Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G028000.1
Synonym Sb02g002495
Functional annotation LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt C5X8V5
Pfam PF00234
Panther DB PTHR34481 PTHR34481:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g12080.1 : LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G196600 expressed protein -
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14 Sobic.009G041200 expressed protein -
15 Sobic.005G002350 - -
16 Sobic.001G445300 - -
17 Sobic.004G135600 - -
18 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
19 Sobic.002G029200 - -
20 Sobic.003G331800 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G028000 Sobic002G028000 Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic002G028000--Sobic004G196600 Sobic005G116250 Sobic005G116250 Sobic002G028000--Sobic005G116250 Sobic008G181050 Sobic008G181050 Sobic002G028000--Sobic008G181050 Sobic001G185100 Sobic001G185100 Sobic002G028000--Sobic001G185100 Sobic002G170740 Sobic002G170740 Sobic002G028000--Sobic002G170740 Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic002G028000--Sobic008G043800 Sobic005G215100 Sobic005G215100 Sobic002G028000--Sobic005G215100 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic002G028000--Sobic010G133100 Sobic001G396050 Sobic001G396050 Sobic002G028000--Sobic001G396050 Sobic004G196600--Sobic005G116250 Sobic004G196600--Sobic002G028000 Sobic004G196600--Sobic001G185100 Sobic005G088600 Sobic005G088600 Sobic004G196600--Sobic005G088600 Sobic004G196600--Sobic008G043800 Sobic004G196600--Sobic001G396050 Sobic004G196600--Sobic002G170740 Sobic004G058800 Sobic004G058800 Sobic004G196600--Sobic004G058800 Sobic004G196600--Sobic010G133100 Sobic005G116250--Sobic004G196600 Sobic005G116250--Sobic005G088600 Sobic005G116250--Sobic002G028000 Sobic005G116250--Sobic001G185100 Sobic005G116250--Sobic001G396050 Sobic009G041200 Sobic009G041200 Sobic005G116250--Sobic009G041200 Sobic005G116250--Sobic008G181050 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic005G116250--Sobic003G255000 Sobic005G116250--Sobic002G170740 Sobic008G181050--Sobic002G170740 Sobic008G181050--Sobic002G028000 Sobic008G064250 Sobic008G064250 Sobic008G181050--Sobic008G064250 Sobic008G181050--Sobic005G116250 Sobic002G016250 Sobic002G016250 Sobic008G181050--Sobic002G016250 Sobic005G165632 Sobic005G165632 Sobic008G181050--Sobic005G165632 Sobic008G181050--Sobic005G215100 Sobic009G218100 Sobic009G218100 Sobic008G181050--Sobic009G218100 Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic008G181050--Sobic003G101200 Sobic001G185100--Sobic004G196600 Sobic001G185100--Sobic005G116250 Sobic001G185100--Sobic002G028000 Sobic001G185100--Sobic001G396050 Sobic001G185100--Sobic008G043800 Sobic001G185100--Sobic005G088600 Sobic001G185100--Sobic010G133100 Sobic003G029350 Sobic003G029350 Sobic001G185100--Sobic003G029350 Sobic001G185100--Sobic003G255000 Sobic002G170740--Sobic008G181050 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic002G170740--Sobic005G083160 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic002G170740--Sobic008G088881 Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic002G170740--Sobic001G233900 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic002G170740--Sobic010G107300 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic002G170740--Sobic005G226150 Sobic002G360900 Sobic002G360900 Sobic002G170740--Sobic002G360900 Sobic007G108000 Sobic007G108000 Sobic002G170740--Sobic007G108000 Sobic010G022600 Sobic010G022600 Sobic002G170740--Sobic010G022600 Sobic008G043800--Sobic004G058800 Sobic001G445300 Sobic001G445300 Sobic008G043800--Sobic001G445300 Sobic007G055300 Sobic007G055300 Sobic008G043800--Sobic007G055300 Sobic010G058000 Sobic010G058000 Sobic008G043800--Sobic010G058000 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic008G043800--Sobic003G207100 Sobic008G043800--Sobic004G196600 Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic008G043800--Sobic003G207600 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic008G043800--Sobic003G321500 Sobic008G043800--Sobic002G028000 Sobic001G261529 Sobic001G261529 Sobic005G215100--Sobic001G261529 Sobic005G215100--Sobic002G028000 Sobic005G083280 Sobic005G083280 Sobic005G215100--Sobic005G083280 Sobic005G215100--Sobic002G170740 Sobic003G092600 Sobic003G092600 Sobic005G215100--Sobic003G092600 Sobic001G509100 Sobic001G509100 Sobic005G215100--Sobic001G509100 Sobic002G015800 Sobic002G015800 Sobic005G215100--Sobic002G015800 Sobic004G322901 Sobic004G322901 Sobic005G215100--Sobic004G322901 Sobic002G266600 Sobic002G266600 Sobic005G215100--Sobic002G266600 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic010G133100--Sobic003G063801 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic010G133100--Sobic002G064100 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic010G133100--Sobic008G043000 Sobic004G135600 Sobic004G135600 Sobic010G133100--Sobic004G135600 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic010G133100--Sobic009G225250 Sobic010G133100--Sobic004G196600 Sobic010G133100--Sobic003G255000 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic010G133100--Sobic002G392550 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic010G133100--Sobic002G250700 Sobic001G396050--Sobic005G116250 Sobic001G396050--Sobic004G196600 Sobic001G396050--Sobic001G185100 Sobic001G396050--Sobic005G088600 Sobic001G396050--Sobic002G028000 Sobic001G396050--Sobic003G255000 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic001G396050--Sobic005G002350 Sobic001G396050--Sobic002G392550 Sobic001G396050--Sobic010G133100
Octagon: transcription factors


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