Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G091800.1
Synonym NRT1.5, Sb02g007605
Functional annotation peptide transporter PTR2, putative, expressed
UniProt A0A1B6QA48
Pfam PF07690
Panther DB PTHR11654 PTHR11654:SF90
NCBI CDD KOG1237; H+/oligopeptide symporter
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane GO:0016020membrane GO:0006810transport GO:0005215transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G32450 : nitrate transporter 1.5
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g48570.1 : peptide transporter PTR2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045511
Brachypodium PNT78399 , PNT78398
Barley HORVU4Hr1G090310.22 , HORVU4Hr1G090310.23
Wheat TraesCS5A02G546200 , TraesCS4B02G380000 , TraesCSU02G130200
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G344900 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.005G140400 - -
3 Sobic.010G148600 WRKY31, expressed -
4 Sobic.005G112066 - -
5 Sobic.005G199101 - K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
6 Sobic.010G153800 - -
7 Sobic.005G225000 - -
8 Sobic.002G077500 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
9 Sobic.007G049400 OsFBX381 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G326000 expressed protein -
11 Sobic.005G174900 - -
12 Sobic.009G186400 SSA1 - 2S albumin seed storage family protein precursor, expressed -
13 Sobic.007G156300 similar to Abscisic acid 8'-hydroxylase 2(PubMedID : 29862293)@cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.005G187100 - -
15 Sobic.001G249233 - -
16 Sobic.006G031600 expressed protein -
17 Sobic.005G223200 - -
18 Sobic.003G024700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
19 Sobic.006G062700 transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G070700 OsFBX265 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic002G091800--Sobic002G344900 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic002G091800--Sobic005G140400 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic002G091800--Sobic010G148600 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic002G091800--Sobic005G112066 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic002G091800--Sobic005G199101 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic002G091800--Sobic010G153800 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic002G091800--Sobic005G225000 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic002G091800--Sobic002G077500 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic002G091800--Sobic007G049400 Sobic002G344900--Sobic002G091800 Sobic002G344900--Sobic010G153800 Sobic002G344900--Sobic005G199101 Sobic002G344900--Sobic005G112066 Sobic001G326000 Sobic001G326000 Sobic002G344900--Sobic001G326000 Sobic002G344900--Sobic005G140400 Sobic002G344900--Sobic005G225000 Sobic007G156300 Sobic007G156300 Sobic002G344900--Sobic007G156300 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic002G344900--Sobic005G223200 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic005G140400--Sobic005G174900 Sobic005G140400--Sobic002G091800 Sobic005G140400--Sobic007G049400 Sobic005G140400--Sobic010G148600 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic005G140400--Sobic001G249233 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic005G140400--Sobic006G062700 Sobic005G140400--Sobic005G112066 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic005G140400--Sobic007G070700 Sobic005G140400--Sobic002G077500 Sobic010G148600--Sobic005G140400 Sobic010G148600--Sobic001G249233 Sobic010G148600--Sobic005G174900 Sobic010G148600--Sobic002G091800 Sobic010G148600--Sobic005G225000 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic010G148600--Sobic003G024700 Sobic010G148600--Sobic006G062700 Sobic010G148600--Sobic005G199101 Sobic010G148600--Sobic010G153800 Sobic005G112066--Sobic002G077500 Sobic005G112066--Sobic007G049400 Sobic005G112066--Sobic001G326000 Sobic005G112066--Sobic005G140400 Sobic005G112066--Sobic002G091800 Sobic009G186400 Sobic009G186400 Sobic005G112066--Sobic009G186400 Sobic005G112066--Sobic007G156300 Sobic005G112066--Sobic002G344900 Sobic006G031600 Sobic006G031600 Sobic005G112066--Sobic006G031600 Sobic005G199101--Sobic010G153800 Sobic005G199101--Sobic005G225000 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic005G199101--Sobic005G187100 Sobic005G199101--Sobic002G091800 Sobic005G199101--Sobic002G344900 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic005G199101--Sobic005G153600 Sobic005G199101--Sobic010G148600 Sobic005G199101--Sobic005G140400 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic005G199101--Sobic010G219300 Sobic010G153800--Sobic005G199101 Sobic010G153800--Sobic005G225000 Sobic010G153800--Sobic005G187100 Sobic010G153800--Sobic002G091800 Sobic010G153800--Sobic002G344900 Sobic010G153800--Sobic005G153600 Sobic010G153800--Sobic010G148600 Sobic010G153800--Sobic005G140400 Sobic010G153800--Sobic010G219300 Sobic005G225000--Sobic005G199101 Sobic005G225000--Sobic010G153800 Sobic005G225000--Sobic005G153600 Sobic005G225000--Sobic010G148600 Sobic005G225000--Sobic002G091800 Sobic005G225000--Sobic005G187100 Sobic005G225000--Sobic002G344900 Sobic005G225000--Sobic010G219300 Sobic005G225000--Sobic005G140400 Sobic002G077500--Sobic009G186400 Sobic002G077500--Sobic005G112066 Sobic002G077500--Sobic001G326000 Sobic002G077500--Sobic007G049400 Sobic003G105600 Sobic003G105600 Sobic002G077500--Sobic003G105600 Sobic007G083300 Sobic007G083300 Sobic002G077500--Sobic007G083300 SobicK043500 SobicK043500 Sobic002G077500--SobicK043500 Sobic002G077500--Sobic005G140400 Sobic002G077500--Sobic007G070700 Sobic007G049400--Sobic005G112066 Sobic007G049400--Sobic002G077500 Sobic002G077600 Sobic002G077600 Sobic007G049400--Sobic002G077600 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic007G049400--Sobic001G253501 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic007G049400--Sobic009G245750 Sobic007G049400--Sobic005G140400 Sobic007G049400--Sobic007G070700 Sobic007G049400--Sobic007G083300 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic007G049400--Sobic001G112250
Octagon: transcription factors


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