Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G178500.1
Synonym Sb09g023870
Functional annotation "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence." (PubMedID : 27586543)
LTPL67 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt C5YZX4
Pfam PF14368
Panther DB PTHR33044 PTHR33044:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G43720 : Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g41030.1 : LTPL67 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039802 , Zm00025a044058
Brachypodium KQK05680
Barley HORVU1Hr1G068830.4 , HORVU1Hr1G068830.1 , HORVU1Hr1G068830.2 , HORVU1Hr1G068830.3 , HORVU0Hr1G025850.4 , HORVU0Hr1G025850.5 , HORVU0Hr1G025850.2 , HORVU0Hr1G025850.3
Wheat TraesCS1B02G316700 , TraesCS1A02G306000 , TraesCS1A02G306000 , TraesCS1D02G305700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G178500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G275400 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
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6 Sobic.008G141900 ZOS12-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.001G485500 - -
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9 Sobic.002G286632 - -
10 Sobic.001G053350 - -
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16 Sobic.002G383700 4-alpha-glucanotransferase, chloroplast precursor, putative, expressed K00705: 4-alpha-glucanotransferase
17 Sobic.001G376501 - -
18 Sobic.005G034200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G036901 - -
20 Sobic.003G183466 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G178500 Sobic009G178500 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic009G178500--Sobic003G275400 Sobic004G215200 Sobic004G215200 Sobic009G178500--Sobic004G215200 Sobic003G326500 Sobic003G326500 Sobic009G178500--Sobic003G326500 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic009G178500--Sobic009G168200 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic009G178500--Sobic009G163400 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic009G178500--Sobic008G141900 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic009G178500--Sobic001G485500 Sobic003G379900 Sobic003G379900 Sobic009G178500--Sobic003G379900 Sobic002G286632 Sobic002G286632 Sobic009G178500--Sobic002G286632 Sobic003G275400--Sobic009G168200 Sobic003G275400--Sobic009G163400 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic003G275400--Sobic001G376501 Sobic002G064800 Sobic002G064800 Sobic003G275400--Sobic002G064800 Sobic003G275400--Sobic008G141900 Sobic008G191700 Sobic008G191700 Sobic003G275400--Sobic008G191700 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic003G275400--Sobic008G121501 Sobic003G275400--Sobic001G485500 Sobic005G206100 Sobic005G206100 Sobic003G275400--Sobic005G206100 Sobic001G053350 Sobic001G053350 Sobic004G215200--Sobic001G053350 Sobic010G062900 Sobic010G062900 Sobic004G215200--Sobic010G062900 Sobic006G208200 Sobic006G208200 Sobic004G215200--Sobic006G208200 Sobic004G215200--Sobic001G485500 Sobic001G499500 Sobic001G499500 Sobic004G215200--Sobic001G499500 Sobic004G215200--Sobic009G163400 Sobic002G309100 Sobic002G309100 Sobic004G215200--Sobic002G309100 Sobic007G086600 Sobic007G086600 Sobic004G215200--Sobic007G086600 Sobic010G252100 Sobic010G252100 Sobic004G215200--Sobic010G252100 Sobic003G183466 Sobic003G183466 Sobic003G326500--Sobic003G183466 Sobic003G326500--Sobic009G178500 Sobic002G095300 Sobic002G095300 Sobic003G326500--Sobic002G095300 Sobic003G326500--Sobic008G141900 Sobic007G082000 Sobic007G082000 Sobic003G326500--Sobic007G082000 Sobic002G383700 Sobic002G383700 Sobic003G326500--Sobic002G383700 Sobic004G291200 Sobic004G291200 Sobic003G326500--Sobic004G291200 Sobic003G326500--Sobic002G286632 Sobic003G045450 Sobic003G045450 Sobic003G326500--Sobic003G045450 Sobic009G168200--Sobic003G275400 Sobic009G168200--Sobic008G141900 Sobic009G168200--Sobic009G163400 Sobic009G168200--Sobic001G376501 Sobic009G168200--Sobic002G286632 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic009G168200--Sobic001G010500 Sobic006G081700 Sobic006G081700 Sobic009G168200--Sobic006G081700 Sobic009G168200--Sobic002G064800 Sobic005G212201 Sobic005G212201 Sobic009G168200--Sobic005G212201 Sobic009G163400--Sobic001G376501 Sobic009G163400--Sobic008G141900 Sobic009G163400--Sobic001G010500 Sobic009G163400--Sobic008G121501 Sobic009G163400--Sobic002G309100 Sobic009G163400--Sobic002G064800 Sobic001G257650 Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic001G257650 Sobic009G163400--Sobic003G275400 Sobic009G163400--Sobic009G168200 Sobic008G141900--Sobic009G163400 Sobic008G141900--Sobic001G376501 Sobic008G141900--Sobic002G064800 Sobic008G141900--Sobic005G212201 Sobic008G141900--Sobic009G168200 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic004G276000 Sobic008G141900--Sobic001G010500 Sobic008G141900--Sobic003G275400 Sobic008G141900--Sobic001G257650 Sobic001G485500--Sobic001G053350 Sobic001G485500--Sobic004G215200 Sobic001G485500--Sobic003G275400 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic001G485500--Sobic010G255400 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic001G485500--Sobic010G036901 Sobic001G485500--Sobic009G168200 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic001G485500--Sobic005G201200 Sobic001G485500--Sobic009G163400 Sobic001G485500--Sobic010G062900 Sobic002G238800 Sobic002G238800 Sobic003G379900--Sobic002G238800 Sobic002G420400 Sobic002G420400 Sobic003G379900--Sobic002G420400 Sobic005G034200 Sobic005G034200 Sobic003G379900--Sobic005G034200 Sobic010G087100 Sobic010G087100 Sobic003G379900--Sobic010G087100 Sobic003G042200 Sobic003G042200 Sobic003G379900--Sobic003G042200 Sobic004G339900 Sobic004G339900 Sobic003G379900--Sobic004G339900 Sobic001G081800 Sobic001G081800 Sobic003G379900--Sobic001G081800 Sobic006G184200 Sobic006G184200 Sobic003G379900--Sobic006G184200 Sobic005G036200 Sobic005G036200 Sobic003G379900--Sobic005G036200 Sobic002G286632--Sobic009G168200 Sobic002G286632--Sobic006G081700 Sobic002G286632--Sobic009G163400 Sobic002G286632--Sobic005G034200 Sobic002G286632--Sobic008G141900 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic002G286632--Sobic003G005500 Sobic002G286632--Sobic001G010500 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic002G286632--Sobic002G173400 Sobic008G180200 Sobic008G180200 Sobic002G286632--Sobic008G180200
Octagon: transcription factors


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