Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G181050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt H0I4F1 , Q09EJ6 , A0A1Z5R8C0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G170740 - -
2 Sobic.002G028000 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
3 Sobic.008G064250 - -
4 Sobic.005G116250 - -
5 Sobic.002G016250 - -
6 Sobic.005G165632 - -
7 Sobic.005G215100 - -
8 Sobic.009G218100 transcription initiation factor IIB, putative, expressed K03124: TFIIB, GTF2B, SUA7, transcription initiation factor TFIIB
9 Sobic.003G101200 paired amphipathic helix repeat-containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G342000 bet v I allergen family protein, putative, expressed K14496: abscisic acid receptor PYR/PYL family
11 Sobic.004G196600 expressed protein -
12 Sobic.001G233900 expressed protein -
13 Sobic.008G113350 - -
14 Sobic.005G088600 - -
15 Sobic.005G083160 - -
16 Sobic.004G037300 cycloartenol synthase, putative, expressed -
17 Sobic.002G360900 GASR9 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
18 Sobic.001G413850 - -
19 Sobic.010G107300 - -
20 Sobic.008G088881 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G181050 Sobic008G181050 Sobic002G170740 Sobic002G170740 Sobic008G181050--Sobic002G170740 Sobic002G028000 Sobic002G028000 Sobic008G181050--Sobic002G028000 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic008G181050--Sobic008G064250 Sobic005G116250 Sobic005G116250 Sobic008G181050--Sobic005G116250 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic008G181050--Sobic002G016250 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic008G181050--Sobic005G165632 Sobic005G215100 Sobic005G215100 Sobic008G181050--Sobic005G215100 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic008G181050--Sobic009G218100 Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic008G181050--Sobic003G101200 Sobic002G170740--Sobic008G181050 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic002G170740--Sobic005G083160 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic002G170740--Sobic008G088881 Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic002G170740--Sobic001G233900 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic002G170740--Sobic010G107300 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic002G170740--Sobic005G226150 Sobic002G360900 Sobic002G360900 Sobic002G170740--Sobic002G360900 Sobic007G108000 Sobic007G108000 Sobic002G170740--Sobic007G108000 Sobic010G022600 Sobic010G022600 Sobic002G170740--Sobic010G022600 Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic002G028000--Sobic004G196600 Sobic002G028000--Sobic005G116250 Sobic002G028000--Sobic008G181050 Sobic001G185100 Sobic001G185100 Sobic002G028000--Sobic001G185100 Sobic002G028000--Sobic002G170740 Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic002G028000--Sobic008G043800 Sobic002G028000--Sobic005G215100 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic002G028000--Sobic010G133100 Sobic001G396050 Sobic001G396050 Sobic002G028000--Sobic001G396050 Sobic008G064250--Sobic002G016250 Sobic008G064250--Sobic005G165632 Sobic003G342000 Sobic003G342000 Sobic008G064250--Sobic003G342000 Sobic008G064250--Sobic009G218100 Sobic008G113350 Sobic008G113350 Sobic008G064250--Sobic008G113350 Sobic004G037300 Sobic004G037300 Sobic008G064250--Sobic004G037300 Sobic008G064250--Sobic005G083160 Sobic008G064250--Sobic001G233900 Sobic008G064250--Sobic010G107300 Sobic005G116250--Sobic004G196600 Sobic005G088600 Sobic005G088600 Sobic005G116250--Sobic005G088600 Sobic005G116250--Sobic002G028000 Sobic005G116250--Sobic001G185100 Sobic005G116250--Sobic001G396050 Sobic009G041200 Sobic009G041200 Sobic005G116250--Sobic009G041200 Sobic005G116250--Sobic008G181050 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic005G116250--Sobic003G255000 Sobic005G116250--Sobic002G170740 Sobic002G016250--Sobic005G165632 Sobic002G016250--Sobic008G064250 Sobic002G016250--Sobic003G342000 Sobic002G016250--Sobic008G113350 Sobic002G016250--Sobic009G218100 Sobic002G016250--Sobic004G037300 Sobic003G389400 Sobic003G389400 Sobic002G016250--Sobic003G389400 Sobic002G016250--Sobic005G083160 Sobic003G027700 Sobic003G027700 Sobic002G016250--Sobic003G027700 Sobic005G165632--Sobic008G113350 Sobic005G165632--Sobic002G016250 Sobic005G165632--Sobic008G064250 Sobic005G165632--Sobic009G218100 Sobic005G165632--Sobic003G342000 Sobic002G254250 Sobic002G254250 Sobic005G165632--Sobic002G254250 Sobic005G165632--Sobic003G027700 Sobic005G165632--Sobic005G083160 Sobic005G165632--Sobic003G101200 Sobic001G261529 Sobic001G261529 Sobic005G215100--Sobic001G261529 Sobic005G215100--Sobic002G028000 Sobic005G083280 Sobic005G083280 Sobic005G215100--Sobic005G083280 Sobic005G215100--Sobic002G170740 Sobic003G092600 Sobic003G092600 Sobic005G215100--Sobic003G092600 Sobic001G509100 Sobic001G509100 Sobic005G215100--Sobic001G509100 Sobic002G015800 Sobic002G015800 Sobic005G215100--Sobic002G015800 Sobic004G322901 Sobic004G322901 Sobic005G215100--Sobic004G322901 Sobic002G266600 Sobic002G266600 Sobic005G215100--Sobic002G266600 Sobic009G218100--Sobic005G083160 Sobic009G218100--Sobic008G064250 Sobic009G218100--Sobic005G165632 Sobic009G218100--Sobic002G016250 Sobic009G218100--Sobic010G107300 Sobic009G218100--Sobic003G342000 Sobic009G218100--Sobic003G101200 Sobic009G218100--Sobic008G113350 Sobic009G218100--Sobic002G360900 Sobic003G101200--Sobic005G083160 Sobic003G101200--Sobic010G107300 Sobic003G101200--Sobic009G218100 Sobic003G101200--Sobic002G015800 Sobic003G101200--Sobic001G509100 Sobic002G099866 Sobic002G099866 Sobic003G101200--Sobic002G099866 Sobic004G262100 Sobic004G262100 Sobic003G101200--Sobic004G262100 Sobic003G101200--Sobic002G360900 Sobic003G101200--Sobic010G022600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.