199101--Sobic005G187100 Sobic005G199101--Sobic002G091800 Sobic005G199101--Sobic002G344900 Sobic005G199101--Sobic005G153600 Sobic005G199101--Sobic010G148600 Sobic005G199101--Sobic005G140400 Sobic005G199101--Sobic010G219300 Sobic010G153800--Sobic005G199101 Sobic010G153800--Sobic005G225000 Sobic010G153800--Sobic005G187100 Sobic010G153800--Sobic002G091800 Sobic010G153800--Sobic002G344900 Sobic010G153800--Sobic005G153600 Sobic010G153800--Sobic010G148600 Sobic010G153800--Sobic005G140400 Sobic010G153800--Sobic010G219300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.