Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G031000.1
Synonym
Functional annotation MYB family transcription factor, putative, expressed
UniProt A0A1B6PJT8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G52250 : Duplicated homeodomain-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g03550.1 : MYB family transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011964 , Zm00025a011969
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G166800 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G010300 - -
3 Sobic.006G117300 Os4bglu12 - beta-glucosidase, exo-beta-glucanase, expressed K01188: beta-glucosidase
4 Sobic.002G101200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10638: UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1
5 Sobic.002G267700 bZIP family transcription factor, putative, expressed -
6 Sobic.009G139500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
7 Sobic.005G032500 ASH-like SPRY domain containing protein, putative, expressed K14964: Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2
8 Sobic.001G392900 - -
9 Sobic.002G053100 RNA recognition motif containing protein, expressed -
10 Sobic.010G209300 expressed protein -
11 Sobic.002G089500 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
12 Sobic.006G271400 methyl-CpG binding domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G058000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
14 Sobic.002G217000 expressed protein -
15 Sobic.005G075000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.007G037200 expressed protein -
17 Sobic.008G031400 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
18 Sobic.007G040000 - -
19 Sobic.005G021100 - -
20 Sobic.002G100000 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G031000 Sobic006G031000 Sobic002G166800 Sobic002G166800 Sobic006G031000--Sobic002G166800 Sobic010G010300 Sobic010G010300 Sobic006G031000--Sobic010G010300 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic006G031000--Sobic006G117300 Sobic002G101200 Sobic002G101200 Sobic006G031000--Sobic002G101200 Sobic002G267700 Sobic002G267700 Sobic006G031000--Sobic002G267700 Sobic009G139500 Sobic009G139500 Sobic006G031000--Sobic009G139500 Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic006G031000--Sobic005G032500 Sobic001G392900 Sobic001G392900 Sobic006G031000--Sobic001G392900 Sobic002G053100 Sobic002G053100 Sobic006G031000--Sobic002G053100 Sobic002G166800--Sobic005G032500 Sobic002G166800--Sobic006G031000 Sobic002G100000 Sobic002G100000 Sobic002G166800--Sobic002G100000 Sobic002G166800--Sobic002G101200 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic002G166800--Sobic002G217000 Sobic007G037200 Sobic007G037200 Sobic002G166800--Sobic007G037200 Sobic005G089101 Sobic005G089101 Sobic002G166800--Sobic005G089101 Sobic010G181900 Sobic010G181900 Sobic002G166800--Sobic010G181900 Sobic002G166800--Sobic001G392900 Sobic010G010300--Sobic006G031000 Sobic010G010300--Sobic009G139500 Sobic010G010300--Sobic006G117300 Sobic010G010300--Sobic002G267700 Sobic005G153500 Sobic005G153500 Sobic010G010300--Sobic005G153500 Sobic005G075000 Sobic005G075000 Sobic010G010300--Sobic005G075000 Sobic010G010300--Sobic002G101200 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic010G010300--Sobic007G040000 Sobic005G033600 Sobic005G033600 Sobic010G010300--Sobic005G033600 Sobic006G117300--Sobic007G040000 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic006G117300--Sobic003G321500 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic006G117300--Sobic009G090250 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic006G117300--Sobic005G174500 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic006G117300--Sobic001G246400 Sobic006G117300--Sobic006G031000 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic006G117300--Sobic001G270600 Sobic006G117300--Sobic002G267700 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic006G117300--Sobic002G089500 Sobic002G101200--Sobic002G217000 Sobic002G101200--Sobic005G032500 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic002G101200--Sobic002G058900 Sobic002G101200--Sobic007G037200 Sobic002G101200--Sobic002G166800 Sobic002G101200--Sobic002G100000 Sobic003G225800 Sobic003G225800 Sobic002G101200--Sobic003G225800 Sobic002G101200--Sobic006G031000 Sobic009G051201 Sobic009G051201 Sobic002G101200--Sobic009G051201 Sobic002G267700--Sobic005G033600 Sobic006G070830 Sobic006G070830 Sobic002G267700--Sobic006G070830 Sobic008G031400 Sobic008G031400 Sobic002G267700--Sobic008G031400 Sobic002G267700--Sobic006G031000 Sobic002G267700--Sobic005G174500 Sobic002G267700--Sobic002G089500 Sobic002G267700--Sobic005G032500 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic002G267700--Sobic003G091500 Sobic002G267700--Sobic006G117300 Sobic009G139500--Sobic010G010300 Sobic009G139500--Sobic005G033600 Sobic003G076400 Sobic003G076400 Sobic009G139500--Sobic003G076400 Sobic009G139500--Sobic002G058900 Sobic009G139500--Sobic002G267700 Sobic009G139500--Sobic002G101200 Sobic009G139500--Sobic006G031000 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic009G139500--Sobic002G015400 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic009G139500--Sobic008G159300 Sobic005G032500--Sobic007G037200 Sobic005G032500--Sobic002G100000 Sobic005G032500--Sobic008G031400 Sobic005G032500--Sobic002G058900 Sobic005G032500--Sobic008G159300 Sobic005G032500--Sobic002G217000 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic005G032500--Sobic004G220900 Sobic005G032500--Sobic002G101200 Sobic004G212350 Sobic004G212350 Sobic005G032500--Sobic004G212350 Sobic005G021100 Sobic005G021100 Sobic001G392900--Sobic005G021100 Sobic001G392900--Sobic002G089500 Sobic008G168400 Sobic008G168400 Sobic001G392900--Sobic008G168400 Sobic002G381600 Sobic002G381600 Sobic001G392900--Sobic002G381600 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic001G392900--Sobic001G129900 Sobic006G104800 Sobic006G104800 Sobic001G392900--Sobic006G104800 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic001G392900--Sobic009G052400 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic001G392900--Sobic004G171600 Sobic003G063900 Sobic003G063900 Sobic001G392900--Sobic003G063900 Sobic002G053100--Sobic006G104800 Sobic001G142600 Sobic001G142600 Sobic002G053100--Sobic001G142600 Sobic002G053100--Sobic001G392900 Sobic002G053100--Sobic003G063900 Sobic005G090500 Sobic005G090500 Sobic002G053100--Sobic005G090500 Sobic010G102900 Sobic010G102900 Sobic002G053100--Sobic010G102900 Sobic003G227800 Sobic003G227800 Sobic002G053100--Sobic003G227800 Sobic008G071900 Sobic008G071900 Sobic002G053100--Sobic008G071900 Sobic002G053100--Sobic008G168400
Octagon: transcription factors


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