Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G344900.1
Synonym BPM1, Sb02g036820, ATBPM1
Functional annotation MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt C5XBQ7
Pfam PF00917 PF00651
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF154
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19000 : BTB-POZ and MATH domain 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g13030.1 : MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G110670.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G091800 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
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20 Sobic.004G313800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic002G344900--Sobic002G091800 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic002G344900--Sobic010G153800 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic002G344900--Sobic005G199101 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic002G344900--Sobic005G112066 Sobic001G326000 Sobic001G326000 Sobic002G344900--Sobic001G326000 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic002G344900--Sobic005G140400 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic002G344900--Sobic005G225000 Sobic007G156300 Sobic007G156300 Sobic002G344900--Sobic007G156300 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic002G344900--Sobic005G223200 Sobic002G091800--Sobic002G344900 Sobic002G091800--Sobic005G140400 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic002G091800--Sobic010G148600 Sobic002G091800--Sobic005G112066 Sobic002G091800--Sobic005G199101 Sobic002G091800--Sobic010G153800 Sobic002G091800--Sobic005G225000 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic002G091800--Sobic002G077500 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic002G091800--Sobic007G049400 Sobic010G153800--Sobic005G199101 Sobic010G153800--Sobic005G225000 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic010G153800--Sobic005G187100 Sobic010G153800--Sobic002G091800 Sobic010G153800--Sobic002G344900 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic010G153800--Sobic005G153600 Sobic010G153800--Sobic010G148600 Sobic010G153800--Sobic005G140400 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic010G153800--Sobic010G219300 Sobic005G199101--Sobic010G153800 Sobic005G199101--Sobic005G225000 Sobic005G199101--Sobic005G187100 Sobic005G199101--Sobic002G091800 Sobic005G199101--Sobic002G344900 Sobic005G199101--Sobic005G153600 Sobic005G199101--Sobic010G148600 Sobic005G199101--Sobic005G140400 Sobic005G199101--Sobic010G219300 Sobic005G112066--Sobic002G077500 Sobic005G112066--Sobic007G049400 Sobic005G112066--Sobic001G326000 Sobic005G112066--Sobic005G140400 Sobic005G112066--Sobic002G091800 Sobic009G186400 Sobic009G186400 Sobic005G112066--Sobic009G186400 Sobic005G112066--Sobic007G156300 Sobic005G112066--Sobic002G344900 Sobic006G031600 Sobic006G031600 Sobic005G112066--Sobic006G031600 Sobic001G326000--Sobic002G077500 Sobic001G326000--Sobic007G156300 Sobic001G326000--Sobic005G112066 Sobic001G326000--Sobic009G186400 Sobic003G105600 Sobic003G105600 Sobic001G326000--Sobic003G105600 Sobic001G326000--Sobic006G031600 Sobic004G313800 Sobic004G313800 Sobic001G326000--Sobic004G313800 Sobic001G326000--Sobic005G223200 Sobic001G326000--Sobic002G344900 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic005G140400--Sobic005G174900 Sobic005G140400--Sobic002G091800 Sobic005G140400--Sobic007G049400 Sobic005G140400--Sobic010G148600 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic005G140400--Sobic001G249233 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic005G140400--Sobic006G062700 Sobic005G140400--Sobic005G112066 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic005G140400--Sobic007G070700 Sobic005G140400--Sobic002G077500 Sobic005G225000--Sobic005G199101 Sobic005G225000--Sobic010G153800 Sobic005G225000--Sobic005G153600 Sobic005G225000--Sobic010G148600 Sobic005G225000--Sobic002G091800 Sobic005G225000--Sobic005G187100 Sobic005G225000--Sobic002G344900 Sobic005G225000--Sobic010G219300 Sobic005G225000--Sobic005G140400 Sobic007G156300--Sobic006G031600 Sobic007G156300--Sobic001G326000 Sobic007G156300--Sobic005G223200 Sobic007G156300--Sobic004G313800 Sobic003G392500 Sobic003G392500 Sobic007G156300--Sobic003G392500 Sobic007G156300--Sobic005G112066 Sobic007G156300--Sobic002G077500 Sobic010G142300 Sobic010G142300 Sobic007G156300--Sobic010G142300 Sobic009G009900 Sobic009G009900 Sobic007G156300--Sobic009G009900 Sobic005G223200--Sobic010G142300 Sobic005G223200--Sobic004G313800 Sobic005G223200--Sobic006G031600 Sobic006G034275 Sobic006G034275 Sobic005G223200--Sobic006G034275 Sobic005G223200--Sobic007G156300 Sobic005G223200--Sobic003G392500 Sobic005G223200--Sobic009G009900 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic005G223200--Sobic009G010000 Sobic006G154300 Sobic006G154300 Sobic005G223200--Sobic006G154300
Octagon: transcription factors


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